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利用SSR标记评价抗胞囊线虫野生大豆种质的遗传多样性
野生大豆 遗传多样性 大豆胞囊线虫 SSR标记
2015/11/11
大豆胞囊线虫病是大豆生产上的主要病害之一，给大豆生产造成巨大损失。利用分布在大豆20个连锁群的49个SSR分子标记分析了25份抗胞囊线虫病野生大豆种质的遗传多样性及其与8份国内外常用栽培大豆抗源间的遗传关系。供试的25份抗病野生大豆种质具有较高的遗传多样性，在49个SSR位点上共鉴定出516个SSR等位变异，其中稀有等位变异232个；平均有效基因数为6.93，期望杂合度为0.833 5。利用STR...
An EST-SSR marker, bu099658, and its potential use in breeding for yellow rust resistance in wheat
Bulk Segregant Analysis (BSA) Marker-Assisted Selection (MAS) Puccinia striiformis f.sp. tritici Triticum aestivum L. Yr1
2014/3/31
EST-SSR markers, derived from the A and B genomes of wheat were used to identify molecular markers associated with yellow rust resistance. For this purpose, bulk segregant analysis was performed using...
南方红豆杉转录组SSR挖掘及分子标记的研究
红豆杉 转录本 引物 SSR
2014/6/13
利用Trinity软件对NCBI公共数据库中公布的南方红豆杉（Taxus chinensis var. mairei）根、茎和叶的转录数据进行转录组的重新拼接。通过对13 737 528条序列组装得到96 279条Unigenes（38 Mb），通过SSR检测程序从96 279条Unigenes中得到2 160个SSR位点（2.24%），其平均发生率为1/18.01 kb，基序长度为14 ~ 25...
大豆种质对花叶病毒病和疫霉根腐病抗病性的SSR标记辅助鉴定
大豆花叶病毒病 大豆疫霉根腐病 抗病性 SSR标记鉴定
2015/11/11
通过与花叶病毒病（soybean mosaic virus,SMV）抗性相关的SSR标记Satt114对30份大豆种质进行分子辅助鉴定，共发现10个抗SMV的种质，经摩擦接种法表型验证其中9个种质表现为抗病，即分子辅助鉴定的准确性为90%。另外，利用与疫霉根腐病(phytophthora root rot，PRR)相关的SSR标记Satt325、Satt343、Satt428、Satt005、Sa...
大豆花叶病毒病和疫霉根腐病抗性的SSR标记辅助鉴定
大豆花叶病毒病 大豆疫霉根腐病 抗病性 SSR标记鉴定
2015/11/10
采用抗花叶病毒病品种东农93046、抗疫霉根腐病品种Conrad、耐疫霉根腐病品种合丰25和高产品种东农L5两两杂交后再复交衍生的146个F2:5重组自交系，利用与大豆花叶病毒病抗性基因相关的SSR标记Satt114，与大豆疫霉根腐病抗性相关的分子标记Satt325、Satt343、Satt428、Satt005、Satt600、Satt611、Satt689、Satt579、Satt252、S...
棉花品种遗传纯度的SSR分子标记鉴定技术研究
棉花品种 SSR 非纯位点 遗传纯度
2014/4/1
为建立适合于SSR标记的棉花品种纯度鉴定方法，利用78个SSR标记对12个棉花常规品种进行标记基因型分析。通过比较不同品种不同单株标记基因型，发现棉花品种的非纯SSR位点存在3种主要类型。通过综合分析非纯SSR位点率和异型单株率对品种遗传纯度的影响，建立了利用SSR标记在分子水平上鉴定棉花品种纯度的方法。利用该方法鉴定的12个棉花品种中有3个品种（C5、C9和C11）的遗传纯度在98%以上，非纯S...
甜瓜种质资源遗传多样性的SSR分析
甜瓜 遗传多样性 SSR
2018/6/28
利用SSR分子标记技术对72份甜瓜种质资源及育种材料进行DNA指纹分类及亲缘关系研究，20对SSR引物共扩增产生76个多态性位点，平均每对引物产生3.8个多态性位点。聚类结果将72份甜瓜种质资源分为7个类群，其中类群I包括新疆本地资源及几乎全部自育甜瓜种质资源64份材料，这说明本试验所选用的新疆厚皮甜瓜种质资源遗传背景比较狭窄。
柑橘10 个品种实生后代多倍体的发掘及SSR 鉴定
柑橘 多倍体 SSR分子标记
2014/4/9
秋季采摘柑橘成熟果实并剥取种子，将小粒种籽和瘪籽播于MT 培养基，待萌发长出2 ~ 3片真叶时，取其叶片检测倍性；将饱满种籽播种于露地，对其幼苗首先通过形态筛选获得似多倍体的植株，然后取其叶片用流式细胞仪进行倍性检测；最后对获得的多倍体植株进行SSR 分子鉴定。试验结果表明，获得早金甜橙、卡特夏橙、塔罗科血橙、日辉橘、Ortanique 橘橙、默科特橘橙、华农本地早橘、朱红橘和Flame 葡萄柚等...
以10 份大白菜杂交种及其亲本为研究对象，基于NCBI 基因组数据库中EST 序列信息，应用SSR 标记及高分辨 率溶解曲线技术筛选出用于大白菜杂交种纯度鉴 定的SNP 位点及复合 SSR 位 点，并根据 高通量分子检测技术 种子纯度鉴定的需要 ，对单粒种子育苗条件、单株植株提取 状态、快速DNA提取方法、复合PCR 体系的建立等关键 技术进行了摸索及优化。结果显示：经过48 h 破壳状态的单粒种...
7个棉花品种SSR位点纯合度研究与分析
棉花常规种 SSR标记 纯度 位点纯合率
2014/4/1
采用52对核心引物对7个棉花常规种进行了SSR分析。结果显示：每个品种的24个受检单粒棉种中，杂粒数最多为9个，最少1个，平均为3.9个；DNA位点纯合率最高为100%，最低92.3%，平均为97.0%。研究表明，品种纯度与DNA位点纯合率呈高度正相关。采用SSR标记进行分子检测，能准确区分因遗传因素与生产加工对品种纯度造成的影响。
亚洲棉种质资源的SSR遗传多样性分析
亚洲棉 遗传多样性 SSR标记
2014/4/1
对我国棉花中期库保存的200份不同地理来源的亚洲棉代表性样本进行了SSR遗传多样性分析，结果表明：亚洲棉分子水平的遗传多样性较高。83个多态性位点共检测到368个等位基因变异，其中多态性的等位基因数为329个，平均每个SSR位点3.964个。位点多态性信息量（PIC）变幅为0.010～0.882，平均0.578，PIC值大于0.7的标记有33个（占39.8%）。基因多样性（H′）变幅为0.031～...
7个棉花品种SSR位点纯合度研究与分析
棉花常规种 SSR标记 纯度 位点纯合率
2013/8/2
采用52对核心引物对7个棉花常规种进行了SSR分析。结果显示：每个品种的24个受检单粒棉种中，杂粒数最多为9个，最少1个，平均为3.9个；DNA位点纯合率最高为100%，最低92.3%，平均为97.0%。研究表明，品种纯度与DNA位点纯合率呈高度正相关。采用SSR标记进行分子检测，能准确区分因遗传因素与生产加工对品种纯度造成的影响。
亚洲棉种质资源的SSR遗传多样性分析
亚洲棉 遗传多样性 SSR标记
2013/8/2
对我国棉花中期库保存的200份不同地理来源的亚洲棉代表性样本进行了SSR遗传多样性分析，结果表明：亚洲棉分子水平的遗传多样性较高。83个多态性位点共检测到368个等位基因变异，其中多态性的等位基因数为329个，平均每个SSR位点3.964个。位点多态性信息量（PIC）变幅为0.010～0.882，平均0.578，PIC值大于0.7的标记有33个（占39.8%）。基因多样性（H′）变幅为0.031～...
适用于SSR分析的半粒水稻干种子DNA快速提取
水稻 半粒干种子 基因组DNA提取 SSR
2014/3/25
为了寻找操作简便、耗时短、成本低,适用于简单重复序列(SSR)分析的水稻基因组DNA快速提取方法,以水稻沈农265的半粒干种子为材料,采用SDS提取液进行一步裂解,并将RNA去除操作融入抽提过程,SDS浓度为0.5%(W/V),水浴10min,氯仿/异戊醇抽提,简单快速地获得了高质量水稻基因组DNA。经琼脂糖凝胶电泳检测,DNA纯度较高,完整性较好,能够满足SSR扩增模板的需求。该方法可大大缩短水...