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近日，中国农业大学宋任涛教授团队在国际知名期刊Nature Communications《自然·通讯》上在线发表了题为“Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize”的研究成果。这标志着首次在作物胚乳中实现了单细胞分辨率的转录组和基因调控网络解析，为作物产量和品质育种提供了重要的研究资源。
跨时间点最广、面积最大人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
人脑 神经元 谷氨酸
2024/1/3
科学家通过单细胞和时空转录组研究，首次解析迄今为止跨时间点最广（GW6-GW23）、面积最大（最大4cm x 3cm）的人脑多区域时空发育转录组图谱，为解码人脑发育及区域特化研究提供了新见解。日前，相关研究成果发表在《细胞》上。
铜绿假单胞菌是一种具有代谢多样性的革兰氏阴性机会致病菌，其复杂转录因子网络可调节细胞代谢状态，以快速适应不断变化的环境。这一能力使其成功耐受抗生素和逃避宿主免疫防御，成为一种会造成多种感染的多重耐药菌。目前铜绿假单胞菌的基因转录调控、代谢状态和抗生素耐受性之间的联系仍不明确。
第六篇Science，复旦上医团队系统描绘转录起始连续动态全过程（图）
复旦大学 动态 徐彦辉团队
2024/1/4
2023年12月22日，复旦上医徐彦辉团队在《科学》（Science）杂志上在线发表题为“Structural visualization of transcription initiation in action”的研究长文（Research Article）。该项研究首次用结构重现出了转录从头起始的16个连续动态全过程，揭示了通用转录因子(GTFs)和转录泡协同RNA聚合酶Pol II调控转录...
本发明公开了荔枝MADS?box转录因子LcMADS1及其在抑制植物器官脱落中的应用。本发明克隆得到荔枝LcMADS1基因的完整开放阅读框834bp，编码277个氨基酸，将所述基因异源超表达于拟南芥野生型后，植株花器官的脱落明显受到抑制，甚至当果荚干枯开裂时花器官仍未脱落，表明荔枝LcMADS1转录因子可能具有抑制植物器官脱落的功能。本发明通过调控荔枝LcMADS1基因的表达可获得抑制植物器官的株...
中国科学技术大学开发新型空间转录组分析算法（图）
空间转录组 分析算法 数据分析
2024/3/11
近日，中国科学技术大学瞿昆教授课题组成功开发了一种基于深度学习的空间转录组数据分析算法，命名为SPACEL。该算法能够快速高效地处理多个空间转录组切片数据，包括准确预测单个空间点内的细胞类型组成、精准识别跨切片的功能性空间域，以及有效重构复杂组织的三维结构。研究成果以《SPACEL: deep learning-based characterization of spatial transcrip...
近日，南京农业大学菊花遗传育种团队在权威杂志Journal of Experimental Botany在线发表了题为“A group VIIIa ethylene-responsive factor, CmERF4, negatively regulates waterlogging tolerance in chrysanthemum”的研究论文，揭示了菊花转录抑制因子CmERF4通过介导能量...
华中农业大学棉花团队提出植物转录调控演化研究的新观点（图）
植物转录 调控演化 染色质结构
2024/1/20
2023年12月8日，华中农业大学棉花团队受邀在植物学杂志Trends in Plant Science上发表综述论文“Evolutionary insights into the organization of chromatin structure and landscape of transcriptional regulation in plants”。
2023年12月2日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心Chanhong Kim研究组在Plant Cell在线发表了题为“m6A reader ECT1 drives mRNA sequestration to dampen SA-dependent stress responses in Arabidopsis”的研究论文。该研究为阐明m6A驱动的mRNA修饰及其对植物胁迫响应的复杂影响提供了...
本发明属于基因工程技术领域，具体公开了一种毛竹蜡质合成转录因子PeWST(Wax Synthesis Transcription factor)，核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明还公开了上述毛竹蜡质合成转录因子PeWST在增加叶片表皮蜡质总量、降低叶片失水率、提高植株抗旱能力方面的应用。本发明提供的毛竹蜡质合成转录因子PeWST在植物抗旱育种中具有广泛的应用前景，为植物基因工程提供了...
南京农业大学专利：一种基于转录组测序开发山茶属植物SSR引物的方法
南京农业大学 转录组测序 山茶属植物 SSR引物
2023/12/5
本发明提供一种基于转录组测序开发山茶属植物引物的方法：以茶树叶片为材料进行cDNA库的构建和illumina测序，经过滤和从头组装后获得转录组数据。使用MISA、SSR Hunter完成位点搜索，并对包含SSR位点的序列进行生物信息学分析。以此为据进行SSR分子标记引物的开发，利用开发的引物对部分山茶属植物材料进行遗传多样性分析。本发明成功设计38对引物，经多态性筛选最终获得16对多态性引物，利用...
西北农林科技大学专利：一种植物抗病毒RNA沉默相关转录因子筛选方法及应用
西北农林科技大学 植物抗病毒 RNA沉默 转录因子
2023/11/24
本发明公开了一种植物抗病毒RNA沉默相关转录因子筛选方法及应用，以植物矮牵牛作为研究对象，采用转录组测序和VIGS相结合的技术，首先构建TRV病毒侵染的差异表达基因数据库，从中选择极显著差异表达转录因子作为候选基因；分别构建至TRV?GFP?PhPDS载体，利用双报告基因分别监测病毒积累与RNA沉默过程；接种矮牵牛后，以绿色荧光和光漂白表型作为筛选依据，在上调表达转录因子中，导致绿色荧光增强、光漂...
中国科学院植物研究所郭自峰研究组利用六棱大麦测序品种Morex绘制了穗部发育的时空转录组图谱，该图谱覆盖大麦穗部发育的17个阶段，各阶段的小穗从上到下分为5个部位：顶部、中上部、中部、中下部和底部，每个部位设置3个重复，共255个样本。科研人员通过对这些样本的转录组数据分析发现，在5个部位共同表达的基因9228个，根据表达模式分为15个cluster，不同cluster的表达峰值分布在不同的发育时...
本发明属于分子生物学以及基因工程技术领域，具体涉及一种侧柏WRKY转录因子PoWRKY2、侧柏转录因子的编码基因PoWRKY2、重组质粒和重组菌及其应用。本发明提供了一种侧柏转录因子PoWRKY2，所述侧柏转录因子PoWRKY2的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。本发明的侧柏转录因子PoWRKY2作为正调控因子参与了盐胁迫，可以提高植物的抗盐胁迫能力。实施例结果表明：筛选得到的PoWRKY2...
近日，生命科学学院沈锡辉教授团队在《Nature Communications》发表了题为“c-di-GMP inhibits the DNA binding activity of H-NS in Salmonella”的研究论文，揭示了细菌第二信使c-di-GMP通过作用于全局性转录调控因子H-NS解除其对基因表达抑制作用的分子机制。生命科学学院博士后李书宇为论文第一作者，沈锡辉教授、张磊教授...