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近日，华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室李兴旺和李国亮教授研究团队开发了RNA-DNA交互技术（ChRD-PET），绘制了水稻染色质结合RNA与启动子的全基因组互作图谱， 揭示了R-loop中RNA种类多元性与来源多源性，并报道了RNA在染色质环和染色质拓扑结构域等不同层级结构中的交互特征。
植物分子遗传学讲座（网络报告）：RNA表观遗传助力粮食增产（时间：2021年7月28日15:00）。
水稻OsRPK1基因属于富含亮氨酸重复序列的类受体蛋白激酶, 在盐胁迫下其表达量暂时升高后出现明显下降。前期研究表明, OsRPK1基因过表达会造成拟南芥非生物胁迫耐受性明显降低。本研究对OsRPK1基因在水稻中实现过表达和RNA干涉, 进而对OsRPK1的抗逆性功能加以探究。结果表明, OsRPK1基因表达量增加时, 水稻幼苗表现为耐盐性下降; RNA干涉则使水稻幼苗表现为耐盐性增加。盐胁迫后O...
谷子种子高质量总RNA提取方法的优化
谷子种子 总RNA提取 改良RNAiso Plus法 RNAiso Plus法 CTAB法
2020/2/27
为得到高质量的谷子种子RNA,本研究以5个不同谷子品种为材料,对RNAiso Plus法、改良RNAiso Plus法、CTAB法提取的RNA进行质量和纯度的比较。结果表明,改良RNAiso Plus法提取的总RNA完整性、纯度、浓度均优于其他2种方法提取的总RNA,5个不同谷子品种和不同萌发时期的谷子均可用改良RNAiso Plus法提取出高质量、完整性好的RNA,所得RNA产物可用于构建cDN...
复旦大学生命科学学院杨金水课题组与苏伟合作发表水稻中调控产量性状的功能长链非编码RNA研究新成果为农作物遗传改良带来新思路（图）
复旦大学生命科学学院 杨金水 课题组 苏伟 水稻 长链非编码RNA 农作物遗传改良
2018/9/20
复旦大学生命科学学院、遗传工程国家重点实验室教授杨金水课题组和副教授苏伟合作研究，从一个水稻产量性状相关基因簇LRK（leucine-rich repeat receptor kinase）上游鉴定到一例长链非编码转录物，命名为LAIR（LRK cluster intergenic antisense RNA）。水稻中LAIR的过表达可以引起LRK基因簇部分基因的转录上调，改变LRK1基因组位点的...
中国科学院遗传与发育生物学研究所在水稻核糖体RNA生物合成及其响应苗期低温胁迫 的分子机制研究中取得新进展（图）
中国科学院遗传与发育生物学研究所 水稻 核糖体RNA 生物合成 苗期低温 分子机制
2018/3/29
中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组系统鉴定了水稻rRNA前体加工成熟过程中的关键剪切位点，发现了水稻中存在两条可变的rRNA前体加工通路：以P-A3前体为代表的“5′ ETS-first”通路和以32S和27S-A2前体为代表的“ITS1-first”通路；详细绘制了首张水稻rRNA前体加工图谱，为后续水稻核糖体生物合成相关研究提供了详实的资料性储备。水稻起源于热带和亚热带地区，对低温异...
我校农学院小麦研究中心在小麦小分子RNA调控籽粒发芽势和穗发芽分子机制研究上取得重要进展——研究发现小麦物种特异的小分子RNA miRNA9678 通过参与脱落酸/赤霉素信号转导途径调控籽粒萌发。该研究发现不仅在理论上进一步丰富了对小麦萌发调控机理的认识，也为在应用上通过该途径进行小麦抗穗发芽遗传改良奠定基础。培育发芽势强、出苗快速且整齐的小麦品种对实现小麦高产稳产极为重要，然而这些品种经常表现出...
为满足棉花组织micro RNA结构与功能研究的需要，建立了棉花高质量的总RNA 提取方法。以陆地棉纤维和胚珠为供试材料，采用改良的异硫氰酸胍-硫氰酸铵-酸酚法提取总RNA，利用stem-loop RT-qPCR法鉴定成熟的miRNA。结果表明此方法能得到高质量的总RNA，并且miRNA 的回收率较高，足以满足microRNA 水平的实时定量分析。
适用于转录组测序的棉花幼根总RNA提取方法筛选
棉花 转录组 RNA提取方法 根部
2014/4/1
棉花幼根中含有大量酚类物质、多糖和单宁等多种次生代谢物，且根部取样时会带有少量的泥土和有机质等污染物，因此棉花幼根RNA提取难度较大。本文采用两种试剂盒法和改良的异硫氰酸胍法，筛选适合转录组测序的提取棉花幼根RNA的方法。与试剂盒法相比，改良的异硫氰酸胍法具有浓度高、质量好等特点，能够满足转录组测序的要求。
棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析
棉纤维发育早期 RNA-Seq qRT-PCR
2014/4/1
为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况，本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062（32.58 mm）和NMGA-105（27.06 mm）为材料，利用Illumina HiSeqTM 2000对0、3 DPA（Days post anthesis）的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接，共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个，...
棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析
棉纤维发育早期 RNA-Seq qRT-PCR
2013/8/2
为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况，本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062（32.58 mm）和NMGA-105（27.06 mm）为材料，利用Illumina HiSeqTM 2000对0、3 DPA（Days post anthesis）的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接，共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个，...
类黄酮化合物是烟草香气形成的重要前体物质,其形成需要多个调控基因的参与,查尔酮合成酶基因(CHS)是类黄酮物质合成途径中的关键基因,它的突变或沉默可能影响香气物质的形成。为了探讨CHS基因的下调表达对烟草香气的影响以及为选育优良的高香气品种提供技术,采用GATEWAY技术经BP反应和LR反应将CHS基因片段重组到表达载体pH7GWIWG2(I)上,成功构建了具有反向重复序列的CHS基因的RNAi表...
葡萄病毒AMP基因RNA干扰载体的构建
葡萄病毒 AMP基因 RNA干扰载体 构建
2011/8/25
RNA干扰（RNAi）介导的植物抗病毒研究是近年来引起广泛关注的一项植物抗病毒基因工程策略。本文以GVA运动蛋白（MP）基因为模板扩增出了418 bp的基因片段，根据RNA干扰的基本原理，将目的片段正反向分别插入到载体pFGC5941内含子的两侧以便其转录过程中高效产生RNA发夹结构。经PCR扩增证明已成功构建以GVA MP基因为靶标的干扰载体pFGC5941-GVAFR，并成功转入农杆菌EHA1...
甘蓝非编码RNA基因BoNR1的克隆与表达分析
甘蓝 BoNR1 非编码RNA 表达分析
2011/11/28
非编码RNA是近年来新发现的一类在生物体内广泛存在、能够在生命活动中行使重要功能的特殊基因。根据普通白菜花粉特异的非编码RNA基因BcMF11的全长序列设计引物,通过PCR直接扩增的方法从甘蓝中克隆出BcMF11的同源基因BoNR1,该基因全长798bp,缺乏明显的开放阅读框,而且在序列中多处出现终止密码子。生物信息学分析发现,BoNR1具有非编码RNA基因的序列特征。RT-PCR表达分析结果显示...