搜索结果: 1-15 共查到“园艺学 SSR”相关记录67条 . 查询时间(0.142 秒)
【Journal of Integrative Agriculture】安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室韦朝领课题组基于SSR分子标记的安徽省茶树遗传多样性分析及核心种质构建（图）
SSR分子标记 安徽省 茶树 遗传多样性 核心种质构建
2023/12/5
茶树为多年生常绿木本植物，自然条件下以自交不亲和为主，因此具有丰富的遗传多样性。安徽省产茶历史悠久，茶区主要分布在长江南北的皖南黄山地区和皖西大别山地区，是国内少有的兼具南北气候带特点的产茶地区，孕育了丰富的茶树种质资源，同时茶树种质资源收集、保存和利用需要构建核心种质。然而安徽省茶树种质资源遗传多样性研究甚少，核心种质尚未构建。
近日，从国家知识产权局获悉武汉植物园的发明专利“一种用于苹果果实糖含量表型筛选的SSR分子标记及其应用”（ZL 201910499464.4）获国家发明专利授权。发明人：韩月彭，彭倩，马百全。将分子遗传手段应用于农作物育种具有广阔的发展前景，然而由于缺乏高精度的基因组参考信息，重要农艺性状的基因定位难以应用于生产实践。随着现代基因组学的飞跃发展，涌现了一批高质量基因组序列和注释信息，搭建了基于全基...
选取海南大学油梨种质资源圃的‘Fuerte’油梨花朵和小果进行转录组测序，获得18 010条序列，总长度为29 422 056 bp。利用MISA软件检索转录组测序数据，获得分布于4 687个序列中的6 312个SSR位点。经统计发现，SSR在所检测的序列中出现的频率为35.05%。分析SSR位点特征显示，所有类型的SSR平均长度为18.90 bp，SSR之间的平均距离为4.66 kb。‘Fuer...
韭菜全长转录组SSR信息分析及分子标记开发
韭菜 全长转录组 SSR 无融合生殖
2020/6/18
利用MISA软件筛选韭菜（Allium tuberosum）全长转录组测序获得的49 876条（大于500 bp）转录本序列（89.44 Mb），共检测出13 111个SSR位点，分布在10 332条转录本中，SSR出现频率为26.29%，平均分布距离为6.82 kb。在搜索的6种SSR位点类型中，1 ~ 3个核苷酸重复类型占主要地位，占总SSR位点数的98.74%，其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷...
以226个建兰品种为材料，应用16对SSR荧光引物进行扩增，基于等位基因最大法，按照93.36%、83.19%、71.68%、64.16%、54.42%、47.35%、32.30%、23.45%、17.26%、12.39%和8.41%等11个压缩比例逐步聚类，形成备选种质。结果表明，16对SSR荧光引物共检测到135个等位基因，平均观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’s基因多样...
菜薹品质性状与SSR标记的关联分析
菜薹 品质性状 SSR标记 关联分析
2019/11/5
为挖掘与菜薹品质性状相关的分子标记，选用具有多态性的84个SSR标记分析了81份菜薹种质材料的遗传多样性，并采用TASSEL3.0软件中混合线性模型（MLM）对菜薹群体材料的单株质量、叶绿素含量、维生素C含量、可溶性总糖含量、可溶性蛋白含量和硝酸盐含量等6个品质性状进行关联分析。结果显示，84个SSR标记在81份菜薹种质材料中共检测出310个等位位点，引物多态信息量（PIC）在0.1878 ~ 0...
采用荧光SSR分子标记对来源于中国9个省的苹果属山荆子8个种群和楸子9个种群共288份种质的遗传多样性和种群遗传结构进行了研究。结果显示：19对SSR引物对288份种质共扩增出416个多态性等位基因，平均每个位点等位基因21.895个，多态性位点百分率（PPB）为100%。山荆子和楸子共计17个种群总体的遗传多样性较高，有效等位基因数（Ne）为9.284，平均期望杂合度（He）为0.862，Sha...
对香椿进行染色体核型分析和SSR分子标记的开发。染色体核型分析发现两个居群的香椿染色体数都是56条，为2A型，香椿的染色体较为原始，变异较小。转录组测序结果共获得66 921条Unigene，从中检索得到13 324个SSR位点，分布于11 184条Unigene中，SSR出现频率为19.91%，平均分布距离为3.84 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸，分别占SSR总数的62.33...
龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析
无患子科 龙眼 SSR 转录组
2019/8/6
基于龙眼品种‘香脆’果实的转录组测序数据库，开发龙眼EST-SSR引物，评价其在无患子、红毛丹、荔枝、龙荔等4个近缘属植物上的通用性，并进行无患子科5个属55份种质的遗传多样性分析。在13 934条龙眼Unigene中搜索到SSR位点6 683个，SSR发生频率为47.96%，平均分布距离为4.48 kb；单、二和三核苷酸重复是主要的SSR类型，分别占52.78%、26.25%和20.19%；设计...
三色堇转录组SSR分析及分子标记开发
三色堇 EST-SSR 系统聚类
2019/6/5
为解决三色堇（Viola × wittrockiana）缺乏共显性DNA标记的问题，利用MISA软件对其转录组测序获得的167 576条unigene进行筛选，共检测出23 791个SSR位点，出现频率为14.20%，平均分布距离为6.75 kb。SSR位点中主导类型为三核苷酸重复，占总SSR的28.31%；其次是二核苷酸重复，占总SSR的12.86%。AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸与三...
杨梅基因组SSR引物的开发与应用
杨梅 基因组 SSR
2019/3/5
基于杨梅（Myrica rubar Sieb. et Zucc.）基因组序列信息，研究了1 431条scaffold中SSR位点的分布特点。共发掘到二至六核苷酸SSR位点43 842个，分布在623条scaffold中，共有194种重复单元。二核苷酸SSR位点有36 383个，占总SSR的82.99%；AG/CT的出现频率最高，为55.70%，占总SSR位点的46.23%。三核苷酸SSR位点有6 ...
对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列（SSR）位点搜索和分析，发现了22 058个SSR位点，总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高（77.70%），三核苷酸次之（21.45%）。选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增，筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物。使用核心引物对39份越橘属种质进行分析，有效等位基因数最大值为7.11...
利用SRAP和EST-SSR分析香椿资源的遗传多样性
香椿 遗传多样性 SRAP EST-SSR
2018/6/15
利用SRAP和EST-SSR标记技术对中国9省10个香椿居群的遗传多样性和亲缘关系进行了分析，试图为香椿种质资源的保护和开发利用奠定基础。结果表明，33对SRAP标记共扩增出167个多态性位点，平均每对引物产生5.06个多态性位点；45对EST-SSR引物共检测到221个多态性位点，平均每对引物检测到4.9个多态位点；所选香椿居群的等位基因数和期望杂合度（EST-SSR，Na = 2.3506，H...
利用黄秋葵转录组信息挖掘SSR标记及用于种质分析
黄秋葵 转录组 SSR 多态性
2018/3/27
通过对黄秋葵（Hibiscus esculentus L.）转录组信息分析，共获得74 600条unigene，全部序列有52 976 011 bp；有3 191条unigene包含SSR的序列，从中鉴定出3 448个SSR位点，其中有235条序列包含1个以上SSR，复合SSR有123个。优势重复基序为三核苷酸和二核苷酸，分别占总SSR的60.79%和21.43%。二核苷酸重复基元中以AG/CT为...