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刘嵘明教授以设计与构建可预测的细胞工厂为目标,系统开展了新型CRISPR基因编辑核酸酶的半理性定向进化、可迭代可跟踪高通量CRISPR基因组编辑工程策略开发、高效细胞工厂构建的研究。获得了可应用于不同生物体系的高精度、高效率、低脱靶效应的基因编辑工具酶。开发了高通量基因组编辑策略,对理性或半理性设计的生物元件进行高通量构建、筛选以及基因型-表型的快速表征,构造了系列具有特定功能的细胞工厂。
近日,南京大学魏辉教授团队报道了纳米酶在治疗急性胃肠炎方面的新进展。
2024年1月2日,生命科学与技术学院刘如娟课题组与合作者在学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表题为“THUMPD2 catalyzes the N2-methylation of U6 snRNA of the spliceosome catalytic center and regulates pre-mRNA splicing and retinal ...
裂解性多糖单加氧酶(LPMO)可以通过氧化断裂糖苷键的方式破坏结晶多糖,使其它纤维素酶更容易作用于底物。因此,LPMO和纤维素酶协同作用可以加速纤维素的分解,使植物生物质的转化变得更加高效。首先,利用生物信息学技术挖掘出来源于嗜热毁丝霉MtC1LPMO基因,并在毕赤酵母中进行了异源表达。发现其最适温度和pH分别为85 °C和7.5,最大比活力为174.8 U/g。 MtC1LPMO与纤维素酶存在协...
手性胺广泛存在于许多医药中间体、农用化学品、天然产物和功能性材料单体中,且许多不对称催化方法可用于其合成。其中,不对称还原胺化(ARA)在C-N键的构建中起着举足轻重的作用。例如,苏沃雷生(催眠药)、西格列汀(抗糖尿病药)、舍曲林(抗抑郁药)、艾司西酞普兰(抗抑郁药)、左布比卡因(麻醉剂)、卡巴拉汀(治疗痴呆)都是通过至少一个还原胺化步骤合成的高值药物分子(图)。NAD(P)H依赖的胺脱氢酶(Am...
在活细胞中,酶催化过程的多样性使得代谢过程正常进行,而细胞内的物质转化通常涉及到多种或多个酶的协同催化过程,底物通道化是生物体为操纵多酶体系的两种主要策略之一,与之对应的为生物体进化形成的多酶复合体系统。因此,模拟生物内多酶系统进行多酶系统的构建将为实现多酶催化过程的高效进行开辟新途径。本研究基于自然酶分子机器的组装和封装机理,创建酶分子机器仿生化底物通道型多酶催化体系,解析仿生化多酶分子机器三维...
2023年10月20日,国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)丁建平研究组的最新研究成果“Lactate dehydrogenase D is a general dehydrogenase for D-2-hydroxyacids and is associated with D-lactic acidos...
泛素化修饰是哺乳动物细胞中广泛存在的一种蛋白质翻译后修饰,包括单泛素化修饰和不同连接方式的多泛素化修饰,在众多的细胞过程中发挥关键作用,包括蛋白质降解、细胞自噬、DNA修复、信号传导等。其中,线性泛素化修饰参与多种免疫相关过程,如NF-kB信号通路和抗入侵病原体的选择性自噬等。线性泛素链组装复合物(LUBAC)是目前已知的唯一一个可以介导线性泛素化修饰的E3泛素连接酶复合体,由一个催化亚基HOIP...
2023年7月17日,中国科学院深圳先进技术研究院研究员周佳海与上海有机化学研究所研究员唐功利课题组等合作,在《自然-催化》(Nature Catalysis)上,在线发表了题为Enzymatic catalysis favours eight-membered over five-membered ring closure in bicyclomycin biosynthesis的研究论文,报道...
从头设计全新的酶需要引入活性位点和底物结合囊袋,并预测这些活性位点和底物结合囊袋在发生催化反应时生成的几何上相容的天然支架,但由于缺乏合适的蛋白质结构,以及天然蛋白质序列-结构关系的复杂性,这一设计受到了限制。
溶酶体是细胞内负责物质降解的重要细胞器,其内部含有蛋白酶、酯酶等多种水解酶,可降解多种大分子物质,包括蛋白质和脂类等。溶酶体功能紊乱导致胞内物质不能被正常降解进而诱发多种重大疾病如神经退行性疾病等。阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种典型的神经退行性疾病,其主要病理特征是脑部毒性蛋白Aβ的累积,进而导致神经元死亡和认知记忆等功能受损。因此,促进溶酶体生成,增强其降解...
2023年3月29日,中国科学院生物物理研究所研究员许瑞明与朱冰团队,在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Basis of the H2AK119 specificity of the Polycomb repressive deubiquitinase的研究论文。该研究解析了人源PR-DUB复合物结合H2AK119泛素化核小体的高分辨率电镜结构,阐明了PR-DUB特异性去除核小体H2AK...
手性胺对映体是医药和天然产物中的重要结构单元,一直是不对称催化合成领域的研究热点,也是生物催化领域的重要研究方向之一。虽然天然酶可以催化合成多种单一手性分子,但这些分子已无法满足应用需求。因此,如何通过生物催化实现分子的精准构筑,获得手性翻转分子,是不对称催化合成领域的一大挑战。通过对天然酶进行设计和改造,实现单一手性及翻转控制,具有重要的基础研究意义和应用价值。
随着资源与环境问题的日益严峻,废弃塑料的有效回收与再利用已成为全球性研究热点。聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)是目前应用较为广泛的一种合成塑料,PET的酶促解聚为废弃塑料的回收利用提供了一条绿色途径。IsPETase是近年来报道在常温下对PET水解活性最高的酶,但IsPETase的低稳定性限制了它的应用。因此,国内外已有许多研究团队基于IsPETase的晶体结构进行(半)理性设计,获得了一系列性能改...
聚酮合酶(PKSs)是自然界中一系列强大的多功能酶,能够合成具有广泛生物活性的天然产物,包括:抗生素,降胆固醇药,抗肿瘤药以及免疫抑制剂。由于其具有功能多样、结构复杂等特点,探究PKSs的基本催化机制一直是微生物天然产物合成,进而衍生新型药物的研究焦点之一。

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