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高等真核生物基因组存在复杂的三维空间结构,在不同尺度下形成如染色质环(Chromatin loops)、拓扑关联结构域(TADs)、活性/非活性染色质区室(A/B compartments)和染色体域(Chromosome territories)。这些结构对于基因组稳定性的维持、基因表达的精准调控具有重要作用,从而影响细胞命运决定和表型建立。经典的基因组三维结构主要是通过染色体构象捕获(3C)及...
2022年7月13日,精密测量院徐富强研究团队基于新型基因编码生物磁共振成像技术,首次实现特异类型神经元网络的在体检测。相关成果在影像学顶级期刊《神经影像》(Neuroimage)上发表。大脑包含上千亿个神经元,通过数以万亿个突触建立起复杂的神经网络用于细胞间通信。神经网络的复杂性对于处理大脑中的信息和指导行为至关重要。因此,神经连接的阐明和可视化对于解析大脑功能和疾病至关重要。基于病毒的脑网络示...
2017年4月7日,Cell Research杂志发表了中科院生物物理研究所刘光慧课题组和徐涛课题组,以及中科院动物研究所曲静课题组合作的题为"Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System" 的研究论文(封面故事)。该研究发展了一种新型三维基因组活细胞成像工具TTALE,...
针对现有寻优算法存在的重复计算问题,提出了基于递推遗传的模糊3-划分熵多阈值荧光原位杂交(Fluorescence in Situ Hybridization,FISH)基因提取算法来提高用模糊划分熵算法提取多阈值FISH基因的效率。采用迭代验证法确定隶属度函数窗宽,并使用附加边界条件及灰度权重的隶属度函数对图像进行模糊3-划分。为了提高阈值寻优的效率,引入递推算法将模糊熵的计算转化为递推过程,并...

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