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“一个与烟草TMV抗性基因N紧密连锁的共显性SSR标记”研究揭示，1对SSR引物TM508-007扩增出的标记与TMV抗性的N基因紧密连锁，该标记稳定可靠，可用于烟草抗TMV分子标记辅助选择。该成果发表在《中国烟草学报》2017年第2期上。
滇皖产区铁皮石斛居群SSR分子身份证的构建
铁皮石斛 基因组SSR 分子身份证830002
2017/11/30
建立滇皖产区铁皮石斛SSR指纹图谱，并构建不同居群的SSR分子身份证。方法：使用生物信息学方法分析铁皮石斛（Dendrobium officinale）全基因组SSR（Simple sequence repeat）序列，获得SSR位点，使用Primer Premier 5.0软件设计引物并进行PCR扩增，选择高多态性引物进行遗传多样性分析并建立SSR指纹图谱代码，使用二维码生成器表述铁皮石斛居群的...
利用RNA seq技术对中华蜜蜂（Apis cerana cerana，简称中蜂）幼虫肠道参考转录组进行de novo组装，并进行功能及代谢通路注释，进而利用该转录组数据进行中蜂幼虫的SSR分子标记鉴定。【方法】实验室条件下饲养中蜂幼虫，将纯化的蜜蜂球囊菌（Ascosphaera apis，简称球囊菌）孢子饲喂3日龄幼虫，剖取4、5和6日龄幼虫肠道，液氮速冻。将健康幼虫肠道与感染球囊菌的幼虫肠道同...
一个与烟草TMV抗性基因N紧密连锁的共显性SSR标记
烟草 烟草花叶病 分离集团分组分析法 共显性SSR标记
2018/6/6
烟草普通花叶病（Tobacco Mosaic Virus，TMV）是烟叶生产的主要病害，为建立烟草抗TMV分子标记辅助选择体系，本研究以高抗TMV烤烟品种Coker176和易感TMV烤烟品种Y3以及它们的BC1F1群体为试材，采用分离集团分组分析法（Bulked Segregation Analysis，BSA）和简单序列重复（Simple Sequence Repeat，SSR）标记技术，筛选与...
利用16对SSR和10对SCoT引物对99个菊花品种的基因组变异进行扫描，分析其群体结构，并采用一般线性模型GLM和混合线性模型MLM方法对10个表型性状进行关联分析。供试群体Shannon’s 指数为 1.46 ~ 2.52。群体遗传结构分析将99个菊品种划分为5个亚群。GLM分析发现有8个SSR位点与7个表型性状相关联（P < 0.01），其中与3个花部性状（花序直径、花序高度、舌花宽度）相关...
苜蓿在育种过程中,由于其异花授粉特性和骨干亲本的集中使用,导致品种间的遗传差异日益缩小,品种之间通过形态学鉴定愈加困难。通过构建苜蓿DUS测试标准品种DNA指纹图谱数据库,可以实现苜蓿品种的快速、准确鉴定。本研究利用筛选得到的10个SSR标记对33个苜蓿DUS测试标准品种进行指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,10对SSR引物共扩增出69个等位基因,平均每个标记可产生6.9个等位基因;多态性比...
基于荧光检测技术的多花黑麦草EST-SSR指纹图谱的构建
多花黑麦草 EST-SSR分子标记 指纹图谱 荧光检测 毛细管电泳
2017/11/24
构建基于EST-SSR荧光标记的多花黑麦草（Lolium multiflorum Lam.）DNA指纹鉴定体系，为多花黑麦草品种鉴定提供高通量技术手段，为不同品种的合理应用提供参考依据，有效保护农民利益和育种权益。【方法】利用表型性状差异大的3个品种（特高Tetragold、长江2号ChangjiangNo.2和阿伯德Aubade），通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从200对EST-SSR引物中筛选出扩增条...
中国玉米审定品种标准SSR指纹库的构建
玉米 品种鉴定 DNA指纹库 SSR
2017/11/24
对数量庞大的已知玉米品种构建可共享的作物品种标准DNA指纹库。【方法】基于荧光毛细管电泳检测平台和植物品种DNA指纹库管理系统，利用筛选的40对SSR核心引物对3 998份中国玉米审定品种标准样品进行建库，通过多实验室、多检测平台进行建库数据的质量评估。【结果】绘制了40个玉米建库引物的等位基因频率分布图作为每个引物的特征图谱，在建库试验中发挥了相当于参照样品的作用。形成了一套十重荧光毛细管电泳组...
以中国古老月季品种‘月月粉’（Rosa chinensis‘Old Blush’，用OB表示）为母本，‘无刺光叶蔷薇’（Rosa wichuriana‘Basye’s Thornless’，用W表示）为父本，构建F1代共296个单株。从146对SSR标记中筛选出亲本间多态性好且条带清晰的23对SSR标记，对随机选择的94株F1进行杂种鉴定和遗传分析。结果表明：筛选到3个纯合显性标记分别为Fv512...
【目的】通过RNA seq技术对纯培养的蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis孢子和球囊菌侵染的蜜蜂幼虫肠道组织进行测序，de novo组装球囊菌的参考转录组，并对其进行功能与代谢通路注释，进而基于该转录组数据开发球囊菌的SSR分子标记。【方法】首先通过差速离心获得活化的球囊菌孢子，配制含1×107孢子/mL的饲料饲喂4，5和6日龄的意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica幼...
吉林省新育成大豆品种SSR指纹图谱身份证的构建
大豆 SSR 指纹图谱身份证
2016/12/15
为快速鉴定和准确评价大豆新品种，以吉林省98个大豆品种为材料，从大豆20个连锁群上均匀分布的320对SSR标记引物中初筛出12对扩增稳定、条带清晰、多态性高的引物，为以最少引物组合有效区分品种，揭示参试材料间丰富的遗传多样性，又进一步依据每对引物多样性指数的高低，复筛出了由7个SSR标记构成的核心引物组合，并最终以此构建吉林省近年育成大豆品种的SSR指纹图谱身份证。结果表明：98个参试大豆品种都有...
科研人员通过进行“烤烟种质资源SSR核心引物的筛选及验证”研究，从分布于烟草24条连锁群上的2317对SSR引物中筛选出24对核心引物，经验证，适用于烤烟种质资源鉴定和遗传多样性分析。该结果于10月28日发表在《中国烟草科学》2016年第5期上。
新疆野扁桃TP-M13-SSR的引物开发研究
毛细管电泳荧光检测 多态性 全基因组重测序
2017/11/13
该试验自主设计新疆野扁桃TP-M13-SSR引物，从中筛选多态性最佳的引物以供后续研究使用。从该植物的5个居群中分别挑选2份叶片提取基因组DNA，扩增后的产物使用毛细管电泳荧光检测并分析。经分析可得出12对新疆野扁桃TP-M13-SSR引物的期望杂合值(He)、观测杂合值(Ho)、等位基因数目(Na)、香农指数(I)、固定指数(F)、多态性信息含量指数(PIC)的范围分别为0.656~0.859、...
100个小麦品种资源抗条锈性鉴定及重要抗条锈病基因的SSR检测
小麦条锈病 抗病性鉴定 Yr基因 SSR分子标记
2017/10/26
了解小麦品种资源对中国条锈菌生理小种的抗病性水平及其所含重要抗条锈病基因, 可为合理种植和利用小麦品种提供理论依据。选用中国小麦条锈菌不同生理小种CYR17、CYR32、CYR33和V26及条锈菌混合小种分别对100个小麦品种资源进行苗期和成株期抗条锈性鉴定, 并采用SSR分子标记技术检测重要抗条锈病基因Yr5、Yr10、Yr15、Yr18、Yr24和Yr26。结果表明, 在苗期对4个生理小种均表...