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中国科学院分子植物科学卓越创新中心科研成果：植物miRNA、其芯片及用途
植物 miRNA 多核苷酸 芯片
2023/3/23
本技术属于农业领域。miRNA是一组不编码蛋白质的短序列单链RNA，目前的研究显示，miRNA是执行一种转录后调节机制，其通过不完全碱基互补的方式与mRNA相应的区域结合，从而抑制蛋白质的翻译，在植物中，其还可以降解RNA。目前已发现的miRNA有数千个，但大部分功能未知。尽管目前已经在生物体中发现了一些miRNA，然而这些miRNA仅占生物体中存在的miRNA中相当少的一部分，现有对miRNA表...
水稻是我国乃至世界上最重要的粮食作物之一，水稻增产对保障粮食安全和人民生活水平具有极其重要的作用。基因芯片作为分子育种的关键技术，是提高作物设计育种水平的重要工具，开发一款涵盖广泛遗传多样性，可靠且低成本的水稻基因芯片，对水稻遗传研究和分子育种应用具有重要的理论与实践意义。
为鉴定EMS突变的真实性,本研究利用SSR标记和90 K SNP芯片对小麦品系H261及其EMS突变体进行检测。SSR检测结果表明,H261与LF2010和LF2099的差异SSR标记为0个,但与LF2100的差异SSR标记为10个,多态性比例为47.62%。SNP芯片分析结果表明,H261与LF2010和LF2099之间的差异位点分别为66和12个,分别占总数的0.080 9%和0.014 7%...
上海交通大学构建双芯片系统用于转基因作物高通量检测
上海交通大学 双芯片系统 转基因作物 高通量检测
2014/3/13
记者从上海交通大学获悉，该校科研人员利用高通量多重PCR芯片结合寡核苷酸探针芯片，获得了转基因作物高通量检测的最新成果。相关论文日前发表于美国化学会《分析化学》杂志，并申请相关专利。据了解，如何从复杂样本中对众多转基因作物进行快速有效的检测和标识，在技术上是一个重大挑战。为此，科学家发展了不同类型的检测技术，但绝大多数只能检测很少一部分转基因靶标。迄今为止，仍没有任何一种技术或方法能在一次反应中实...
根据皮棉产量数据的重复性测验及显著性分析，从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75 (Gossypium Barbadense L.)的回交自交系群体中选取高产组和低产组品系各3个材料，取这2组材料和其父母本开花后10 d的纤维进行芯片分析。比较芯片数据，获得了1508个差异表达基因。对这些差异表达基因进行聚类分析，结果显示高产组品系和低产组品系分别聚类在一起，符合...
利用基因芯片技术筛选棉纤维伸长相关基因
基因芯片 纤维伸长相关基因 差异表达基因
2011/6/7
从回交近交系(backcross inbred lines, BIL)群体中选取纤维长度差异较大的两个系NMGA-062 (33.03 mm)和 NMGA-140 (25.87 mm)，利用Affymetrix棉花基因芯片，分析其开花后10 d (DPA, days post anthesis)棉纤维伸长相关基因表达谱。在24 029条转录本中，两材料间差异表达的转录本有7 282条，占总数的30...
cDNA芯片筛选亚洲棉短绒分化发育相关基因
亚洲棉 cDNA芯片 棉纤维 光籽
2010/3/17
【目的】筛选亚洲棉短绒分化发育相关基因。【方法】利用cDNA芯片技术在棉纤维发育前期开花前3天(-3DPA)、开花当天(0DPA)、开花后3天(+3DPA)、5天(+5DPA)、7天(+7DPA)筛选野生型DPL971与其短绒突变体DPL972的差异基因。通过与模式植物拟南芥数据库相结合,找到与棉纤维起始发育相关基因,并通过RT-PCR和Real-Time PCR（QRT-PCR）验证部分侯选基因...
为了解甘蔗抗黑穗病的分子机制，利用斑茅干旱胁迫cDNA芯片检测了甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达。经杂交，在cDNA芯片的3 860个模板中，有效差异表达(Ratio值≥2.0或≤0.5)的基因为101个，其中上调55个，下调46个。部分基因的定量PCR验证表明，芯片杂交结果可靠。上调表达基因经测序、冗余序列剔除，一共获得36个unique ESTs。已知功能的22个上调表达基因，涉及多条生理代...
根据7种转基因玉米Bt11、Bt176、Mon810、Mon863、TC1507、GA21和NK603的重组DNA结构，利用Primer premier 5.0引物设计软件分别设计转化体特异性引物，优化PCR反应条件，对引物特异性及灵敏度进行验证。结果表明，所设计引物特异性强，灵敏度达0.1%。在植物基因组与外源基因的连接区域，利用Primer premier 5.0和Oligo 6.0软件分别...
应用基因芯片检测水稻基因表达的研究
水稻 寡核苷酸芯片 杂交 基因表达
2009/5/7
了解水稻生长发育过程中不同器官中的基因表达情况, 有助于理解水稻的生长发育机理, 进而有助于指导水稻遗传育种。因此,
采用寡核苷酸基因芯片对水稻孕穗期不同器官的基因表达进行检测和研究。
cDNA芯片筛选亚洲棉短绒分化发育相关基因
亚洲棉 cDNA芯片 棉纤维 光籽
2010/2/20
【目的】筛选亚洲棉短绒分化发育相关基因。【方法】利用cDNA芯片技术在棉纤维发育前期开花前3天(-3DPA)、开花当天(0DPA)、开花后3天(+3DPA)、5天(+5DPA)、7天(+7DPA)筛选野生型DPL971与其短绒突变体DPL972的差异基因。通过与模式植物拟南芥数据库相结合,找到与棉纤维起始发育相关基因,并通过RT-PCR和Real-Time PCR（QRT-PCR）验证部分侯选基因...
基于Web界面的水稻基因芯片注释整合数据库
芯片注释 水稻 分子数据库
2008/12/11
开发了1个基于Web界面在生物学背景下注释水稻基因芯片的整合数据库RiceDB，它的注释信息比同类针对水稻Affymetrix 57K全基因组表达谱芯片的注释数据库更全面、更快捷且可以自动更新。它由8个功能模块组成，RiceMap建立水稻Affymetrix 57K探针组与基因的对应关系，从而提供来自各个水稻生物信息学数据库功能描述信息；RiceGO整合Gene Ontology数据库从生物学途径...
【目的】研究小麦在不同盐胁迫时间下根部基因的应答反应。【方法】利用基因芯片技术，分析盐胁迫下耐盐小麦RH8706－49的小麦根部基因的表达情况。【结果】获得了61 215个小麦基因的差异表达图谱。在不同盐胁迫时间下大量根部基因的表达发生很大变化，即有盐诱导表达的基因，也有盐抑制表达的基因，同时对杂交数据进行多种聚类分析，并对基因表达差异的原因进行了初步分析。【结论】小麦耐盐机理非常复杂，是大量基因...
应用寡核苷酸芯片分析水稻花序相关基因在花序发育中的表达谱Gene Expression in Rice Inflorescence Development was Monitoredby Using Oligonucleotide Microarray
寡核苷酸芯片 水稻花序相关基因 基因差异表达
2008/1/16
摘要从Internet、国内外文献中查询了50个水稻花序的相关基因，制备成水稻花序相关基因的寡核苷酸芯片。对3个不同生长阶段的水稻花序材料进行了表达谱检测，用ScanArray3000对杂交结果进行扫描，得到了不同的基因表达谱。用ImaGene 4.0软件对获得的表达谱进行分析，获得基因表达差异的散点图及饼图。 图像分析表明，候选基因在水稻花序3个不同发育阶段的材料中，表达水平有显著差异。这些结果...