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光是重要的环境信号，是植物进行光合作用的能量来源，参与调控植物各个阶段的生长发育过程，包括种子萌发、幼苗形态建成、叶片发育、茎的伸长与生长、向光性、气孔与叶绿体运动、开花、昼夜节律及避荫反应等。植物幼苗破土见光后，光信号迅速启动，发生光形态建成，即下胚轴生长受到抑制、子叶张开并变绿以进行光合作用，是植物早期生长的关键阶段。植物在漫长的进化过程中进化出敏感的信号系统来调节光形态建成，以响应不断变化的...
近日，园艺学院果树逆境生物学团队徐凌飞教授课题组在Plant Physiology在线发表了题为“Transcription factor PbNAC71 regulates xylem and vessel development to control plant height”的研究论文。该研究揭示了‘PbRNF217-PbNAC71-PbWAT1’模型通过影响木质部、导管发育调控梨株高的分子...
2024年1月13日，植物学领域权威期刊Plant Biotechnology Journal在线发表了华中科技大学栗茂腾教授课题组题为“BnSTINet: An experimentally‐based transcription factor interaction network in seeds of Brassica napus”的论文，该研究利用新型高通量蛋白互作鉴定技术mCrY2H-...
近日，南京农业大学园艺学院滕年军教授团队在New Phytologist在线发表了题为“Lily LlHSFC2 coordinates with HSFAs to balance heat stress response and improve thermotolerance”的研究论文，揭示了C2类转录因子LlHSFC2和A类热激转录因子互作协同调控百合耐热性的新机制。百合是重要的花卉作物，但...
内蒙古自治区细胞分子调控重点实验室那顺布和课题组揭示组蛋白分子伴侣FACT调控染色质状态及基因转录的分子机制（图）
那顺布和 组蛋白 分子伴侣 染色质 基因转录 Journal of Biological Chemistry
2024/4/29
近日，内蒙古细胞分子调控重点实验室那顺布和课题组揭示了组蛋白分子伴侣FACT复合物调控全基因组范围内基因表达的分子机制。研究成果以“Transcriptional Regulation of FACT Involves Coordination of Chromatin Accessibility and CTCF Binding”为题发表在Journal of Biological Chemis...
中国科学技术大学揭示双转录因子激活蓝藻硝酸盐同化通路的分子机制（图）
双转录因子 蓝藻硝酸盐 同化通路
2024/3/8
中国科学技术大学生命科学与医学部周丛照教授课题组与中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张余研究员课题组合作，利用冷冻电镜（cryo-EM）单颗粒重构技术，解析了鱼腥蓝细菌Anabaenasp. PCC 7120 转录激活复合物的三维结构，阐明了双转录因子以DNA looping的方式协同调控硝酸盐同化通路转录激活的分子机制，完善了细菌转录级联调控网络。该研究成果以“DNA loo...
铜绿假单胞菌是一种具有代谢多样性的革兰氏阴性机会致病菌，其复杂转录因子网络可调节细胞代谢状态，以快速适应不断变化的环境。这一能力使其成功耐受抗生素和逃避宿主免疫防御，成为一种会造成多种感染的多重耐药菌。目前铜绿假单胞菌的基因转录调控、代谢状态和抗生素耐受性之间的联系仍不明确。
中国科学技术大学开发新型空间转录组分析算法（图）
空间转录组 分析算法 数据分析
2024/3/11
近日，中国科学技术大学瞿昆教授课题组成功开发了一种基于深度学习的空间转录组数据分析算法，命名为SPACEL。该算法能够快速高效地处理多个空间转录组切片数据，包括准确预测单个空间点内的细胞类型组成、精准识别跨切片的功能性空间域，以及有效重构复杂组织的三维结构。研究成果以《SPACEL: deep learning-based characterization of spatial transcrip...
近日，南京农业大学菊花遗传育种团队在权威杂志Journal of Experimental Botany在线发表了题为“A group VIIIa ethylene-responsive factor, CmERF4, negatively regulates waterlogging tolerance in chrysanthemum”的研究论文，揭示了菊花转录抑制因子CmERF4通过介导能量...
华中农业大学棉花团队提出植物转录调控演化研究的新观点（图）
植物转录 调控演化 染色质结构
2024/1/20
2023年12月8日，华中农业大学棉花团队受邀在植物学杂志Trends in Plant Science上发表综述论文“Evolutionary insights into the organization of chromatin structure and landscape of transcriptional regulation in plants”。
2023年12月2日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心Chanhong Kim研究组在Plant Cell在线发表了题为“m6A reader ECT1 drives mRNA sequestration to dampen SA-dependent stress responses in Arabidopsis”的研究论文。该研究为阐明m6A驱动的mRNA修饰及其对植物胁迫响应的复杂影响提供了...
中国科学院植物研究所郭自峰研究组利用六棱大麦测序品种Morex绘制了穗部发育的时空转录组图谱，该图谱覆盖大麦穗部发育的17个阶段，各阶段的小穗从上到下分为5个部位：顶部、中上部、中部、中下部和底部，每个部位设置3个重复，共255个样本。科研人员通过对这些样本的转录组数据分析发现，在5个部位共同表达的基因9228个，根据表达模式分为15个cluster，不同cluster的表达峰值分布在不同的发育时...
近日，生命科学学院沈锡辉教授团队在《Nature Communications》发表了题为“c-di-GMP inhibits the DNA binding activity of H-NS in Salmonella”的研究论文，揭示了细菌第二信使c-di-GMP通过作用于全局性转录调控因子H-NS解除其对基因表达抑制作用的分子机制。生命科学学院博士后李书宇为论文第一作者，沈锡辉教授、张磊教授...
中国科学院植物所科研人员利用大麦穗部时空转录组数据揭示穗发育的关键调控因子及网络（图）
数据 调控因子 网络 发育过程
2024/1/16
大麦（Hordeum vulgare L.）是世界第四大谷物，也是最古老的作物之一，属禾本科大麦属。大麦的花序为穗状花序，着生于茎秆顶部，由中央的花序轴和两侧的小穗所组成。大麦穗发育复杂，并且不同位置的小穗发育不均等，中间部位发育较快，两端较慢。在穗发育过程中，单个穗子顶端和底部约30％-50％的小穗/小穗原基会发生退化，导致了潜在籽粒数的极大损失。因此研究大麦穗部的发育过程对于揭示花器官发育的生...
中国科学院微生物所研究团队揭示RNA结合蛋白复合体转录后调控真菌次级代谢的新机制（图）
蛋白复合体 真菌 代谢
2024/2/28
2023年11月14日，中科院微生物研究所尹文兵研究团队在Nature Communications上发表题为“Fungal secondary metabolism is governed by an RNA-binding protein CsdA/RsdA complex” 的研究论文。该研究揭示了RNA结合蛋白与全局调控因子RsdA形成复合体，并在转录后水平控制其表达，介导真菌全局次级代谢...