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胃癌基因芯片测序与异常基因差异表达
胃癌 可变剪接 基因差异表达 基因芯片
2021/2/24
通过对胃癌样本基因的富集分析，探索其中 RNA 可变剪接的变化情况及相关分子机制。方法 回顾性收集中国人民解放军总医院的 3 例胃癌患者的癌组织及其癌旁组织的病理样本，进行蛋白定量标记、基因芯片检测、高通量测序等以获取数据；通过 DAVID 等网络软件对样本做 GO 富集和 KEGG 通路分析，得出筛选出的基因的差异可变剪接相关信息。
通过生物信息学的方法分析无/轻度肺气肿与严重肺气肿患者的差异基因。从基因表达数据库（GEO）下载无/轻度肺气肿与严重肺气肿患者的肺组织芯片数据GSE1650，通过t检验获得差异基因。然后使用DAVID数据库对差异表达基因进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。再利用STRING数据库对差异表达基因进行蛋白相互作用网络（PPI）分析，并选出关键基因。
研究 c-Met 基因下调后对结直肠癌侵袭和转移的影响机制。方法 在 SW480 细胞中敲低 c-Met 基因，通过基因芯片筛选差异基因，对差异基因进行功能聚类分析，通过 IPA 分析细胞信号通路和相关的差异基因相互作用网络以及相关基因与上游调控分子间的作用关系。选取被抑制的信号通路中的相关基因进行 qPCR 验证。
探讨基因芯片法与线性探针法检测痰标本中结核分枝杆菌（MTB）的应用价值。方法 海南医学院第二附属医院2018年3-7月门诊和住院的106例疑似肺结核患者纳入研究，采用基因芯片法、线性探针法对患者送检的痰进行检测，并与改良罗氏培养法进行比较；以比例法药敏试验为金标准，分析上述两种方法检测利福平和异烟肼耐药性的效能。
探讨基因芯片检测技术对分枝杆菌菌种鉴定和结核分枝杆菌耐药性检测的临床应用价值。方法 收集云南省传染病专科医院2012年9月至2017年12月收治的患者阳性培养标本及抗酸染色阳性标本378例，用基因芯片检测系统分别进行分枝杆菌菌种鉴定、结核分枝杆菌的利福平和异烟肼耐药性检测。
基因芯片法快速检测脊柱结核临床分离株SM、EMB、LVFX、AMK、CPM耐药
基因芯片 脊柱结核 耐药
2014/7/30
制备一种用于检测链霉素（streptomycin, SM）、乙胺丁醇（ethambutol, EMB）、左氧氟沙星(levofloxacin, LVFX)、阿米卡星(amikacin, AMK)、卷曲霉素（capreomycin, CMP）耐药基因的新型微阵列芯片，测试其快速检测脊柱结核临床分离株耐药的效果。 方法 根据SM、EMB、LVFX、AMK、CPM 5种药物的常见...
基因芯片筛选CD133+/CD133-肺腺癌细胞中新的耐药基因
CD133 肺肿瘤 耐药 肿瘤耐药基因芯片
2014/7/11
瘤干细胞可能是肿瘤多药耐药的主要原因，CD133是目前较为公认的肿瘤干细胞标记物。本研究旨在应用功能分类基因芯片筛选CD133+和CD133-肺腺癌细胞中差异表达的肿瘤耐药基因，寻求新的肺癌耐药相关基因。方法 免疫磁珠分选法分选A549细胞，采用功能分类基因芯片筛选CD133+和CD133-肺腺癌细胞中差异表达的肿瘤耐药基因，并使用RT-qPCR验证。顺铂半数有效抑制浓度（half inhibit...
基因芯片技术在胃癌研究领域中的应用及进展
基因芯片技术 胃肿瘤 进展
2014/2/25
胃癌是我国最常见的恶性肿瘤之一。近些年，关于胃癌致瘤机制的研究有了长足进展，但是其发病率及死亡率仍居高不下，原因是对胃癌的发生及发展仍然存在诸多疑惑，缺乏对胃癌研究的有效手段，尤其是在探索胃癌发病机制及胃癌早期预警方面。基因芯片技术是分子生物学领域开展较为成熟的技术之一，因其高通量、快速、高灵敏性受到关注，尤其在胃癌易感基因、胃癌侵袭及转移研究领域的应用展现出令人鼓舞的前景。目前，基因芯片技术在胃...
评价基因芯片检测技术(基因芯片技术)在结核病防治工作中对结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药性的检测效果。方法 利用传统罗氏培养及药敏试验和基因芯片技术同时对开封市2011年3～11月登记的541例涂阳肺结核患者的痰标本进行异烟肼和利福平耐药检测，以传统罗氏培养及药敏试验为金标准对基因芯片技术的检测效果进行评价。结果 具有完整的异烟肼和利福平耐药检测结果的473例患者纳入分析。基因芯片技术对初治涂阳患者...
中南大学临床药理研究所周院士申请的“用于恶性肿瘤个体化用药相关基因突变检测的基因芯片及其应用”获得国家知识产权局专利授权（专利号：ZL200910042599.4），该发明的目的在于针对目前恶性肿瘤化疗药物使用过程中普遍存在由于药物反应个体差异所导致的药物有效性低、毒副反应严重的现象，提供一种用于检测与这些药物的反应性密切相关的基因突变的基因芯片，该发明的另一目的在于提供一种可方便、快捷、系统地检...
基因芯片技术检测鼻咽癌紫杉醇耐药及耐药逆转相关基因的表达
鼻咽癌 多药耐药 耐药逆转 基因芯片
2012/3/19
比较药物处理前后鼻咽癌亲本细胞系CNE-1及鼻咽癌紫杉醇耐药细胞系CNE-1/Taxol的基因表达差异,试图发现与鼻咽癌紫杉醇耐药及耐药逆转相关的基因。方法:使用基因芯片检测药物处理前后6组细胞系之间的基因表达差异,运用多重筛选和针对已知耐药相关基因的具体分析相结合的方式进行数据分析。结果:经过多重筛选,筛选出297个差异表达的基因;比较亲本细胞,在耐药细胞中上调或下调超过5倍的有17个基因。通过...
基因芯片技术在牙髓生物学研究中的应用进展
牙髓 牙髓细胞 基因芯片 基因表达谱
2014/3/12
基因芯片作为一种高通量、快速和平行核酸序列测定及定量分析技术已经广泛地应用于分子生物学领域。牙髓基因组学的研究将有利于加强人们对牙髓生理和病理机制的认识，从而最终应用于临床预防、诊断和治疗等，因此，本文就基因芯片技术及其与牙髓干细胞相关的基因、牙髓老龄化改变相关的基因和龋病时牙髓相关的基因等研究进展作一综述。
基因芯片技术研究附子对虚寒证大鼠肝全基因表达谱的影响
附子 基因芯片 虚寒证
2012/3/20
采用基因芯片技术研究附子对虚寒证大鼠肝全基因表达谱的影响。 方法: 使用中药复方生石膏、龙胆草、黄柏、知母建立虚寒证大鼠模型,附子治疗后应用基因芯片检测大鼠肝脏基因表达,筛选差异表达基因,进行基因功能注释,荧光定量PCR验证芯片结果。 结果: 虚寒治疗组与虚寒模型组比较有212条基因差异表达,主要涉及免疫应答及氧化还原酶活性相关基因。 结论: 附子能够上调虚寒证大鼠的免疫应答相关基因及氧化还原酶活...
基因芯片技术及其在寄生虫学研究中的应用
表达谱基因芯片 功能基因 寄生虫学 应用
2012/1/13
随着人类基因组计划(human genome project，HGP)和一些模式生物基因组计划的完成，基因序列数据正以前所未有的速度迅速增长，对基因组学的研究已从结构基因组学逐步转向了功能基因组学。由于基因芯片技术操作简便，获得的信息高度特异、稳定，在寄生虫学研究领域已广泛应用。随着寄生虫分子遗传学研究的进展和寄生虫基因芯片检测工具的开发应用，这一技术用于筛选寄生虫功能基因，探索寄生虫与宿主相互作...