搜索结果: 1-15 共查到“作物学 表达分析”相关记录150条 . 查询时间(0.282 秒)
为探讨多糖合成基因对铁皮石斛生长发育的调控作用及低温胁迫对多糖合成基因的影响,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对铁皮石斛多糖合成途径中UAM、UGP、RHM、SPS、CSLA和PGM基因在不同组织(根、茎、叶、花)及0℃胁迫24h的表达水平进行定量分析。结果显示:GAPDH基因在5个候选基因中稳定性最高,可作为本研究的内参基因;7个多糖合成相关基因在铁皮石斛根、茎、叶、花中均有表达,且...
番茄SlWRKY6基因克隆及其在重金属胁迫下的表达分析
番茄 SlWRKY6 基因克隆 生物信息学 重金属胁迫 表达分析
2021/3/31
为了揭示SlWRKY6基因与植物重金属胁迫的相关性，通过RT-PCR的方法从番茄中克隆得到SlWRKY6基因，该基因序列号为：NM_001365762.1。生物信息学分析结果表明，该基因含有一个长度为1 342 bp的完整开放阅读框，编码447个氨基酸残基。该基因编码的蛋白含有一个WRKY结构域，属于典型的Group Ⅱ亚家族成员。系统进化分析表明，与番茄SpWRKY31氨基酸序列之间的亲缘关系最...
为进一步研究PlABCF3基因在芍药属远缘杂交不亲和中的作用机制，根据转录组测序结果，采用RT-PCR技术在芍药粉玉奴自交和芍药粉玉奴×牡丹凤丹白杂交24，36 h的柱头中克隆到1个ABCF3基因（PlABCF3）。生物信息学和表达特性分析表明，PlABCF3的CDS全长为2 151 bp，编码716个氨基酸。芍药ABCF3的碱基序列与拟南芥ABCFs进行同源序列分析表明，其与AtABCF3具有较...
MYB转录因子蛋白普遍存在于植物中，在生物和非生物胁迫中发挥着重要作用。为了探讨棉花MYB转录因子的功能，采用同源克隆技术，在棉花叶片组织中克隆GhMYBPA1基因，并对其进行生物信息学和不同逆境胁迫下的表达分析。结果表明，从中棉35中成功克隆得到1个新的MYB转录因子基因GhMYBPA1（基因登录位点为XM_016869420），cDNA全长为825 bp，开放阅读框630 bp，编码210个氨...
红麻海藻糖生物合成关键酶基因HcTPPJ的克隆及响应逆境的表达分析
红麻 盐胁迫 海藻糖-6-磷酸磷酸酶 脱落酸
2020/12/28
海藻糖生物合成关键酶基因TPP在植物响应各种非生物胁迫过程中具有重要作用。为了明确红麻TPP基因在应对非生物胁迫过程中的作用, 本研究根据转录组CL541.Contig2Unigene序列设计特异性引物, 通过PCR获得红麻TPP基因的cDNA全长序列。生物信息学分析表明, 该基因最大开放读码框为1128 bp, 编码一个含有375个氨基酸的蛋白质。序列一致性分析发现, 该蛋白质氨基酸序列与其他物...
谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione S-transferases, GSTs)对植物抵御逆境胁迫、解除细胞毒素和植物生长发育起着重要作用。本研究通过甘蓝自花授粉0~60 min的柱头转录组数据分析, 筛选到1个受自花授粉诱导上调表达的谷胱甘肽-S-转移酶基因BoGSTL21。BoGSTL21基因开放阅读框长度为900 bp, 编码299个氨基酸, 理论等电点为8.49, 不包含信号肽和跨...
精氨酸脱羧酶(ADC)是植物多胺生物合成途径中的关键酶。为探索ADC基因在杜梨中的序列特征及其对非生物胁迫的应答特性,采用反转录PCR(RT-PCR)技术从杜梨中克隆PbADC基因,利用生物信息学软件进行序列分析,并通过荧光定量PCR技术检测其在不同组织中的表达水平和对多种非生物胁迫的响应。结果表明,PbADC基因的开放阅读框全长2 190 bp,编码730个氨基酸,预测PbADC蛋白含有66个磷...
辣椒抗坏血酸生物合成酶GME基因家族的鉴定和表达分析
辣椒 抗坏血酸 GME基因家族 表达分析
2021/4/7
GDP-甘露糖-3'，5'-异构酶基因（GME）是抗坏血酸途径中的关键限速酶，该基因可以调节AsA合成。为了解辣椒中GME基因家族功能及在非生物胁迫下的表达情况，通过生物信息学方法对辣椒GME基因家族进行鉴定，并对基因结构、结构域、系统进化关系、基因表达模式和非生物胁迫表达情况进行分析。结果表明，在辣椒中有2个GME家族成员，CaGME1和CaGME2，分别分布在3号和8号染色体上，都有6个外显子...
WRKY转录因子参与调控与植物免疫反应相关的转录重编程，对植物抗病性发挥调控作用。为了解析WRKY在野生角瓜对根结线虫（RKN）抗性中的作用，通过RT-PCR并结合RACE技术从角瓜根系中克隆CmWRKY20全长cDNA序列，采用DNAStar和DNAMAN进行氨基酸序列与系统进化分析，通过qRT-PCR进行基因表达分析，利用农杆菌介导的烟草叶片细胞转化法进行编码蛋白的亚细胞定位。结果表明，CmW...
杂交兰尿卟啉原脱羧酶基因的克隆及其表达分析
杂交兰 UROD基因 克隆 qRT-PCR
2020/12/4
尿卟啉原脱羧酶(UROD)是植物叶绿素、光敏色素和血红素合成中的一个关键酶。为了深入研究UROD基因的功能及其在杂交兰叶艺形成中的作用,本研究在转录组测序基础上,以杂交兰紫妍氏(K21)及其叶艺品系爪艺紫妍氏(K21-1)为试验材料,克隆ChUROD基因,分析其序列信息,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测该基因在不同组织及不同品种叶片中的表达情况,并对相关生理指标进行测定。结果表明,Ch...
生物钟基因能够参与调控植物的整个生命进程, 对提高作物产量具有重要的作用。LNK1 (NIGHT LIGHT- INDUCIBLE AND CLOCK-REGULATED 1)、LNK2、RVE4 (REVEILLE 4)、RVE8 (REVEILLE 8)和TOC1 (TIMING OF CAB EXPRESSION 1)是植物中重要的生物钟基因。本研究利用BLAST同源比对和进化树分析的方法分...
JAZ1基因是编码TIFY家族JAZs蛋白的基因之一。为克隆高粱SbJAZ1基因及研究其响应胁迫表达特性,本试验以高粱品种BTx623为研究材料,提取其总RNA,反转录获得cDNA,以cDNA为模板扩增SbJAZ1基因,并对其进行生物信息学、基因表达和原核表达分析。结果显示,SbJAZ1基因全长606 bp,编码201个氨基酸,蛋白质等电点为7.70,分子量大小为21.15 kDa;SbJAZ1与...
蓖麻环核苷酸门控离子通道RcCNGC2克隆与盐胁迫下表达分析
蓖麻 环核苷酸门控离子通道 表达分析 基因克隆 生物信息学
2021/4/7
为探讨RcCNGC2在蓖麻耐盐中的作用，以通蓖5号叶片为材料，克隆获得环核苷酸门控离子通道RcCNGC2完整编码区序列（CDS），并对该序列进行序列比对、蛋白结构分析，构建多元表达载体，分析了在盐胁迫下蓖麻RcCNGC2基因根、茎、叶组织中6个时间点的表达量变化。结果显示，RcCNGC2 CDS长度为2 148 bp，编码715个氨基酸，蛋白分子量为34.15 ku，等电点为9.96，存在5个跨膜...
高粱KNOX基因家族鉴定及SbKNOX22基因表达分析
高粱 KNOX基因家族 表达分析 胁迫
2020/12/1
KNOX基因家族是植物生长发育过程中所特有的一类转录因子,其在植物的形态建成方面发挥着重要的作用。为研究高粱KNOX基因家族特征及SbKNOX22的表达特性,本研究利用生物信息学和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的分析方法,对高粱KNOX基因家族进行了鉴定和表达分析。结果表明,在高粱中共鉴定到23个KNOX基因(SbKNOX1~SbKNOX23),亚细胞定位显示均定位于细胞核中,氨基酸序列长度...