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中国科学院生物物理研究所专利：SARS冠状病毒钉状蛋白的高免疫原性片段、编码序列及其应用
真核生物染色质以三维折叠的方式存在于细胞核，这种空间结构参与细胞的重要生命活动。细胞中的基因表达受到转录因子（TFs）和增强子等蛋白因子调控，它们的互作影响染色质三维结构。保守非编码序列（CNSs）参与募集TFs和增强子等调控蛋白，然而CNSs是否参与远程基因互作尚不清楚。
真核生物染色质以三维折叠的方式存在于细胞核，这种空间结构参与细胞的重要生命活动。细胞中的基因表达受到转录因子（TFs）和增强子等蛋白因子调控，它们的互作影响染色质三维结构。保守非编码序列（CNSs）参与募集TFs和增强子等调控蛋白，然而CNSs是否参与远程基因互作尚不清楚。
以7种古菌、46种细菌和10种真核生物的基因组为样本,考虑碱基间的短程关联和长程关联作用,得到编码序列的密码对和基因间序列的三联体对中不同位点的二核苷酸频率,据此构建了基于编码序列和基因间序列的系统发生关系。无论是基于编码序列还是基因间序列对信息进行聚类,古菌或真核均被聚在一支上,表明聚类参数的选择是合适的;与基于氨基酸序列构建的系统发生关系进行两两比较,发现大部分硬壁菌的编码序列与基因间序列之间...
东北马鹿Myostatin基因编码序列的克隆及序列分析
东北马鹿 Myostatin 基因克隆 同源性分析
2011/8/16
根据Myostatin基因的保守性,选择牛(Bos taurus cattle 登录号:AB076403)的Myostatin序列为模板进行引物设计,首次从东北马鹿基因组中扩增出Myostatin序列,扩增产物连接pMD18T载体,克隆出3个外显子片断。根据5′-GU-AG-3′规则和同源基因比对拼接出完整的编码序列,全长为1 128 bp(发表到GenBank 登录号:EF629535),My...
DNA计算中编码序列的过滤函数研究
DNA计算 DNA编码 编码过滤函数
2009/7/24
构造了用于DNA编码序列过滤的函数，并给出了DNA序列编码的算法，采用该文设计的过滤函数和算法所得到的DNA编码序列，能够满足一定的组合约束条件，并满足一定热力学条件，大大提高了DNA编码字的质量，有利于提高DNA计算的可靠性。
基于文化遗传算法的DNA编码序列设计
DNA编码 遗传算法 文化算法
2009/7/16
DNA编码问题是DNA计算的关键，然而，它已被证明为NP困难问题，通常采用优化算法求解。针对传统遗传算法缺乏有效指导，容易陷入局部极值的缺点，结合文化算法采用种群空间和信念空间的双层进化结构进行寻优，提出了一种基于遗传算法和文化算法的混合优化算法用于解决DNA编码问题。仿真结果表明该混合算法能有效地用于DNA编码序列设计。
猪肌生成抑制素基因成熟蛋白编码序列的表达与纯化
猪肌生成抑制素基因 成熟蛋白编码序列 表达与纯化
2009/3/20
猪肌生成抑制素基因myostatin (MSTN)的cDNA去除信号肽后对成熟蛋白编码序列PCR扩增出1.2 kb片段,将该片段与pMD18-T载体连接,转化JM109受体菌细胞,筛选阳性克隆测序分析,结果表明与设计序列完全一致。将该克隆载体的质粒DNA用带有BamH I和Sal I内切酶识别序列的另一对引物进行PCR扩增,将回收的1.2 kb PCR目的片段定向克隆到pET28a（+）表达载体上...
携突变减毒Stx1编码序列重组腺病毒的构建及其抗乳腺癌的活性
突变减毒 乳腺癌 复制缺陷型腺病毒
2014/4/11
构建携带1/100、1/1 000减毒活性的突变减毒志贺样毒素Ⅰ(Shiga like toxin 1, Stx1) 编码序列的复制缺陷型腺病毒，并观察其抗人乳腺癌细胞裸鼠移植瘤的活性。方法：重叠PCR法构建毒性为原毒素毒性1/100、1/1000的突变减毒Stx1编码序列，T A克隆并测序后构建携带该编码序列的复制缺陷型腺病毒载体Adv Stx 1R170L。制备人乳腺癌T47D细胞移植瘤...
日本血吸虫乙醛脱氢酶全长基因编码序列的预测、 验证与分析
日本血吸虫 乙醛脱氢酶 生物信息学 序列拼接
2009/2/20
目的 利用生物信息学和实验相结合的方法, 补平已知拼接序列中的缺失片段, 获得日本血吸虫乙醛脱氢酶全长基因编码序列。 方法 通过生物信息学方法从已公开发布的日本血吸虫转录组数据库中提取乙醛脱氢酶表达序列标签(EST)序列数据, 与其他物种的同源基因进行多序列联配, 寻找分别与同一蛋白氨基酸序列的N端和C端配对的序列; 设计引物, 用RT?鄄PCR扩增得到全长基因中间的缺失片段并测序。最终获得全...
新的肝再生相关蛋白其编码序列及用途
肝再生基因 治疗 新蛋白
2008/10/8
本发明涉及利用基因差异表达筛选技术从大鼠再生肝的差减cDNA库中克隆的一种新的促进肝脏再生相关基因LRTM4。它在大鼠的肝脏再生过程中表达升高；它cDNA全长为1576个核苷酸，编码202个氨基酸的蛋白质；LRTM4基因只在大鼠的再生肝以及睾丸组织中有表达，在其他组织包括脾脏、前列腺、骨骼肌、肺、心脏、脑中的表达检测不到；动物实验表明，经尾静脉注入LRTM4基因，并使其在大鼠体内高表达，可以使经四...
新的人基因编码序列及其编码的多肽
编码 人多肽 基因编码序列 基因核苷酸序列
2008/10/8
该发明专利是一种新的人基因核苷酸序列—人Myx的cDNA序列。该cDNA编码的蛋白是Mad家族的成员，它与SEQIDNo.3中从核苷酸11-631位的核苷酸序列有至少70%的同源性。所述序列蓖麻-具有SEQIDNo.4所示的序列的多肽。此外，还提出了生产具有人Myx蛋白活性的多肽的方法。该发明专利为进一步研究Mad家族蛋白在肿瘤治疗中的作用打下了基础。
诱导细胞凋亡蛋白其编码序列及用途
细胞凋亡 基因 药物 新基因
2008/8/29
本发明提供了一种新的细胞凋亡相关蛋白-CIDE-C蛋白以及编码CIDE-C蛋白的多核苷酸。CIDE-C蛋白是CIDE家族的一个新成员。本发明还公开了CIDE-C蛋白及其多核苷酸的制法和用途。本发明还公开了此CIDE-C蛋白用于治疗多种疾病（如凋亡相关疾病）的方法。本发明还提供了含CIDE-C蛋白的药物组合物。
摘要含有人成纤维细胞干扰素（IFNβ）基因编码序列的HindII片段，去掉了IFNβ基因5＇全部 侧翼调控序列，与SV40早期区RNA起始部位下游60个bp处连接，与可选择标记二氢叶酸还原 酶（dhfr）基因一道共转化dhfr缺陷的中国地鼠卵（CHO）细胞，经过初步筛选，在未经病 毒等诱导条件下，在转化细胞株中测到构成性表达水平为852U/2×106细胞，ml·48小时的I FNβ干扰素活性。
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