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近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业宏基因组学创新团队联合国内科研单位开创性地提出了一种快速且全局最优的转录组定量解决方案TQSLE。该方法可准确定量序列高度相似的转录本的表达水平。相关研究成果发表在《生物信息学简报（Briefings in Bioinformatics）》上。
精原干细胞是维持哺乳动物生殖细胞稳态和持续精子发生的基础。此类细胞数量稀少，必须通过自我更新保持自身数目相对恒定，同时通过定向分化提供大量细胞参与生精过程。已有的研究已经揭示了精原干细胞核心微环境因子和一批关键的内源因子，但我们对精原干细胞活性的来源和其代谢状态与命运决定的关系还缺乏了解。随着单细胞组学技术的发展，我们能够从单细胞水平探究不同细胞类型转录和表观遗传状态，描述细胞发育轨迹并筛选在细胞...
2023年9月25日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所植保病害课题组茆振川团队与法国农科院索菲亚农业生物技术研究所Pierre Abad团队在国际知名学术期刊Plant Communications（IF 10.5）在线发表了题为“A root-knot nematode effector Mi2G02 hijacks a host plant trihelix transcription facto...
Whole-body regeneration of planarians is a natural wonder but how it occurs remains elusive. It requires coordinated responses from each cell in the remaining tissue with spatial awareness to regenera...
近日，西南大学植物保护学院何林教授团队在节肢动物如何启动解毒的研究中取得新进展，研究发现了朱砂叶螨体内核受体HR96可被杀螨剂丁氟螨酯直接激活并启动解毒酶基因表达的特异性调控途径，提出了一条“丁氟螨酯-TcHR96h-TcGSTm02”完整解毒代谢通路，相关研究内容以“A detoxification pathway initiated by a nuclear receptor TcHR96h ...
2023年9月7日，国际学术期刊Structure在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)丁建平研究组的研究成果：“Molecular basis for the functional roles of the multimorphic T95R mutation of IRF4 causing human autosomal dominant combined ...
清华大学李海涛/李文辉/王大亮合作揭示乙肝病毒微染色体状态切换与转录活化的表观机制（图）
乙肝病毒 公共卫生 清华大学
2023/12/26
乙肝病毒（HBV）感染是我国乃至全世界的一个严重的公共卫生问题，是导致肝炎的主要原因之一，长期感染会导致肝纤维化、肝硬化甚至肝癌的发生,目前全球慢性HBV感染者约有2.5亿人。HBV基因组DNA是一个松弛环状的DNA（rcDNA），长度约3.2 kb。一旦感染细胞，rcDNA会进入到细胞核并转化为共价闭合环状DNA（cccDNA），cccDNA是HBV所有病毒基因转录的模板，以微染色体的形式稳定存...
近日，华中农业大学番茄团队王涛涛、张俊红教授课题组揭示了SlTCP24和SlTCP29 转录因子协同调控番茄复叶发育的分子机制，研究以“SlTCP24 and SlTCP29 synergistically regulate compound leaf development through interacting with SlAS2 and activating transcription o...
华中农业大学在鲜切花采后衰老的转录后水平调控分子机制研究中取得新进展（图）
康乃馨 鲜切花 采后衰老 分子机制
2023/10/17
近日，华中农业大学果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室和湖北洪山实验室张帆教授课题组揭示了转录后水平调控康乃馨鲜切花采后衰老的分子机制，研究以“An insertion of transposon in DcNAP inverted its function in the ethylene pathway to delay petal senescence in carnation (Dian...
内蒙古大学王进研究员团队在Nature Protocols发表RNA端帽表观转录组系统级分析新技术的详细方法流程（图）
内蒙古大学 王进 Nature Protocols RNA端帽 表观转录组
2023/12/2
转录本的5' 端帽修饰发生于所有生物体中，并在核糖核酸（RNA）稳定性、RNA加工与核输出、信使核糖核酸（mRNA）翻译、固有免疫等方面具有重要作用。多种分析RNA端帽的方法被开发出来，但这些方法存在局限于单个端帽的分析、定量性差、缺乏灵敏度、需要放射性标记、或缺乏化学特异性等问题。我校王进研究员团队联合麻省理工学院（MIT）Peter C. Dedon教授团队等开发了一项能准确而灵敏地量化RNA...
我国科学家利用单细胞空间转录组揭示猕猴大脑皮层的细胞类型
单细胞 空间转录 猕猴大脑皮层 细胞类型
2024/1/16
阐明大脑皮层的细胞类型组成对于理解大脑结构和功能至关重要。中国科学院脑智卓越中心利用单细胞空间转录组揭示猕猴皮层的细胞类型。该研究成果于近日发表在《Cell》杂志上，题为：Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in macaque cortex。
科学家揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱
小鼠胚胎 器官形成初期 时空转录图谱
2024/1/16
胚胎正常发育需要基因表达的时空调控。单细胞技术的发展使研究早期胚胎调控具有更高的分辨率，如对小鼠胚胎发育过程中多数细胞状态的详细分子定义。德国马克斯·普朗克分子遗传学研究所等机构揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Spatiotemporal transcriptomic maps of whole mouse embryo...
微生物研究所唐双焱团队在Metabolic Engineering期刊发表文章，题为Designing glucose utilization "highway" for recombinant biosynthesis，构建了由cAMP受体蛋白（即CRP）突变体调控的大肠杆菌底盘细胞，具有作为天然产物高效生物合成底盘宿主菌的潜力。
近日，西北农林科技大学园艺学院苹果抗逆与品质改良创新团队马锋旺教授/毛柯副研究员课题组在The Plant Journal在线发表了题为“MdHB7-like positively modulates apple salt tolerance by promoting autophagic activity and Na+ efflux”的研究论文，揭示了HD-Zip转录因子MdHB7-like通...
中国科学院微生物所东秀珠研究团队发现模式古菌中转录终止介导的新调控模式（图）
东秀珠 甲烷古菌 遗传生理
2023/8/20
2023年7月18日，东秀珠研究团队在产甲烷古菌的遗传生理及转录调控(环境适应)机制研究方面取得新进展，相关研究成果在线发表于Nucleic Acids Res期刊。古菌是与细菌和真核生物相并列的第三种生命形式，是生物圈边界的界定者，因此提供了发现新生命现象、机制及技术创新的独特路径；但目前对古菌必需生命过程——转录过程及机制还所知较少，限制了对古菌的开发利用。该团队在前期有关古菌转录终止的研究基...