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中科院上海分院Cell Chem Biol | 线粒体ClpP激动剂干预蛋白质稳态抗胰腺癌取得新进展（图）
Cell Chem Biol | 线粒体 ClpP激动剂干预 蛋白质 胰腺癌
2022/12/17
2022年9月15日，中科院上海药物研究所、国科大杭州高等研究院化学生物学研究中心杨财广课题组在Cell Chemical Biology上发表了题为“Aberrant human ClpP activation disturbs mitochondrial proteome homeostasis to suppress pancreatic ductal adenocarcinoma”的研究论...
研究发现相分离介导精子发育过程中蛋白质翻译激活重要机制（图）
相分离介导 精子发育 蛋白质 翻译激活
2022/8/31
2022年8月12日凌晨，《科学》（Science）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）刘默芳研究组与国内外多家实验室合作完成的以LLPS of FXR1 drives spermiogenesis by activating translation of stored mRNAs为题的研究论文。该研究报道了RNA结合蛋白FXR1可通过液-液相分离激活小鼠后期...
中国科大用深度学习实现高实验成功率的蛋白质序列从头设计（图）
蛋白质序列 氨基酸序列
2022/11/15
中国科学技术大学生命科学与医学部刘海燕教授、陈泉副教授团队与信息科学技术学院李厚强教授团队合作,开发了一种基于深度学习为给定主链结构从头设计氨基酸序列的算法ABACUS-R，在实验验证中，ABACUS-R的设计成功率和设计精度超过了原有统计能量模型ABACUS。相关成果以“Rotamer-Free Protein Sequence Design Based on Deep Learning and...
2022年7月4日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所司龙龙课题组，在国际学术期刊Nature Biotechnology上发表了题为“Generation of a live attenuated influenza A vaccine by proteolysis targeting”的研究成果。该团队以流感病毒为模式病毒，建立了蛋白降解靶向病毒作为减毒疫苗的技术（Proteolys...
研究构建家犬全脑蛋白质组时空表达图谱（图）
家犬 全脑蛋白质组 时空表达图谱
2022/9/13
经过三万多年的家养驯化，家犬形成了特有的、高超的跨物种社会认知功能，是人类忠诚的朋友，也被认为是理想的神经精神疾病研究模型。6月20日，中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员张永清团队、杜茁团队、汪迎春团队联合中科院数学与系统科学研究院研究员李雷，以及昆明动物所研究员王国栋和中科院院士、昆明动物所研究员张亚平团队在Molecular & Cellular Proteomics上，在线发表了题为Co...
经过三万多年的家养驯化，家犬形成了特有的、高超的跨物种社会认知功能，是当今人类最忠诚的朋友，也被认为是理想的神经精神疾病研究模型。2022年6月20日，中国科学院遗传与发育生物学研究所张永清研究员团队、杜茁研究员团队、汪迎春研究员团队联合中科院数学与系统科学研究院李雷研究员，以及昆明动物所王国栋研究员和张亚平院士团队在蛋白质组学领域主流专业期刊Molecular & Cellular Proteo...
基因表达调控发生在转录、mRNA前体加工修饰、mRNA稳定性和mRNA翻译水平等水平上。RNA转录后调控事件包括加帽、剪切、表观修饰、多聚腺苷酸化和加尾等。转录后调控在植物非生物胁迫中扮演着重要的角色。干旱胁迫是最常见的自然灾害，然而，干旱下木本植物次生木质部中表观转录和蛋白层面响应的分子机制探究较为缺乏。
蛋白质别构调控模式预测取得新进展（图）
蛋白质别构调控 弹性网络模型 线性响应理论 AlloType
2022/5/10
蛋白质别构调控是一种由远处位点的扰动引起体系状态及功能变化的现象。别构调节在许多生物学过程中起着关键作用，例如G蛋白偶联受体、转录因子和激酶等都是典型的别构调控蛋白。生物系统利用别构作用可以快速地上调或下调靶蛋白活性，因此可以有针对性地设计别构药物来激活或抑制所需的蛋白质功能。由于别构药物具有更高的特异性和较少的副作用，已成为药物研发的一个关注热点。虽然已经发展了不少别构位点预测方法，但别构化合物...
国家卫健委肿瘤蛋白质组学重点实验室
肿瘤蛋白质组学 重点实验室 肿瘤
2022/5/17
国家卫健委（卫生部）肿瘤蛋白质组学重点实验室由陈主初教授领衔组建于2003年12月，是国内首个部级蛋白质组学重点实验室。结构生物学与药物设计湖南工程实验室由陈主初教授领衔组建于2011年5月。抗癌药物国家地方联合工程实验室是在上述两个实验室的基础上，于2012年11月正式获国家发展改革委员会批准建立，首任主任为实验室创始人陈主初教授。现任主任由陈永恒教授担任。
天津市蛋白质科学重点实验室
天津市蛋白质科学重点实验室 蛋白质
2022/5/13
天津市蛋白质科学重点实验室正式成立于2007年9月，实验室依托于南开大学生命科学学院，并由南开大学和天津市共同资助组建。实验室主要根据国家和天津市经济与科技发展战略目标，结合结构生物学、细胞生物学和分子生物学等方法，开展蛋白质结构与功能相关的基础研究，通过蛋白质的结构等信息解决生命科学基本问题，并致力于揭示人类重大疾病的致病基理和有效药靶，同时尝试开发治疗疾病的新药 。本实验室的优势在于人才队伍优...
北京大学物理学院凝聚态物理与材料物理研究所、人工微结构和介观物理国家重点实验室、国家生物医学成像科学中心、北大-清华生命科学联合中心、定量生物学中心毛有东教授团队利用自主研发的深度学习高精度四维重建技术，发展并应用时间分辨冷冻电镜，阐明了原子水平人源蛋白酶体动力学调控和构象重编程机制。2022年4月27日，相关研究成果以“时间分辨冷冻电镜解析人源蛋白酶体在USP14调控下的变构”（USP14-re...
2022年4月20日，Science Advances在线发表了华中农业大学湖北洪山实验室和作物遗传改良国家重点实验室蛋白质科学研究团队联合北京大学邓兴旺教授课题组的研究论文“Structural insight into UV-B–activated UVR8 bound to COP1”。该研究揭示了植物紫外光UV-B受体UVR8结合光形态建成核心抑制因子COP1-SPAs复合物并与该复合物的...
中国科大建立新的蛋白质从头设计方法（图）
蛋白质 神经网络 三维结构
2022/11/17
中国科学技术大学刘海燕教授、陈泉副教授团队采用数据驱动策略，开辟出一条全新的蛋白质从头设计路线，相关成果以“用于蛋白质设计的以主链为中心的神经网络能量函数”为题于北京时间2022年2月10日发表于Nature。
分子水平的蛋白质识别在疾病的早期诊断和治疗中具有重要的意义。一般来说，蛋白质可以通过质谱和免疫分析等手段进行鉴定。随着研究的深入，人们对蛋白质的分析已从对一级序列的研究延伸到通过观测蛋白质结构的变化来理解蛋白质的功能。然而，低丰度的蛋白质病理变化很可能被宏观手段所获得蛋白质集成信息所掩盖，无法捕捉到单个蛋白质的异常结构特征。目前开发一种能够识别不同的蛋白质，并区分由配体/药物结合和融合等过程引起的...
谷歌DeepMind团队研发的阿尔法折叠2（AlphaFold2）使用最新的人工智能算法对蛋白质结构实现了接近实验精度的精准预测。复旦大学复杂体系多尺度研究院教授马剑鹏团队与上海人工智能实验室合作，近日在国际知名刊物《生物信息学简报》上发表论文，显示其蛋白质侧链预测算法（OPUS-Rota4算法）精度显著超越了谷歌团队的阿尔法折叠算法。