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近日，农学院张文利课题组在 “Nucleic Acids Research”上发表了题为“The roles of DNA methylation on pH dependent i-motifs (iMs) formation in rice”的研究论文。该研究是在前期的研究基础之上（Nucleic Acids Res 2022, 50:3226-3238），再次利用iM-IP-seq方法，从全...
前沿|南京农业大学农学院张文利课题组解析了水稻R- loop应答冷胁迫分子机制（图）
R-loop 水稻 应答冷胁迫 分子机制
2023/11/29
近日，南京农业大学张文利教授课题组在New Phytologist在线发表了题为“R‐loops act as regulatory switches modulating transcription of COLD‐responsive genes in rice”的研究论文。研究揭示了R-loop在水稻应答冷胁迫中的分子机制，一方面有助于从DNA二级结构层面理解水稻或其它作物响应冷胁迫的分子机...
南京农业大学农学院《New Phytologist》发表张文利课题组“R‐loops act as regulatory switches modulating transcription of COLD‐responsive genes in rice”（图）
张文利 气候变化 分子机制 作物生长
2023/10/28
随着全球气候变化的不断加剧，低温冻害和冷害已经成为影响农作物生长的一个重要自然胁迫因素。冷胁迫通常影响农作物正常的生长发育进程，严重时导致减产甚至颗粒无收。因此，作物冷应答分子机制研究可为作物耐冷分子育种提供理论参考。植物R-loop在不同的细胞活动中发挥重要作用，包括发育调控和胁迫应答等。然而，在低温敏感型作物如水稻中，R-loop介导冷胁迫应答的分子机制仍鲜有报道。
近日，Nature plants在线发表了南京农业大学李姗教授团队题为“Improving rice nitrogen-use efficiency by modulating a novel monouniquitination machinery for optimal root plasticity response to nitrogen”的研究论文。该团队在水稻中鉴定到一个调控水稻根系氮...
南京农业大学农学院《Nature Reviews Earth & Environment》发表水稻栽培团队“Greenhouse gas emissions and mitigation in rice agriculture”（图）
水稻栽培 数据推测
2023/10/28
2023年9月27日，南京农业大学农学院水稻栽培团队应邀在Nature Reviews系列刊物Nature Reviews Earth & Environment（影响因子42.1）上发表了题为“Greenhouse gas emissions and mitigation in rice agriculture”的综述文章，系统梳理和综述了稻田温室气体排放特征、驱动因子和减排策略。
南京农业大学农学院《Nature Reviews Earth & Environment》水稻栽培团队发文阐述稻田温室气体排放特征、驱动因子和减排策略（图）
水稻栽培 气体排放 因子 减排策略
2023/10/28
2023年9月27日，南京农业大学水稻栽培团队应邀在Nature Reviews系列刊物Nature Reviews Earth & Environment（影响因子42.1）上发表了题为“Greenhouse gas emissions and mitigation in rice agriculture”的综述文章，系统梳理和综述了稻田温室气体排放特征、驱动因子和减排策略。
近年来，南京农业大学农学院智慧农业团队利用日光诱导叶绿素荧光（SIF）估测产量进行了深入研究。研究结果近日以“The relationship between wheat yield and sun-induced chlorophyll fluorescence from continuous measurements over the growing season”为题，发表在国际著名顶级遥感...
南京农业大学农学院《Remote Sensing ofEnvironment》发表智慧农业团队“The relationship between wheat yield and sun-induced chlorophyll fluorescence from continuous measurements over the growing season”（图）
智慧农业 农作物产量；生育
2023/10/28
2023年来，南京农业大学农学院智慧农业团队利用日光诱导叶绿素荧光（SIF）估测产量进行了深入研究。研究结果2023年9月22日以“The relationship between wheat yield and sun-induced chlorophyll fluorescence from continuous measurements over the growing season”为题，...
前沿 | 南京农业大学农学院宋庆鑫团队破译大豆完整参考基因组（图）
大豆 参考基因组 Williams 82
2023/11/30
大豆是世界重要的粮油饲兼用作物，中国是全球最大的大豆消费国和进口国，近年来大豆供需失衡成为我国农业的重大“卡脖子”问题。基于基因组信息，克隆和解析重要农艺性状关键调控基因对于培育高产优质大豆新品种至关重要。2010年，大豆品种Williams 82的基因组被破译，成为首个大豆参考基因组。随后该基因组被多次更新，已成为广泛应用的大豆参考基因组，极大推动了大豆重要农艺性状的解析和分子育种。然而，该基因...
南京农业大学农学院《Molecular Plant》发表宋庆鑫教授课题组“A telomere-to-telomere gap-free assembly of soybean genome”（图）
宋庆鑫 基因 分子育种
2023/10/28
大豆是世界重要的粮油饲兼用作物，中国是全球最大的大豆消费国和进口国，2023年来大豆供需失衡成为我国农业的重大“卡脖子”问题。基于基因组信息，克隆和解析重要农艺性状关键调控基因对于培育高产优质大豆新品种至关重要。2010年，大豆品种Williams 82的基因组被破译，成为首个大豆参考基因组。随后该基因组被多次更新，已成为广泛应用的大豆参考基因组，极大推动了大豆重要农艺性状的解析和分子育种。然而，...
脂肪酸和脂质对植物细胞伸长具有重要作用，其功能特征涉及维持细胞结构完整性，为多种代谢过程提供能量，作为信号转导介质参与多种信号通路等。脂质转运蛋白(LTP)是一种含有疏水腔的蛋白质，这种结构特征使 LTP 蛋白能够结合和转运复杂的脂类物质。棉纤维是世界上最重要的天然纺织原料，也是植物中最长的单细胞。脂类物质的含量及组成对棉纤维发育具有重要调节作用，其中神经酰胺类脂质在棉纤维伸长时期含量最为丰富,且...
南京农业大学农学院《The Plant Journal》发表油菜遗传育种团队“Mutation to a cytochrome P450-like gene alters the leaf color by affecting the heme and chlorophyll biosynthesis pathways in Brassica napus”（图）
油菜遗传育种 叶绿素 生物合成
2023/10/28
2023年7月28日，The Plant Journal在线发表了南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室油菜遗传育种团队的最新研究成果“Mutation to a cytochrome P450-like gene alters the leaf color by affecting the heme and chlorophyll biosynthesis pathways in Br...
南京农业大学农学院《Plant Physiology》发表黄骥教授“RiceTFtarget: A Rice Transcription Factor-Target Prediction Server Based on Co-expression and Machine Learning”（图）
黄骥 基因 生物信息学 作物
2023/10/28
转录因子（TF）在基因表达调控中发挥了重要作用。鉴定转录因子的靶基因或与靶基因启动子结合的转录因子对于解析转录因子-靶基因模块的生物学功能和调控网络至关重要。2023年6月15日，作物生物信息学课题组在Plant Physiology发表了题为“RiceTFtarget: A Rice Transcription Factor-Target Prediction Server Based on C...
南京农业大学农学院《Plant Cell》发表宋庆鑫教授团队“Asymmetric variation of DNA methylation during domestication and de-domestication of rice”（图）
宋庆鑫 水稻栽培 基因
2023/10/28
水稻是全球最为重要的粮食作物之一，在其漫长的驯化过程中形成了形态各异的水稻栽培亚型，包括粳稻、籼稻、Aro和Aus等。在水稻栽培种植历史过程中，有些水稻逐渐恢复部分野生稻表型特征，最终演化成严重威胁全球水稻产量的杂草稻，这种现象称之为“去驯化”。通过基因组进化研究发现，大量驯化位点的变异在去驯化过程中并不能得到恢复，这就暗示着可能存在别的遗传机制来调控杂草稻在去驯化过程中恢复野生稻表型。DNA甲基...
南京农业大学农学院《Seed Biology》发表张红生教授团队“Preliminary identification of the changes of physiological characteristics and transcripts in rice after-ripened seeds ”（图）
张红生 种子质量 解析水稻
2023/10/28
种子后熟是种子成熟的延续过程，也是植物自动释放休眠的一种形式。种子后熟过程中往往存在一系列生理和分子变化。明确作物种子后熟过程中生理和分子变化规律，对破除种子休眠，提高种子质量，保证播种后田间种子萌发和幼苗的形成具有重要意义。