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T-box核糖开关是一类位于革兰氏阳性细菌mRNA的 5'非翻译区的结构元件,其长度通常在300核苷酸以下,可分为适配体结构域和表达平台结构域。T-box核糖开关通过其适配体结构域识别和结合特定的tRNA并感知其3'末端的氨酰化状态,引发下游RNA元件构象状态的转变进而在翻译水平或转录水平调控下游基因的表达。与其它核糖开关一般通过识别小分子代谢物或离子调控基因表达的机制不同,T-box基因表达调控...
内质网是真核细胞中分布最广泛的细胞器,是分泌蛋白和膜蛋白折叠、加工的主要场所。内质网自噬(ER-phagy)是溶酶体对内质网的降解,对蛋白质质量控制以及维持内质网新陈代谢和生理功能至关重要。溶酶体降解内质网的现象在半个世纪前便有报道,但直至2015年内质网自噬受体的发现才最终确认内质网自噬是一个选择性降解的进程而非溶酶体对细胞内容物无差别的降解。内质网自噬受体是一类内质网上的膜蛋白,利用其胞质区域...
英国“深度思维”(DeepMind)公司日前公布了新一代“阿尔法折叠”(AlphaFold-latest),不仅准确性显著提高,预测范围还从蛋白质扩展到其他生物分子,包括配体。该模型已可以预测蛋白质数据库(PDB)中的几乎所有分子,预测精度可以达到原子级。
韩国首尔大学团队开发出DNA纳米技术,可以像折纸一样折叠或展开厚度为人类头发千分之一的DNA纳米结构。
2023年8月3日,中国科学院生物物理研究所王磊/王志珍课题组和动物研究所刘光慧课题组合作,在《欧洲分子生物学学会报告》(EMBO Reports)上,以封面文章形式,发表了题为Reducing oxidative protein folding alleviates senescence by minimizing ER-to-nucleus H2O2 release的研究论文。该研究首次建立了...
近期,美国宾夕法尼亚大学的研究团队发现新型的蛋白折叠驱动因子DAXX(Death Domain-associated Protein,DAXX),可以有效控制蛋白质的正确折叠。相关研究在《Nature》发表,题为:DAXX represents a new type of protein-folding enabler。
近日,美国斯克里普斯研究所等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Transient Protein-RNA Interactions Guide Nascent Ribosomal RNA Folding”的文章,揭示了短暂的蛋白质-RNA相互作用引导新生核糖体RNA折叠。核糖体组装是一种高效、复杂和异构的过程,在转录过程中核糖体蛋白组装至新生rRNA上。但新生RNA折叠与蛋白质结合之间的相...
近日,青岛能源所姚礼山研究员带领的蛋白质设计研究组在细胞内蛋白质折叠研究方面取得新进展。该研究以IgG结合蛋白质GB3的两个突变体MutX 和 MutY(图1)为研究体系,采用核磁共振技术,对其在细胞内的折叠态与解折叠态之间的构象交换进行了表征。结果表明蛋白在细胞内和缓冲溶液中的折叠和解折叠的动力学过程有较大差异(图1),折叠态、解折叠态和过渡态的相对自由能受到了细胞环境的影响(图2)。进一步研究...
中国科学技术大学合肥微尺度物质科学国家研究中心教授罗毅团队研究员叶树集小组在生物膜界面蛋白质错误折叠及振动能量转移超快动力学研究两方面取得新进展。该小组揭示了与二型糖尿病相关的胰岛淀粉样多肽(hIAPP)在生物膜上错误折叠过程的结构演变机制,以及界面蛋白质与水分子间的共振能量传递捷径,研究成果分别发表在《美国化学会志》(J. Am. Chem. Soc. 2019, 141, 1941-1948)...
2019年1月15日,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心刘颖研究员课题组在eLife在线发表题为“SUMO peptidase ULP-4 regulates mitochondrial UPR-mediated innate immunity and lifespan extension”的研究论文,报道秀丽隐杆线虫中去SUMO化蛋白酶ULP-4参与介导线粒体未折叠蛋白质反应进而...
南京大学物理学院王炜教授课题组在解决困扰学界多年二硫键形成与折叠关系难题方面的研究取得突破性进展。他们的论文“Protein folding guides disulfide bond formation”于2015年8月22日在美国科学院院刊在线发表(PNAS, 2015, DOI:10.1073/pnas.1503909112),该项工作是王炜教授课题组与马里兰大学物理科学与技术研究所Dave...
为了改善天然胰蛋白酶和去折叠胰蛋白酶的酶学性能,采用单-6-脱氧-6-胺基-β-环糊精(CDAN)对它们进行修饰,研究CDAN对它们的相对活性、动力学参数、热稳定性、自溶性及在尿素溶液中稳定性的影响。结果显示:CDAN修饰明显降低了天然和去折叠胰蛋白酶的米氏常数并提高了它们的催化效率,其中去折叠胰蛋白酶的变化最显著(p0.05),修饰前后去折叠胰蛋白酶的Km值分别为0.35×10-3mol/L和0...
对于诺贝尔奖观察者而言,这又是一个推测的季节。2014年拉斯克奖于近日揭晓。久负名望的拉斯克奖被誉为“美国诺贝尔奖”,也堪称诺贝尔奖风向标。拉斯克奖基金会宣布,有86位拉斯克奖获得者之后又获得了诺贝尔奖,其中47位出现在最近30年。
来自清华大学生科院的施一公教授近期发表了题为“Common folds and transport mechanisms of secondary active transporters”的综述文章,聚焦于继发性主动转运作用元件的常见折叠,以及共有的转运机制。通过一些结构信息,分析新发现结构,生化和计算模拟证据相关的作用机制。论文发表在《生物物理年度评论》(Annual Review of Bio...
2012年3月20日,国际学术期刊Cell Research在线发表了中科院上海生科院生化与细胞所朱学良组的研究论文Misfolded Gβ is recruited to cytoplasmic dynein by Nudel for efficient clearance。

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