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林木育种国家工程实验室是经国家发展和改革委员会于2008年10月23日批准设立（发改办高技[2008]2303号）。实验室建设由北京林业大学承担，旨在形成林木育种综合性技术研发与推广实验室平台，提高我国林木育种技术创新能力，促进林木新品种选育关键技术的创新、示范与推广。