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中国科学院广州分院华南植物园在核质冲突现象与动植物进化历史研究获进展（图）
核质冲突 动植物进化 分子系统
2023/11/7
在分子系统发育研究中，基于核基因和细胞质基因（叶绿体或线粒体）构建的系统发育树常常产生不同的枝形拓扑结构，该现象被称为核质冲突（cytonuclear discordance）（图）。产生核质冲突的机制不一而同，但最常见的是基因渐渗（introgression）和不完全谱系分选（incomplete lineage sorting）。前者的原理是杂交后代物种和亲本物种之一进行不断回交，以达到其核基...
中国科学院植物研究所科研人员通过进化生物学和生态学等多学科方法的整合分析，揭示了全球杜鹃花属植物的时空进化历史和辐射进化机制，为世界性植物大属的进化研究提供了一个典型例证，并表明谱系转录组学在植物生命之树重建中是一个非常高效的方法。
中国科学院植物研究所科研人员揭示全球松属植物的时空进化历史及机制（图）
松属植物 时空进化历史
2022/11/11
物种多样性从两极到赤道逐渐增加，呈现的纬度多样性梯度是最普遍的生物分布式样。但是，在北半球松柏类的大部分物种分布于中纬度山地。形成该独特分布的机制是什么？分布于中纬度的物种与高纬度和低纬度的物种相比，谁的起源更古老？中纬度山地是松柏类植物的进化博物馆（evolutionary museum）还是进化摇篮（evolutionary cradle）？
物种分歧时间估算一直是生命之树（Tree of Life）进化历史研究中具挑战性的热点工作。分析过程通常涉及：核苷酸序列数据的系统发育分析；在重建的系统发育树的基础上，基于化石信息校准内部节点时点区间。在现有的绝大多数利用基因或基因组数据开展的工作中，来自化石或生物地质事件的外在时间校准信息多由研究者直接赋予某具体的进化树内部节点，存在一定的主观性。同时，校准信息的具体时间统计分布往往不容易确定，...