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免疫（疫苗）微球可以通过提高抗原的浓度、加入多种抗原或非抗原蛋白质、加入表面活性剂和等渗剂等方法来提高在微囊化过程中抗原的稳定性；形成不溶性金属复合物、使用 pH 调节剂和添加剂以及进行化学修饰等可以保持抗原在体外释放试验中的稳定性；另外，采用更适宜的制备微球的技术和适当的聚合物也可提高抗原的稳定性，对提高免疫（疫苗）微球稳定性的的方法进行综述。
