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生物信息学与智能信息处理2022学术年会于广州顺利召开（图）
生物信息学 智能 信息处理 广州
2024/4/18
2023年2月7日至8日，生物信息学与智能信息处理2022学术年会（Bioinformatics and Intelligent Information Processing Conference 2022）在广州市珠江宾馆顺利召开。华南理工大学副校长徐向民教授出席会议，中国科学院院士徐涛、房建成，中国工程院院士戴琼海等数百位专家学者参会。
刘韶教授团队在《Nucleic Acids Research（核酸研究）》《Briefings in Bioinformatics（生物信息学简报）》等国际顶尖期刊发表原创性研究（图）
刘韶教授团队 核酸研究 国际顶尖期刊
2022/5/17
近日，中南大学湘雅医院药学部主任刘韶教授团队在药物-药物相互作用领域的研究中取得了重要研究成果，并以“DDInter: an online drug-drug interaction database towards improving clinical decision-making and patient safety（DDInter：一个用于改善临床决策和患者安全的在线药物相互作用数据库）”...
细胞是生命活动的基本单元，基于二代测序和单细胞分析的新手段在更深层次上揭示生命活动本质和规律。因新方法新工具的不断涌现，亟需对主流的分析方法和算法进行基准评价，为科技工作者提供选择依据。
第七届全国计算生物学与生物信息学学术会议暨人工智能与生物医学信息学大会（NCCBB2021）是由中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会联合上海交通大学、滨州医学院、烟台市人民政府、中国交叉科学学会、烟台大学等六家单位共同主办的全国性计算生物学和生物信息学领域的高水平学术会议，每年举办一次。第七届全国计算生物学与生物信息学学术会议暨人工智能与生物医学信息学大会将于2021年7月16-18日...
2021年3月22日，国际生物信息学权威期刊《Briefings in Bioinformatics》（影响因子：8.990）正式发表了生物信息学资源在新型冠状病毒发现和监测中应用的综述文章“Bioinformatics resources for SARS-CoV-2 discovery and surveillance”，我校新发传染病病因流行病学实验室胡弢副研究馆员、李娟博士、周宏博士和李辞...
近日，德国的生物信息学家通过计算机模型识别出人体中一种对新冠病毒繁殖至关重要的酶，如果抑制这种酶，病毒就会停止繁殖而不影响宿主细胞。该研究有助于找到对抗新冠病毒感染的新方法。除了疫苗，寻找有效的治疗新冠病毒感染的药物也是战胜疫情的重要手段之一。现在，来自德国感染研究中心和蒂宾根大学的德尔格博士及其团队通过一种新颖的方法发现了新冠病毒的一个弱点，可以用来开发针对性的药物。生物信息学家使用计算机模型识...
运用生物信息学方法筛选及鉴定肾透明细胞癌(ccRCC)相关的潜在靶基因及信号通路。方法在GEO网站搜索基因芯片GSE40435、GSE53757、GSE46699和GSE16441的数据集，用GEO2R识别ccRCC和正常肾组织之间的差异表达基因，并对4组数据的共同差异表达基因进行聚类分析。
寻找三阴性乳腺癌（TNBC）研究与治疗的可能靶点，并采用生物信息学对影响TNBC预后的基因进行分析预测。检索The National Center for Biotechnology Information（NCBI）数据库，分析不同组间差异基因后提交至Enrichr网站进行通路富集，最后进行TNBC患者的生存分析。
基于基因芯片和生物信息学相关的分析方法，筛选与慢性乙型肝炎(HBV)相关肝细胞癌(HCC)发病的差异表达基因，为有HBV感染史的肝癌患者提供新的分子治疗靶点。方法 本研究对来自基因表达数据库(GEO)的GSE55092和GSE121248的mRNA微阵列数据进行分析，获得HBV相关性肝癌和正常组织的差异表达基因(DEGs)，利用DAVID数据库对DEGs进行了GO功能分析和KEGG通路富集分析，利...
探讨BIRC5在肾透明细胞癌肿瘤组织中的表达水平及其与临床预后之间的关系。方法首先使用Oncomine以及癌症基因组图谱数据库预测BIRC5 mRNA在肾透明细胞癌中的表达情况，并探索其表达量与生存的关系。采用生存分析和比例风险回归模型评估BIRC5表达与肾透明细胞癌患者预后的相关性，并通过基因集变异分析以及基因集富集分析探讨BIRC5所富集的相关通路。此外，探究了BIRC5在肾透明细胞癌中共表达...
研究肿瘤基因图谱（the cancer genome atlas，TCGA）数据库中microRNA-301b（miR-301b）在478 例卵巢癌患者中的表达量与卵巢癌患者生存状况的关系。方法 对TCGA 数据库中478 例卵巢癌患者的miR-301b 表达量与生存状况进行分析，预测其靶基因及生物学活性。
应用生物信息学方法，分析食管鳞状细胞癌miRNA表达谱，筛选差异miRNA并预测其靶基因，分析其生物学功能。方法：下载GEO数据库食管鳞状细胞癌miRNA表达谱芯片数据GSE114110 ，应用GEO2R软件对数据进行处理分析，筛选差异表达miRNA；应用GEO数据库食管鳞状细胞癌miRNA表达谱芯片数据GSE97049，GSE59973，GSE55856，GSE43732对所筛选出的差异表达mi...
miR-486-5p的靶基因预测及其在胰腺腺癌中作用的生物信息学分析
胰腺肿瘤 miR-486-5p 基因 预后 计算生物学
2021/3/31
胰腺癌是癌症相关性死亡的终点之一，是消化系统恶性程度最高的肿瘤，其主要的病理类型为胰腺腺癌（PAAD），预后较差。miR-486-5p在不同癌症中起重要作用，但尚缺乏miR-486-5p在PAAD中的研究报告。本研究通过生物信息学方法探寻miR-486-5p的靶基因并分析靶基因在PAAD中的表达及意义。方法：使用PROGmiRV2数据库分析的miR-486-5p与PAAD预后的相关性综合运用多个数...
基于生物信息学分析肝细胞癌的核心基因
肝癌 核心基因 生物信息学分析
2021/2/25
采用生物信息学方法筛选在肝细胞癌中的异常表达基因，并分析其在肝癌中的临床意义及其可能的机制。方法 通过 GEO 数据库获取 GSE101728 基因芯片数据集，筛选差异基因；通过 STRING 和 Cytoscape 筛选出核心基因；利用 GEPIA 验证核心基因在肝癌组织中的表达及其临床意义，进一步利用 DAVID 进行 GO 分析及 KEGG 通路分析；通过 STRING 构建核心基因的 PP...
中国科学院上海营养与健康研究所杨力研究组合作研究“环形RNA在天然免疫中的重要功能”入选2019年度“中国生物信息学十大应用”（图）
中国科学院上海营养与健康研究所 杨力 环形RNA 天然免疫 2019年度
2020/4/26
2020年2月，杨力研究组的一项合作研究—“Structure and Degradation of Circular RNAs Regulate PKR Activation in Innate Immunity” (Liu et al, Cell 2019) 成功入选由《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics) 组织评选的20...