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基于CRISPR的基因编辑工具在疾病治疗等领域拥有重要的应用前景。目前广泛使用的Cas9和Cas12a因分子尺寸较大（超过1000个氨基酸）难以被腺相关病毒（AAV）载体高效递送，限制了其的应用。为此，研究人员积极寻找更小的CRISPR效应核酸酶，其中最紧凑的一类微型核酸酶Cas12f因其较小的分子量(400-700个氨基酸)和较高的编辑活性备受关注。然而大多数Cas12f1仅识别富T的PAM序列...
Genome-wide analyses of PAM-relaxed Cas9 genome editors reveal substantial off-target effects by ABE8e in rice
AM-relaxed Cas9 nucleases cytosine base editor adenine base editor off-target effect whole-genome sequencing genome editing rice
2023/7/20
PAM-relaxed Cas9 nucleases, cytosine base editors and adenine base editors are promising tools for precise genome editing in plants. However, their genome-wide off-target effects are largely unexplore...
江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室基因编辑团队在Plant Biotechnology Journal发布论文，系统评估了PAM松弛型CRISPR-Cas9植物基因组编辑工具的脱靶效应，提示ABE8e存在高比例脱靶
CRISPR-Cas9 基因编辑 水稻 脱靶效应
2023/8/9
CRISPR-Cas9基因编辑工具凭借其高效、易用、灵活特性极大的改变了传统育种手段，研究人员为了扩大其靶向范围，设计了一系列SpCas9变体，包xCas9（识别5′-NG-3′、5′-GAA-3′、5′-GAT-3′ PAM）、SpCas9-NGv1和SpCas9-NG（识别5′-NG-3′ PAM）以及PAM-less SpRY然而，这些PAM-relaxed Cas9核酸酶是否会造成向导RN...
近日，北京农林科学院玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室基因组编辑团队在The Crop Journal（IF=3.179，中科院Q1期刊）上发表题为“Highly efficient CRISPR-SaKKH tools for plant multiplexcytosine base editing”的研究论文，建立了基于金黄色葡萄球菌Cas9变体SaKKH实现多重靶点编辑的胞嘧啶碱基编辑...
以丙烯酰胺（AM）为单体，壳聚糖（CS）与氧化石墨烯（GO）为功能组分，N,N'-亚甲基双丙烯酰胺（MBA）为交联剂，通过自由基聚合法制备PAM/CS/GO水凝胶。采用傅里叶变换红外（FT-IR）光谱、X射线衍射（XRD）仪、扫描电镜（SEM）和万能试验机对水凝胶的结构与性能进行测试与表征。利用石英晶体微天平（QCM）研究该水凝胶薄膜在不同湿度条件下的吸湿行为。实验结果表明：相对于PAM/CS水凝...
哈尔滨工业大学生命学院黄志伟教授团队发文揭示C2c1-sgRNA复合物严谨型识别PAM-DNA底物的分子机制 （图）
哈尔滨工业大学生命学院 黄志伟教授团队 C2c1-sgRNA复合物严谨型识别PAM-DNA底物的分子机制
2017/4/7
哈工大报讯（王计/文）2017年4月4日，哈尔滨工业大学生命学院黄志伟教授团队在《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表题目为《C2c1-sgRNA复合物严谨型识别PAM序列的结构基础》（《Structural basis of stringent PAM recognition by CRISPR-C2c1 in complex with sgRNA》）的研究论文。
为探讨PAM(聚丙烯酰胺)和草类根系对侵蚀劣地土壤的改良效果,试验以该环境的紫色土为研究对象,设置了空白对照(CK)以及单施PAM、单植草类、“狗牙根+PAM”、“三叶草+PAM”4个试验处理类别,6个月后测定了土壤微团聚体组成,分析了土壤微团聚体分布、结构及分形特征。结果表明,1)各试验处理的大粒径微团聚体含量增加,小粒径的则减少;2)各试验处理的MWSSA(平均重量比表面积)、分散系数和分散率...
聚丙烯酰胺(PAM)是一种高效土壤改良剂,能影响土壤入渗、产流及溶质迁移、淋失.通过人工模拟降雨试验,研究了5°、15°和25° 3个坡度水平下PAM对黄土高原沟壑区黑垆土坡地土壤侵蚀及氮磷流失情况的影响.结果显示:施加PAM后增加了5°和15°坡面的总产流量却减少了25°坡面的总产流量;PAM组初始产沙量较大,8 min以后,施加PAM组与对照组产沙速率出现差异并开始降低,表明施用PAM的起作用...
针对高阶部分响应连续相位调制(CPM)信号盲定时同步中存在定时精度较低以及容易出现假锁等问题,该文从脉冲幅度调制(PAM)分解的角度出发,设计了一种新的适用于高阶部分响应CPM信号的定时同步器结构,并在此基础上结合基于马尔科夫链模型的定时假锁检测方法,提出了一种适用于高阶部分响应CPM信号的盲定时同步算法.该算法通过对CPM信号的PAM脉冲进行优化处理,有效减少了匹配滤波器以及网格状态的数目,同时...
本研究旨在通过慢病毒载体系统将猪源CD163转染入永生化的猪肺泡巨噬细胞（PAM）系(CRL-2843)，建立稳定表达CD163的PAM细胞系（PAM-CD163）及验证该细胞系对PRRSV的易感性。用PCR方法从pJET1.2-CD163载体上扩增CD163基因编码区，通过酶切连接构建慢病毒表达载体pTrip-CMV-CD163-IRES-pur。将该质粒与慢病毒包装质粒psPAX2和pMD2....
本试验通过研究免疫复合物影响猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）在巨噬细胞内增殖的因素，来进一步探讨免疫复合物经FcγR介导的PRRSV感染机制。本研究将含200 TCID50 PRRSV病毒液与等体积的终浓度为1.30 mg·mL－1的猪IgG-兔抗猪IgG复合物分别先后和同时接种于PAM细胞，分别于12、24、36、48 h收集细胞液，同时设PRRSV感染对照组、免疫复合物对照组和健康细胞对照...
秸秆-膨润土-PAM改良材料对砂质土壤饱和导水率的影响
秸秆 砂 土壤 秸秆-膨润土-PAM改良材料
2011/6/14
为改善砂质土壤持水状况，设计了由作物秸秆、膨润土和聚丙烯酰胺（PAM）配制的改良材料，以重庆市分布面积较大的冷沙黄泥为研究对象，采用恒定水头入渗双环法，研究了秸秆改良材料对砂质土壤饱和导水率的影响。结果表明，施用秸秆改良材料能增加砂质土壤的饱和导水率，并且随着施用剂量的增大，土壤饱和导水率逐渐增加；随土培时间的延长土样饱和导水率均出现了先增大后减小的趋势，当土培时间为60 d时土样饱和导水率达到最...
选择3种分子量（12×106，15×106和18×106 Da）和3种水解度（7%，20%和35%）聚丙烯酰胺（PAM），测试PAM特性对土壤入渗和侵蚀的影响。结果表明，3种不同分子量PAM均能明显提高土壤入渗，与对照相比，稳定入渗率分别增加了58.9%、92.2%和83.3%。中分子量和高分子量PAM处理增加入渗效果明显大于低分子量处理，但前两者之间差异不显著。同样不同分子量PAM处理可显著降低...
Demonstration of 11-Gb/s, 20-km Reach WDM PON using Directly-Modulated RSOA with 4-ary PAM Signal
Fiber optics links subsystems Semiconductor optical amplifiers
2015/6/10
We demonstrate the error-free transmission of 11-Gb/s 4-ary PAM signal obtained by using a directly modulated RSOA over 20 km of SMF for the cost-effective realization of high-speed WDM PONs.