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QUASAR:一种生物序列数据库的搜索算法
生物序列数据库 QUASAR 数据搜索
2007/12/27
[摘要]介绍一种生物序列数据库的搜索算法--QUASAR，即采用索引的后缀数组，通过筛选q-gram进行局部比对的方式来搜索查询序列在数据库中的近似匹配，并运用窗口推移和分块查找的方法来加快搜索和节省搜索空间。同时，将QUASAR和最流行的BLAST搜索工具进行简单比较。