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基于高速双倍自助法对蒙古马系统发育树的研究
蒙古马 普氏野马 高速双倍自助法 系统进化树
2019/1/15
旨在利用高速双倍自助法研究蒙古马系统发育树的问题。本研究选用30匹蒙古马的mtDNA D-loop区碱基序列，其中包括5个蒙古马类群（巴尔虎马、三河马、乌审马、乌珠穆沁马、锡尼河马）各6匹，对其所有105个可能系统树（普氏野马作为外群，6匹）进行分析，利用生物信息学软件Mega6和PAMAL4.9，以最大似然法估计蒙古马的最大似然系统树。最后利用生物信息软件CONSEL、R3.0中的SDBP包等计...
杉木属是东亚特有类群，也是我国南方的常见树种。分子系统学研究显示，杉木属是现生柏科中最早分化出的类群。化石资料也显示了杉木的古老，类似杉木的化石，如西沃德杉Sewardiodendron、似纵Elatides等在侏罗纪就已经非常繁盛。然而，尚未有研究揭示这些类似杉木的早期柏科化石类群在柏科系统树中的精确位置。它们是位于柏科系统树基干的不同演化等级，还是属于一个包括现生杉木在内的单系类群，仍然是一个...
应用基因芯片技术预测抗肿瘤药物多药耐药性(multiple drug resistance, MDR)表型时, 探针表达值归一化策略和特征基因集的选取往往是导致实验间结果不一致性的重要原因. 从基因芯片数据出发, 如何建立一个统计学上稳定的预测模型, 已成为MDR表型预测建模研究中迫切需要解决的问题. 本研究以多药耐药肿瘤细胞系的基因表达数据为研究对象, 将探针表达定性为有无表达(1/0)两种状态...
摘要随着DNA聚合酶X家族成员数量的增加,特别是两个昆虫痘病毒（entomopoxvirus，EPV）成员的加入，家族内部的系统发育关系需要重新检查。总共37个来自不同物种的DNA聚合酶X家族成员的核心结构域序列被分析。结果显示:系统发育树呈现的家族内部系统发育关系基本上与家族成员的物种分布状态相吻合，其中，病毒成员与真核生物DNA聚合酶beta（polβ）亚群构成姐妹群，提示病毒成员可能起源于真...