搜索结果: 1-9 共查到“观赏园艺学 SSR”相关记录9条 . 查询时间(0.264 秒)
以226个建兰品种为材料，应用16对SSR荧光引物进行扩增，基于等位基因最大法，按照93.36%、83.19%、71.68%、64.16%、54.42%、47.35%、32.30%、23.45%、17.26%、12.39%和8.41%等11个压缩比例逐步聚类，形成备选种质。结果表明，16对SSR荧光引物共检测到135个等位基因，平均观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’s基因多样...
三色堇转录组SSR分析及分子标记开发
三色堇 EST-SSR 系统聚类
2019/6/5
为解决三色堇（Viola × wittrockiana）缺乏共显性DNA标记的问题，利用MISA软件对其转录组测序获得的167 576条unigene进行筛选，共检测出23 791个SSR位点，出现频率为14.20%，平均分布距离为6.75 kb。SSR位点中主导类型为三核苷酸重复，占总SSR的28.31%；其次是二核苷酸重复，占总SSR的12.86%。AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸与三...
基于万寿菊转录组测序的SSR标记开发
万寿菊 SSR 转录组
2018/4/3
万寿菊（Tagetes erecta L.）花蕾转录组测序共获得48 953条Unigene，利用MISA软件检测出20 666个SSR位点，分布于13 849条Unigene中，出现频率为28.29%，平均分布距离为2.51 kb。优势重复基序为三核苷酸、四核苷酸，分别占总SSR位点的50.16%和20.94%。ATG/ATG和AAAC/GTTT分别是三核苷酸、四核苷酸的优势重复基元，占总SSR...
利用16对SSR和10对SCoT引物对99个菊花品种的基因组变异进行扫描，分析其群体结构，并采用一般线性模型GLM和混合线性模型MLM方法对10个表型性状进行关联分析。供试群体Shannon’s 指数为 1.46 ~ 2.52。群体遗传结构分析将99个菊品种划分为5个亚群。GLM分析发现有8个SSR位点与7个表型性状相关联（P < 0.01），其中与3个花部性状（花序直径、花序高度、舌花宽度）相关...
以中国古老月季品种‘月月粉’（Rosa chinensis‘Old Blush’，用OB表示）为母本，‘无刺光叶蔷薇’（Rosa wichuriana‘Basye’s Thornless’，用W表示）为父本，构建F1代共296个单株。从146对SSR标记中筛选出亲本间多态性好且条带清晰的23对SSR标记，对随机选择的94株F1进行杂种鉴定和遗传分析。结果表明：筛选到3个纯合显性标记分别为Fv512...
南方红豆杉转录组SSR挖掘及分子标记的研究
红豆杉 转录本 引物 SSR
2014/6/13
利用Trinity软件对NCBI公共数据库中公布的南方红豆杉（Taxus chinensis var. mairei）根、茎和叶的转录数据进行转录组的重新拼接。通过对13 737 528条序列组装得到96 279条Unigenes（38 Mb），通过SSR检测程序从96 279条Unigenes中得到2 160个SSR位点（2.24%），其平均发生率为1/18.01 kb，基序长度为14 ~ 25...
龙牙百合DNA 的提取及I SSR- PCR 体系的建立
龙牙百合 DNA 提取 ISSR- PCR
2009/6/26
[ 目的] 研究龙牙百合总DNA 的提取方法, 建立优化的ISSR-PCR 反应体系和程序, 为种质资源研究奠定基础。[ 方法] 利用改良
的CTAB 法提取龙牙百合基因组DNA, 并对影响ISSR 扩增反应的各因素进行优化。[ 结果] 获得了高质量的龙牙百合基因组DNA; 优化
的龙牙百合ISSR-PCR 反应体系为,25 μl 体系中含60 ng 模板DNA,0 .4 μmol/ L I...
基于EST信息的百合SSR标记的建立
百合 EST SSR 引物设计
2009/2/10
依据已知的百合EST（expressed sequence tags）序列信息,开发新的SSR(simple sequence repeats)标记,在NCBI的EST数据库1 688 EST中检索到98条含有101个SSR的序列, SSR的检出率为5.98%，其中三核苷酸重复类型占主导地位，出现频率为2.84%。EST-SSR的重复基元共搜索到47种，其中三核苷酸重复基元类型最为丰富，大约占重复...