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本发明公开了与棉花隐性芽黄基因v1紧密连锁的SSR标记及其应用。本发明提供了用于鉴定芽黄棉花的成套引物，所述SSR标记VS2的引物对VS2由序列表序列1和序列2所示的单链DNA组成；所述SSR标记VS14的引物对VS14由序列表序列3和序列4所示的单链DNA组成；所述SSR标记VS18的引物对VS18由序列表序列5和序列6所示的单链DNA组成。本发明提供的引物对VS2和/或引物对VS14和/或引物...
近日，宁夏农林科学院枸杞科学研究所枸杞种质资源与育种创新团队组织撰写《枸杞SSR分子标记开发及种质资源指纹图谱》由中国农业科学技术出版社公开出版发行。
一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用
小麦 EST-SSR标记 遗传图谱 RIL
2021/4/7
为了丰富小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。从前期利用小麦转录组数据鉴定出的8 389个EST-SSR序列中，随机选取585对引物得分大于95的标记进行分析，以川麦42和川农16杂交后自交获得的重组自交系群体为试验材料，利用新开发出的EST-SSR标记，并结合SSR标记和SRAP标记，构建了一张遗传图谱。结果表明，585对EST-SSR引...
鉴定出与纤维产量相关性状连锁的SSR标记有助于黄麻纤维产量的分子标记辅助育种。本研究以311份黄麻种质资源为研究材料, 通过2016—2018年表型鉴定, 结合116对SSR引物扩增出397个SSR标记, 利用SPSS软件对SSR标记与纤维产量性状进行相关性分析。结果表明, 311份黄麻种质资源9个纤维产量性状的变异系数范围为13.05%~76.78%, 表现出广泛的遗传变异。农艺性状相关分析表明...
基于表型和SSR标记筛选海岛棉优异种质资源
海岛棉 表型 SSR标记 优异种质
2020/4/26
【目的】筛选海岛棉某一性状特别突出的优异种质资源，加快其新品种的选育进程。【方法】本研究以178份海岛棉核心种质资源为试验材料，通过调查和测定铃重、单株铃数、衣分、纤维长度、纤维比强度和马克隆值6个性状的表型数据，开展变异度和遗传多样性分析。每个性状表型值按10%最优取样策略，初步筛选海岛棉优异种质资源；同时利用120对simple sequence repeat （SSR）引物对178份海岛棉核...
为获得更多用于构建甘蔗遗传连锁图谱可用的多态性SSR标记,本研究以6个高抗甘蔗褐锈病品种和6个高感甘蔗褐锈病品种为亲本,根据感病母本×抗病父本选配12个杂交组合,筛选在亲本间条带清晰、多态性明显、重复性较好的引物。结果表明,组合柳城03-1137×德蔗93-88、Mex105×粤糖00-236亲本间的多态性引物数最多,分别占总数的52.38%和47.62%;其中,10对引物(18-mSSCIR34...
为鉴定EMS突变的真实性,本研究利用SSR标记和90 K SNP芯片对小麦品系H261及其EMS突变体进行检测。SSR检测结果表明,H261与LF2010和LF2099的差异SSR标记为0个,但与LF2100的差异SSR标记为10个,多态性比例为47.62%。SNP芯片分析结果表明,H261与LF2010和LF2099之间的差异位点分别为66和12个,分别占总数的0.080 9%和0.014 7%...
厚朴转录组特征分析及EST-SSR标记的开发
厚朴 转录组 Illumina-Solexa测序技术 EST-SSR
2020/3/10
为探明厚朴的基因组信息,开发合适的生物学工具以促进厚朴的遗传育种,本研究利用Illumina-Solexa测序技术对厚朴根、茎皮、叶不同组织的9个样本进行转录组分析,获得大量的序列信息,并以转录组序列为基础进行厚朴SSR分子标记的大规模发掘。结果表明,共获得了109 526条厚朴转录组序列,平均序列长度为1 023 bp,通过与蛋白数据库NR、Swiss-Prot、GO、KOG和KEGG五个数据库...
筛选与陆地棉叶片叶绿素含量性状相关联的分子标记，挖掘其优异等位变异及典型材料，为陆地棉分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】在3年6个环境中，对185份陆地棉品种（系）组成的自然群体进行倒4叶叶绿素相对含量（soil and plant analyzer development，SPAD）的测定，每年分3个时期（打顶后0、10和20 d）。采用PowerMarker 3.25软件计算各位点的多态性...
以260份花生材料为试材，采用不同的遗传距离构建吉林省花生初级核心种质。在50%的取样比例下，采用数量性状参数均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率、变异系数变化率4个指标评价不同方法构建的初级核心种质的可行性和有效性。最终选出一种合适的方法构建花生初级核心种质，并利用等位变异数、有效等位变异数、Shannon-Weaver指数、Nei期望杂合度等SSR标记相关参数进行验证。研究结果表明：基于...
利用关联分析方法挖掘自然群体中大豆油分和蛋白质含量相关SSR标记
大豆 油分含量 蛋白含量 关联分析
2016/2/23
为研究自然群体中大豆品种的油分和蛋白质含量变化，筛选出相关标记的优异等位变异，以327份东北主推品种和优异亲本材料构成的自然群体为试验材料。以分布于大豆20条染色体的186对SSR（simple sequence repeat）分子标记检测所有试验材料的基因型，利用STRCTURE 2.3.4软件分析群体结构，将试验材料分为7个亚群。利用TASSEL 3.0软件的混合线性模型的方法对大豆自然群体的...
菊花EST-SSR标记开发及其对万寿菊的可转移性研究
菊花 EST-SSR 万寿菊 可转移性
2017/12/4
为开发菊花EST-SSR标记并用于万春菊资源分析,研究了菊花的EST-SSR特征、标记开发及其在万寿菊上的可转移性。结果表明,菊花EST-SSR出现频率为5.35%,平均每10.64 kb存在1个SSR位点。在这些SSR位点中,共有83种重复基元,2-6核苷酸重复类型分别为10、40、14、5和14种。以14个菊花品种DNA为模板,22对菊花EST-SSR引物中14对可以扩增到清晰且稳定的PCR产...
利用SSR标记评价抗胞囊线虫野生大豆种质的遗传多样性
野生大豆 遗传多样性 大豆胞囊线虫 SSR标记
2015/11/11
大豆胞囊线虫病是大豆生产上的主要病害之一，给大豆生产造成巨大损失。利用分布在大豆20个连锁群的49个SSR分子标记分析了25份抗胞囊线虫病野生大豆种质的遗传多样性及其与8份国内外常用栽培大豆抗源间的遗传关系。供试的25份抗病野生大豆种质具有较高的遗传多样性，在49个SSR位点上共鉴定出516个SSR等位变异，其中稀有等位变异232个；平均有效基因数为6.93，期望杂合度为0.833 5。利用STR...
大豆种质对花叶病毒病和疫霉根腐病抗病性的SSR标记辅助鉴定
大豆花叶病毒病 大豆疫霉根腐病 抗病性 SSR标记鉴定
2015/11/11
通过与花叶病毒病（soybean mosaic virus,SMV）抗性相关的SSR标记Satt114对30份大豆种质进行分子辅助鉴定，共发现10个抗SMV的种质，经摩擦接种法表型验证其中9个种质表现为抗病，即分子辅助鉴定的准确性为90%。另外，利用与疫霉根腐病(phytophthora root rot，PRR)相关的SSR标记Satt325、Satt343、Satt428、Satt005、Sa...