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Pathogen Causing Phalaenopsis Soft Rot Disease – 16S rDNA and Virulence Characterisation
Erwinia/Dickeya chrysanthemi moth orchids detached leaf inoculation assay
2018/3/5
The pathogen causing Phalaenopsis soft rot disease and developed detached leaf inoculation methods were identified.
Based on its 16S rDNA sequences, the pathogen causing soft rot disease in Phalaenop...
来源于湖北省枣疯病植原体分离物16S rDNA和rp基因的序列分析
枣疯病 16S rDNA rp基因 进化树分析
2014/3/16
以田间采集的来源于我国湖北省枣树产业主产区随州市随县种植的表现为“枣疯病”症状的枣树分离株为试材, 对其16S rDNA和核糖体蛋白(ribosomal protein, rp)基因采用Nested-PCR进行扩增以及序列分析。结果表明, 湖北JWB-Hubei植原体分离物16S rDNA基因的核苷酸序列与我国山东、河南等地的分离株一致率均为99%以上, 在进化树中位于同一亚组的不同进化分支;虚拟...
甘薯小象甲是国内外重要检疫性害虫，明确中国不同地区甘薯小象甲的遗传多样性可为甘薯小象甲的鉴别检疫提供依据。本文通过对中国6个地区甘薯小象甲种群rDNA ITS-1序列的遗传变异分析探讨了中国6个地区种群的入侵来源。结合世界其他地区已公布35个甘薯小象甲种群序列，经系统发育分析表明，甘薯小象甲起源于印度次大陆，在亚洲地区随甘薯的调运而自东南向西北扩展，构建的系统发育树分为印度地区分支和亚洲东部分支两...
为给小麦孢囊线虫综合治理提供一定的理论依据，通过对苏皖鲁豫接壤地区30块田的调查和分析，探讨了这些地区麦田小麦孢囊线虫的发生情况及线虫群体之间亲缘关系。结果表明，采集的30份样品中都能检测到孢囊线虫，孢囊密度为每100 g土壤1~80个。进一步对30个小麦孢囊线虫群体的rDNAITS区PCR扩增、测序，对其序列进行比较分析发现，30个分离物的核苷酸序列同源性为97.1%～100%，与已报道的中国...
【目的】类酵母菌（Yeast-Like-Symbiots,YLS）是存在于褐飞虱（Nilaparvata lugens St?l）腹部的一种共生菌,分离获得该共生菌的离体菌株,并鉴定其种属,对于研究褐飞虱致害性变异具有重要意义。【方法】首次运用卵块离体培养的方法、采用改进后的培养基配方,从褐飞虱体内分离到两株共生菌。并运用分子生物学手段,测定离体菌株26 SrDNA D1/D2区域序列,分析鉴定菌...
斯氏副柔线虫rDNA-ITS片段的克隆及序列分析
斯氏副柔线虫 rDNA-ITS片段 克隆
2009/6/11
运用PCR方法以保守引物NC5、NC13、NC13r和NC2扩增从内蒙古地区骆驼皱胃分离的3条斯氏副柔线虫（Parabronema skrjabini）rDNA的内转录间隔区1（ITS1）、5.8S序列和内转录间隔区2（ITS2）。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGMT载体，用PCR技术及酶切鉴定阳性菌落，对阳性菌落质粒DNA进行测序。结果表明线虫1（P.sk1）扩增的ITS片段大小为837 ...
采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)用引物，PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P. medicaginis(菌株44390)的ITS1与ITS2，并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P. sojae、P. m...
中国马铃薯疮痂病病原菌16S rDNA的遗传多样性分析
马铃薯疮痂病 链霉菌 16S rDNA序列 遗传多样性
2009/4/2
【目的】利用16S rDNA序列对来自中国8个省（区）的34株马铃薯疮痂病菌和15株参比菌株进行系统发育分析。【方法】采用链霉菌通用引物对34株测试菌株的基因组进行16S rDNA序列扩增，测序后在GenBank中进行BLASTn比对，选取同源性较高的菌株构建系统发育树。【结果】34个测试菌株均为链霉菌属，其中Streptomyces scabies 12株、S. galilaeus 8株、...
伞滑刃线虫属 4个种rDNA的PCR扩增
伞滑刃线虫 rDNA PCR
2009/3/20
从161份病松树样本中分离、鉴定出拟松材线虫（Bursaphelenchus mucronatus）、霍夫曼伞滑刃线虫（B.hofmanni）和赫列尼库斯伞滑刃线虫（B.hellenicus）3个种,其中后二者是中国新记录种,华山松和云南松分别是这两个种的世界新寄主记录。本试验以松材线虫(B.xylophilus)为对照,用伞滑刃属线虫rDNA相关引物对这4种伞滑刃线虫进行PCR扩增,进一步印证形...
Identification of Root-Knot Nematodes in the Mediterranean Region of Turkey by Using rDNA and mtDNA Markers
Root-nematodes rDNA mtDNA diagnostics
2009/1/13
Fragments containing the internal transcribed spacer (ITS) ribosomal rDNA were amplified from Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria and M. hapla by polymerase chain reaction (PCR). Only dige...
核rDNA-ITS序列在昆虫学研究上的应用
2007/8/7
核糖体DNA内部转录间隔区(internal transcribed spacer，ITS)作为线粒体DNA信息的补充，在昆虫学的研究中越来越受到重视.本文描述了ITS序列的结构和特点，总结了其在品系鉴定、亲缘关系和系统发育、物种进化及扩散、昆虫与环境的关系方面的应用.品系鉴定多集中于形体学无法区分的种类；亲缘关系和系统发育的研究目的是了解物种是如何起源和进化的；而与环境的关系主要针对社会性昆虫和...