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哺乳动物远缘杂交不育在自然界较为常见,在家养动物中,具有代表性的是牦牛和普通牛的杂交后代——犏牛。雌性犏牛有正常的生育力而雄性由于精子发生阻断完全不育。虽然科研人员自二十世纪80年代起就持续探索犏牛不育的机制,但导致其杂交不亲和性的基因依然没有得到确定。精准解析不同类型生殖细胞基因表达特征是筛选杂交不育基因的必要过程。由于传统转录组测序忽略了不同细胞基因表达的异质性,无法检测单个细胞的基因表达。目...
近日,中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方法和工具研发经验的系统总结和提升。
2024年3月25日,中国科学院上海药物研究所陈小华课题组与谭敏佳课题组合作,在Nature Communications期刊发表题为“Spatiotemporal and direct capturing global substrates of lysine-modifying enzymes in living cells”的研究论文。在该项研究中,科研团队利用前期开发的PANAC光点击化学...
水稻节间长度是重要的农艺性状之一,直接决定水稻株高,间接影响水稻产量。水稻穗伸出缺陷通常会造成包穗,影响开花授粉,导致杂交水稻制种产量低。截止到2020年,杂交水稻已经在中国和世界多个国家广泛种植和研究。仅在中国,杂交水稻种植面积占比就高达57%,然而杂交水稻雄性不育系往往伴随着穗茎节伸长缺陷。生产中通常在孕穗期通过外施一定浓度的赤霉素GA3来解决包穗问题,但成本较高,还容易造成穗发芽,影响种子质...
2024年3月6日,中国科学院海洋研究所在银鲳基因组学研究方面取得新进展,首次发布了我国重要名贵经济鱼类——银鲳的高质量染色体水平参考基因组,相关研究成果以题为“Chromosome-level genome assembly of the silver pomfret (Pampus argenteus)”在Nature子刊《Scientific Data》(Q1,IF5year=10.8)在线...
叶绿体中的光合作用将光能转化为化学能,吸收二氧化碳,释放氧气,是地球生物圈的重要塑造者。叶绿体大约在15亿年前通过蓝藻内共生进化而来。在进化过程中,叶绿体基因要么被废弃,要么逐渐转移到细胞核染色体中,导致大多数陆地植物叶绿体基因组中只保留了110-130个基因,其中大部分基因编码基因转录、蛋白翻译和光合作用组分。叶绿体基因组中保存着两种类型的RNA聚合酶,细菌型质体编码的RNA聚合酶(PEP)和噬...
青藏高原是中国最大、世界海拔最高的高原,素有“世界屋脊”、“第三极”之称。青藏高原独特的地形特征使其成为众多河流的主要源头,并作为“水塔”滋养着周边地区近20亿人。青藏高原的水生态系统类型多样,包括湿地、湖泊、河流、温泉和冰川等,孕育着丰富多样的水生微生物。这些微生物可能在青藏高原极端的环境条件下,如剧烈的温度波动、低氧浓度、低压和强烈的紫外线辐射,展现出独特的种类组成和代谢模式,使得青藏高原可能...
2024年1月23日,中国科学院海洋研究所许飞团队通过多组学技术解析了牡蛎附着变态期间基因调控网络的动态变化特点,研究成果在国际学术期刊Marine Life Science & Technology(影响因子5.7)上发表。
2024年1月16日,国际期刊ISME Journal刊发了中国科学院海洋研究所藻类生理过程与精准分子育种研究团队关于海洋浮游植物应对海洋暖化和热浪过程与机制的最新研究成果。这是该团队在Plant Physiology、the Plant Journal 发表海洋硅藻适应特殊环境机制的研究论文后,在海洋硅藻应对海洋暖化研究方面取得的又一重要进展。
中国科学院海洋研究所等在太平洋潜泥蛤染色体水平基因组组装和解析等方面取得重要进展,相关成果以“Chromosome-level genome assembly of the Pacific geoduck Panopea generosa reveals major inter- and intrachromosomal rearrangements and substantial ex...
大豆(Glycine max (L.) Merrill)起源于我国,是世界第一大植物蛋白质和第二大食用植物油脂来源,在国民经济发展和保障国家粮食安全中具有重要地位。值得注意的是,随着人民生活水平的提高,豆粕和豆油需求不断增加,大豆进口量连年增长,自给率仅为15%左右,已成为我国大豆在国际竞争中“卡脖子”的关键因素。然而,大豆作为中度盐敏感型作物,当土壤中盐碱度超过5 dS/m时,大豆产量即可降低5...
基于CRISPR的基因编辑工具在疾病治疗等领域拥有重要的应用前景。目前广泛使用的Cas9和Cas12a因分子尺寸较大(超过1000个氨基酸)难以被腺相关病毒(AAV)载体高效递送,限制了其的应用。为此,研究人员积极寻找更小的CRISPR效应核酸酶,其中最紧凑的一类微型核酸酶Cas12f因其较小的分子量(400-700个氨基酸)和较高的编辑活性备受关注。然而大多数Cas12f1仅识别富T的PAM序列...
近日,上海科技大学物质科学与技术学院季泉江教授课题组与西湖大学申怀宗教授课题组合作在《自然·催化》 (Nature Catalysis) 杂志发表了最新成果。
2023年8月23日,国际学术期刊American Journal of Human Genetics在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所李昕研究组题为“An RNA informed dosage sensitivity map reflects intrinsic functional nature of genes”的研究论文。该研究提出了新的基因剂量约束的度量方法,并基于此提出孟德尔遗...
蛋白糖基化是蛋白翻译后修饰之中最为复杂的一类修饰,在药物研发和新的药物靶点发现中颇具应用前景。然而,与生物系统中蛋白质糖基化的多样性相比,聚糖分析的工具仍然有限,直接限制了蛋白糖基化在药物研发中的应用。中国科学院上海药物研究所文留青课题组前期发展了基于生物素探针分子和糖苷内切酶的可逆标记策略,实现了对核心岩藻糖的可逆标记研究,在组学水平上解析了蛋白核心岩藻糖糖基化在细胞表面的分布。然而,该团队在利...

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