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2023年1月8日,“人工合成酵母基因组计划”最新研究成果在《细胞》及其子刊《细胞基因组学》《分子细胞》发布,此次成果发布标志着世界首个真核生物全部染色体的从头设计与合成正式完成,为未来合成基因组学研究奠定了重要参考。
抗生素抗性基因和人畜病原菌广泛存在于畜禽粪便中,对环境及人类健康造成巨大的威胁。厌氧发酵是处理畜禽粪便污染的重要途径,因此,研究抗性基因和病原菌在厌氧发酵过程中的活性和动态,能够指导研发畜禽粪便厌氧发酵污染物处理技术。
2018年10月7日,天津大学化工学院举办基因组合成与重排研讨班。酵母长染色体精准定制合成项目负责人元英进教授,天津大学化工学院赵广荣教授,合成型酵母五号染色体参与人谢泽雄副教授,合成型酵母十号染色体参与人吴毅副教授出席了本次研讨会并先后对合成生物学、人工细胞工厂和合成基因组学等方向做出了精彩的报告。来自包括天津大学、南开大学、北京理工大学、北京化工大学等高校的几十余名老师和一百五十余名硕士博士研...
最近,天津大学和纽约大学合作在Nature Communications杂志在线发表了题为“Heterozygous diploid and interspecies SCRaMbLEing”的研究论文。该研究首次将合成型酵母基因组(Sc2.0)的重排系统拓展到杂合二倍体和跨物种二倍体,并且利用基因组重排系统快速驱动细胞进化(模式图附后)。该技术一方面有助于加速工业微生物的性状改良,另一方面对于挖...
英国《自然·通讯》杂志22日发布了Sc2.0(真核生物酵母人工基因组合成)国际合作计划的一系列最新成果:多国科学家将基因组重排系统(SCRaMbLE)应用于酵母的合成染色体,加快了酵母菌株演化。这些合成生物技术的最新进展不但能推进人类药物合成进程,还将进一步加强我们对生命过程的调节和控制能力。
DNA双链断裂将会导致染色体断裂和细胞死亡,而修复不当则可能引起基因突变、插入、缺失、易位甚至染色体结构或数量异常以及基因组稳定性失控等一系列问题。为此,细胞演化出了多种DNA修复系统,其中同源重组以同源序列为模板,可准确无误地修复DNA双链断裂。究竟哪些生物学功能或通路相关的序列高度依赖于同源重组修复?目前人们对于这一问题的认知还非常有限。天津大学最近在这方面有了突破。基于群体基因组学的重组分析...
一项新的研究证明,尽管酵母和人类分别沿着不同的路径进化了10亿年,然而两者之间依然存在着强烈的家族相似性。研究人员发现,在向酵母细胞中一次性嵌入超过400个人类基因后,差不多有50%的基因能够行使功能并使这种真菌继续存活下去。并未参与该项研究的美国布卢明顿市印第安纳大学进化生物学家Matthew Hahn表示:“这太神奇了。”他说:“这意味着类似的基因在分离10亿年后依然能够完成类似的功能。”
克隆猪β2AR基因并进行序列分析,构建其重组酵母表达质粒。采集新鲜猪肝组织,提取总RNA,经RT-PCR扩增、克隆及鉴定,获得猪β2AR的c DNA序列,并对该序列及编码的氨基酸序列进行分析。同时将目的基因插入p PICZαA酵母表达载体,构建重组表达质粒。克隆获得猪β2AR基因c DNA序列1257 bp,Genbank登录号为KF023571.1,编码418个氨基酸,蛋白分子质量46.73 k...
FZF1基因在酿酒酵母中对亚硫酸盐转运蛋白编码基因SSU1具有正向调节作用,但在贝酵母中尚无相关报道,本研究拟通过对该基因进行克隆和生物信息学分析为后续研究做出参考。首先对贝酵母FZF1基因进行克隆,并利用在线分析工具Prot Param、Prot Scale、TMHMM、Predict Protein、Swiss-Model等软件对其编码蛋白质的基本理化性质进行分析,同时预测了该基因所编码蛋白质...
从纤细裸藻c DNA中克隆出△9-脂肪酸延长酶基因,与解脂耶氏酵母整合载体p INA1297连接构建重组质粒p INA1297-△9E,用电击转化法将重组质粒转化到解脂耶氏酵母中,筛选得到阳性表达菌株YL△9E。在酵母浸出粉胨葡萄糖培养(YPD)条件下,工程酵母YL△9E的菌体生长速率高于对照菌株polf。对工程酵母YL△9E进行脂肪酸成分分析,结果表明△9-脂肪酸延长酶基因获得表达,产生了二十碳...
进化过程中新基因的作用机理研究不仅是生命进化的重要研究课题,同时也是合成生物学关注的焦点。新基因作用机理的阐明对新的生物催化酶设计、新的蛋白质结构和调控元件设计等合成生物学基本问题都具有重要指导意义。遗憾的是,目前对新基因的分子作用机理还知之甚少。
通过敲除生成途径中关键酶的编码基因,对异戊醇在工业黄酒酵母N85中的生成进行了研究。采用融合PCR技术,分别构建类丙酮酸脱羧酶基因(YDL080C)缺失组件"YDL080C-URA3-YDL080C"和β-异丙基苹果酸脱氢酶基因(LEU2)缺失组件"LEU2-URA3-LEU2",转化工业黄酒酵母N85尿嘧啶缺陷型单倍体Na-u(MATa ura3),获得单倍体工程菌Na-y和Na-l。将转化子与...
将来源于产琥珀酸丝状杆菌的β-葡聚糖酶基因根据毕赤酵母的偏好性进行密码子优化,通过全基因合成该优化基因(Fs GLUm)并构建重组表达载体p PIC9K-Fs GLUm。将p PIC9K-Fs GLUm分别用SalⅠ和BglⅡ酶切线性化后电击转化入毕赤酵母GS115染色体DNA中,经过表型筛选和抗性筛选获得不同甲醇利用表型Mut+和Muts阳性菌株。经刚果红平板检测,在摇瓶水平下,Mut+型菌株表...
微生物区系复杂,自然环境中约95%是无法用常规的培养方法获得的,为了对未能培养或不可培养的微生物进行研究,本实验选用传统发酵牦牛酸乳,分别采用CTAB-SDS-冻融法、液氮研磨法、玻璃珠吸附法来提取宏基因组DNA,然后测得三种方法所提取的DNA的浓度、纯度和片段分布状况,并对总DNA进行16S r RNA基因片段PCR扩增。实验结果表明,本实验所采取的三种DNA提取方法均能提取到适于后续研究质量的...

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