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本发明涉及生物微胶囊，特别是涉及一种海藻酸盐/ε-聚赖氨酸/海藻酸盐生物微胶囊(ε-APA微胶囊)的制备方法。高聚合多价阳离子态的ε-聚赖氨酸，可与带有阴离子的物质有强的静电作用力，基于这一特性，将ε-聚赖氨酸用作微囊膜材料，在海藻酸盐微胶囊外做成缓释性能的包被膜，来改变生物微胶囊的通透性、免疫隔离性，将ε-APA微胶囊用于细胞移植、细胞培养、药物释放等生物医学领域。