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三色堇转录组SSR分析及分子标记开发
三色堇 EST-SSR 系统聚类
2019/6/5
为解决三色堇（Viola × wittrockiana）缺乏共显性DNA标记的问题，利用MISA软件对其转录组测序获得的167 576条unigene进行筛选，共检测出23 791个SSR位点，出现频率为14.20%，平均分布距离为6.75 kb。SSR位点中主导类型为三核苷酸重复，占总SSR的28.31%；其次是二核苷酸重复，占总SSR的12.86%。AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸与三...
基于万寿菊转录组测序的SSR标记开发
万寿菊 SSR 转录组
2018/4/3
万寿菊（Tagetes erecta L.）花蕾转录组测序共获得48 953条Unigene，利用MISA软件检测出20 666个SSR位点，分布于13 849条Unigene中，出现频率为28.29%，平均分布距离为2.51 kb。优势重复基序为三核苷酸、四核苷酸，分别占总SSR位点的50.16%和20.94%。ATG/ATG和AAAC/GTTT分别是三核苷酸、四核苷酸的优势重复基元，占总SSR...