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Detection of candidate genes and development of KASP markers for Verticillium wilt resistance by combining genome wide association study, QTL seq and transcriptome sequencing in cotton
棉花 抗黄萎病性状 关联群体 遗传分离群体
2024/4/16
构建了棉花抗黄萎病性状的关联群体和遗传分离群体，联合利用全基因组关联分析(GWAS)、QTL- Seq和转录组测序开展了棉花抗黄萎病基因发掘与KASP标记开发研究,获得了5个主效抗黄萎病QTL的候选基因区间，开发出10个可以用于陆地棉抗病性标记辅助选择育种的KASP标记，同时鉴定出8个抗黄萎病候选基因，这些基因主要参与植物基础免疫反应及广谱抗病性，推测基础免疫反应相关基因在抗、感品种间的gDNA&...
大白菜KASP反应体系的优化与建立
大白菜 KASP 反应体系优化
2019/1/8
以大白菜基因组DNA为模板，对影响竞争性等位基因特异性PCR（Kompetitive allele specific PCR，KASP）的反应体积、引物浓度和DNA模板用量等3个参数进行优化，建立了适用于大白菜的KASP反应体系。96孔模块最佳反应体系中，总反应体积为8 μL，其中模板DNA（60 ~ 80 ng · μL-1）1 μL，KASP Master mix（2×）4 μL，引物混合物（...