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第4期《生物大数据分析》培训班（免费）成功开设（图）
生物大数据 培训班
2024/3/5
2023年7月3-6日，由中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所和水产学院共同主办，进化基因组学实验室承办，面向青年科研人员的《生物大数据分析》免费培训班再次成功开办，尽管天气闷热，但课程依旧取得了良好的培训效果。该培训班由进化基因组学实验室负责人龙红岸教授全盘牵头组织，全程得到了南京诺唯赞生物科技股份有限公司、华为技术有限公司、尼康株式会社、北京金果壳生物科技有限公司、北京擎科生物科技有限公司等...
2021年10月23日-24日，由国家天元数学西北中心主办、西安交通大学数学与统计学院和西安数学与数学技术研究院数学与生命科学交叉研究中心联合承办的2021年生物数学与数据分析前沿研讨会依托线上腾讯会议平台成功举办。本次会议邀请了生物数学领域的国际知名学者参加（在线人数超过500人），旨在交流动力系统、生物数学、生物信息学和医学大数据分析领域的最新研究成果和发展动态，加强数学、统计学、生态学、数据...
蛋白质糖基化修饰的精准分析对于疾病机制研究、生物标志物发现，以及药物和疫苗开发至关重要。完整糖肽分析能获得特定糖基化位点与糖链的对应关系信息，是现代糖蛋白质组学研究中十分重要而极具挑战性的组成部分。目前，糖肽分析最常用的质谱采集模式是数据依赖性采集（DDA），存在母离子选择随机性的问题，其结果中存在较多的缺失值。近年来出现的数据非依赖性采集（DIA）模式能弥补DDA的缺点，已开始初步应用于糖蛋白质...
云南普洱茶种古茶树资源表型性状数据分析研究
云南普洱茶种 古茶树资源 表型性状 遗传多样性
2021/7/13
在基于Django框架构建的古茶树数据平台收集临沧、文山、德宏、普洱、西双版纳5个州市14个县不同茶区的64份普洱茶种古茶树资源的16个主要表型性状数据,提出一种基于Python的Anaconda来统计古茶树描述型性状的方法,并采用相关性分析、主成分分析、聚类分析等方法对古茶树表型性状数据进行分析研究。结果表明,64份云南普洱茶种古茶树资源的描述型性状变异丰富,遗传多样性指数为0.6937~1.1...
华中科技大学生命学院郭安源团队在基因表达数据分析方面取得多项进展（图）
华中科技大学生命学院 郭安源 基因表达 数据分析
2020/6/16
2020年6月8日，我校生命学院郭安源教授团队在生物信息学一区杂志Briefings in Bioinformatics发表了题为CCLA：an accurate method and web server for cancer cell line authentication using gene expression profiles的科研成果。该研究首次报道了一种基于基因表达谱数据（芯片或转...
测序数据组装新算法将数据分析速度提升5倍（图）
中国农业科学院深圳农业基因组研究所 自然·生物技术（Nature Biotechnology） 测序数据组装算法 Flye算法 分析
2020/1/11
2019年12月9日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所阮珏团队在《自然·方法学（Nature Methods）》上发表第三代测序数据组装算法wtdbg，该算法极大提高三代测序数据的分析效率，与2019年4月1日发表在《自然·生物技术（Nature Biotechnology）》上的Flye算法相比，分析速度提升了5倍，并首次将测序数据分析时间降低到少于测序数据产出时间。
蛋白质组大数据分析算法
蛋白质组 大数据分析 算法
2019/12/18
如果说基因是生命的遗传密码，那么蛋白质就是生命功能的具体执行者，其状态变化直接决定着生物体生老病死的生命过程。例如，主流观点认为阿尔茨海默病（老年痴呆症）与大脑内类淀粉样蛋白质堆积以及 Tau蛋白质过度磷酸化修饰高度相关。与基因组相对应，蛋白质组是指一个细胞、组织、器官或者物种中在特定时刻或条件下表达的所有蛋白质。监测和分析蛋白质组的变化，对于疾病的早期诊断、预防和治疗都有重要价值。近年来快速发展...
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年《Science》杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的...
2018年4月26日，《自然-遗传学》（Nature Genetics）杂志在线发表了德国马普研究所的Franziska Turck研究组和中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组合作完成的题为Telobox motifs recruit CLF/SWN–PRC2 for H3K27me3 deposition via TRB factors in Arabidopsis...
浙江大学“转录调控数据分析及R语言作图”研习班
浙江大学 转录调控数据分析及R语言作图 研习班
2017/12/20
近年来，随着高通量测序技术的迅猛发展，转录组研究从以前的微阵列技术，SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。以RNA-Seq测序技术为基础的转录组测序作为高通量测序时代核心技术之一，已在生物科学及医学领域前沿研究中获得广泛应用。RNA-Seq可进行全基因组水平的基因表达差异研究，具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点，真核生物的基因表达调控，癌症等...
利用50K芯片数据分析中国11个地方绵羊群体的遗传结构
绵羊 群体结构 网络视图（NETVIEW）
2016/5/24
旨在构建我国绵羊群体遗传结构的精细图谱，为我国绵羊遗传资源的保存、利用提供依据。利用乌珠穆沁羊、湖羊、同羊、大尾寒羊、罗布羊、哈萨克羊、多浪羊、迪庆羊、青海臧羊、四川藏羊、西藏藏羊共计11个地方绵羊品种（资源）的Illumina Ovine SNP 50K芯片数据，应用NETVIEW、PCA、STRUCTURE、NJ树等方法对群体结构进行分析。结果表明，乌珠穆沁羊与除罗布羊以外的蒙古系绵羊均有直接...
《分子生态学与数据分析基础》一书出版发行（图）
分子生态学与数据分析基础 科学出版社
2016/1/12
2016年1月8日获悉，中国科学院华南植物园单位王峥峰研究员撰写的《分子生态学与数据分析基础》一书近期由科学出版社正式出版发行。
中国科学院昆明动物研究所家养动物线粒体DNA数据分析取得进展
家养动物 线粒体DNA 数据分析
2014/10/15
作为最常用的分子标记之一，线粒体DNA（mtDNA）被广泛应用在家养动物的遗传多样性评估、群体进化历史解析等诸多研究中。随着测序技术的改进，目前已有大量的mtDNA基因组序列被测定并提交到公共数据库。然而，相关数据的质量却没有得到系统有效的评估。之前的一系列研究表明，在人类mtDNA数据中存在着由于样本污染、测序错误等原因导致的多种质量问题。这些问题序列会对相关数据分析产生不良影响，动摇结果的可靠...
CTFS-CForBio数据分析研讨会在西双版纳热带植物园召开
数据分析 研讨会 植物
2014/8/13
2014年7月27日至8月8日，中国科学院西双版纳热带植物园承办了由中国森林生物多样性监测网络（CForBio）和美国Smithsonian热带森林科学中心（CTFS）共同发起的“CTFS-CForBio analytical workshop IV”研讨会。本次研讨会共有来自CTFS和CForBio的48名研究人员参加，分别来自中国、中国台湾地区、美国等16个国家和地区。
本次研讨会以全球5...