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2024年4月20日,同济大学生命科学与技术学院的高绍荣/高睿/陈嘉瑜/杨光研究团队在Cell Reports上发表题为“Chromatin landscape instructs precise transcription factor regulome during embryonic lineage specification” 的研究论文,该研究揭示了以TFAP2C为中心的转录因子调控网络...
阐明大脑皮层的细胞类型组成对于理解大脑结构和功能至关重要。中国科学院脑智卓越中心利用单细胞空间转录组揭示猕猴皮层的细胞类型。该研究成果于近日发表在《Cell》杂志上,题为:Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in macaque cortex。
m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰,其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶(writer)、结合蛋白(reader)以及去甲基化酶(eraser)的动态可逆调控。研究表明,m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性及翻译等生命周期活动,参与调控机体的诸多生理或病理进程,包括胚胎发育、肿瘤及神经退行性疾病的发生等。然而,在生理性衰老过程中,m6A对于器官稳态维持的调控作用与...
转录复合体将DNA转录为RNA,是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合,转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体(Chromatin Remodeler)被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布,从而为转录复合体在DNA上组装创造松散的染色质环境。那么染色质重塑复合体如何判定基因的激活状态并精确与...
2022年12月5日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院生物物理研究所朱平课题组和中国农业科学院哈尔滨兽医研究所王靖飞课题组合作完成的研究论文(In situ Structures of Polymerase Complex of Mammalian Reovirus Illuminate RdRp Activation and Transcription Regulation...
2022年10月21日, Nucleic Acids Research杂志在线发表了生命学院郭安源教授团队的动物转录因子数据库第四版(AnimalTFDB 4.0)(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB4/)。华中科技大学生命科学与技术学院郭安源教授和华中科技大学同济医学院附属同济医院助理研究员胡慧为共同通讯作者,生命学院博士生沈文康和华中科技大学同...
2022年8月18日,国际学术期刊Zoological Research在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈洛南组与西北工业大学王文组最新研究成果“Coevolutionary insights between promoters and transcription factors in the plant and animal kingdoms”。通过对跨越十亿年进化史,总共数百个动植...
非洲猪瘟病毒(ASFV)是非洲猪瘟的病原体,它具有高度传染性和致命性,严重危害全球养猪业。然而,目前尚无针对ASFV的商用疫苗和抗病毒药物,ASFV感染的发病机制亦不明确。近期我国科学家构建了ASFV感染的全景式细胞转录图谱,揭示了病毒在宿主细胞内复制的调控模式。研究成果发表在《美国科学院院刊》(PNAS),标题为“Transcriptome profiling in swine macropha...
研究非人灵长类(NHP)动物的组织组成和功能对于了解人类自身的相关组织构成至关重要。深圳华大基因研究院等绘制出非人灵长类食蟹猴的细胞转录组图谱。该研究成果于近日发表在《Nature》上,题为:Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis。
2022年5月5日,中国科学院微生物研究所高福院士团队、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所仇华吉研究员团队、北京大学汤富酬教授团队合作,在PNAS上在线发表了题为 Transcriptome Profiling in Swine Macrophages Infectedwith African Swine Fever Virus at Single-Cell Resolution 的研究论文。该研究首...
SARS-CoV-2是人类呼吸道冠状病毒之一,具有高度传播性,其感染会引发机体天然免疫反应,导致肺炎和急性呼吸窘迫综合征。然而,越来越多的COVID-19患者表现出肝脏、心脏、肾脏、血管系统,甚至是神经系统的损伤和严重的康复后遗症,系统研究SARS-CoV-2感染后机体各器官的全转录组变化对于认识宿主免疫应答机制十分必要。
近年来,空间转录组学(Spatial Transcriptomics,简称ST)的突破性进展使得研究人员在全基因组层面测量组织切片中特定空间位点的基因表达信息成为可能,这为研究人员破译组织的空间结构,理解复杂的生物学功能提供了条件。组织切片中具有相似基因表达空间模式的区域形成组织中特异的亚结构(简称为空间域)。精确破译空间域是空间转录组数据解析中最基本和关键的环节。然而,适用于单细胞异质性识别的经...
青鳉(Oryzias latipes)是一种重要的脊椎动物模型,已经在遗传学,发育生物学以及环境科学等领域广泛应用。目前,青鳉已有高质量的基因组序列,以及大量可用的遗传学技术手段。然而,目前的青鳉基因组注释主要是基于生物信息学预测和短读长的转录组测序数据,仍然存在很多问题。低质量的基因组注释是利用青鳉作为模式动物进行组学和系统生物学研究的重要障碍。 中国科学院遗传与发育生物学研究所屠强团队和日本国...
2020年5月24日,国际学术期刊 Stem Cell Research & Therapy 在线发表了中科院上海营养与健康研究所肿瘤与微环境重点实验室分子心脏学研究组题为“TATA box-binding protein-related factor 3 drives the mesendoderm specification of human embryonic stem cells by g...
近期,中国科学院昆明动物所研究人员利用来自4个青年猕猴,3个老年猕猴44个脑区的547个转录组数据研究探索了非人灵长类动物大脑老化的潜在分子遗传机制。该成果发表在期刊Genome Biology 上。研究人员基于这些大规模转录组数据分析发现,随着年龄的增长,皮质内脑区之间的表达连接性以及皮质内左右脑半球之间的表达连接性都发生了明显的下降。在各个脑区中,基因表达和选择性剪接通过不同的机制来调控大脑衰...

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