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功能基因组学在非综合征型唇腭裂遗传结果功能研究中的应用
非综合征型唇腭裂 功能基因组 机器学习
2019/3/22
唇腭裂是口腔常见的先天性颅颌面缺损,部分患儿的发病与遗传背景有关。全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)等研究揭示了多个与该疾病相关的易感基因位点在基因组非编码DNA区域,由于我们对于这些非编码DNA在人唇腭发育过程中的功能缺乏了解,因此对有效的易感基因位点进行系统化生物学验证成为唇腭裂遗传学结果向临床转化中的难点。本文通过对人及小鼠颅颌面发育组织...
目的:为了解枯草芽孢杆菌 TLO3的全基因组及分子生物学功能。方法:通过三代联合二代测序技术对枯草芽孢杆菌TLO3进行全基因组测序并使用相关软件对其进行基因组组装、基因预测与功能注释;并与B.subtilis168及XF-1进行比较基因组学分析。结果:枯草芽孢杆菌TLO3全基因组由1条环状染色体和质粒组成;比较基因组研究发现TLO3在细胞复制、重组和修复等过程的基因数量明显高于XF-1和168,抗...
肥胖者唾液微生物宏基因组学特点
肥胖 口腔微生物群落 唾液 宏基因组学
2018/12/5
目的：探讨肥胖者口腔唾液微生物的特点，比较肥胖者与正常体重者口腔唾液微生物组成、基因功能及代谢通路上的差异。方法：研究纳入无全身系统性疾病、无牙周炎及口腔黏膜病的肥胖者及性别、年龄相匹配的正常体重者，收集研究对象的非刺激性唾液。提取唾液样本DNA，用高通量测序方法进行宏基因组分析，结果经数据质控后进行物种分类及注释，差异物种线性判别分析（linear discriminant analysis， ...