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本文采用RT-PCR技术克隆获得了拟果蝇Drosophila simulans电压门控钠离子通道基因序列，明确其典型特征，分析了进化关系，为拟果蝇抗性分子机理研究奠定基础。克隆得到拟果蝇钠离子通道开放阅读框（GenBank登录号为MT113357），长为6270 bp，编码2090个氨基酸。通过生物信息学分析，发现拟果蝇与黑腹果蝇Drosophila melanogaster钠离子通道基因相似度高...
克隆获得桃蚜电压门控钠离子通道基因cDNA序列，明确钠离子通道的典型特征，为研究桃蚜抗性分子机理奠定基础。采用实验技术主要有RT-PCR和PCR，克隆桃蚜钠离子通道基因cDNA序列，利用相关软件对其序列进行生物信息学分析。克隆得到两段cDNA序列MpNav-1（NCBI登录号：MN124170）和MpNav-2（NCBI登录号：MN176136）。MpNav-1长度为2945 bp，包括2877 ...
卵菌与真菌Argonaute家族基因的生物信息学分析
卵菌 真菌 Argonaute基因家族 RNA干扰 生物信息学
2020/3/13
Argonaute蛋白广泛存在于真核生物与原核生物中,可在非编码小RNA或DNA的引导下,对完全匹配或部分匹配的靶标进行切割、翻译抑制或染色体修饰。本研究利用生物信息学对127种卵菌与真菌的基因组进行分析,旨在了解各个物种中AGO家族基因的数量、蛋白结构域、进化关系及转录模式等。结果发现,大部分卵菌与真菌的基因组中(51%)含有2个AGO基因,而疫霉菌和壶菌等平均含有4个以上。卵菌与真菌的AGO基...
稻瘟病菌几丁质结合蛋白的生物信息学分析
稻瘟病菌 几丁质结合蛋白 生物信息学
2011/10/27
为了弄清稻瘟病菌数据库中可能的几丁质结合蛋白的分布及其结构特点，从而为进一步进行编码基因的功能研究打下良好基础。通过生物信息学技术对稻瘟病菌基因组中假定的几丁质结合蛋白的结构域、亚细胞定位及EST等进行分析，同时构建了系统发育树并预测了这些蛋白在不同发育时期和不同组织中的表达特点。结果共得到了23个可能的几丁质结合蛋白，它们在7条染色体上的分布并不均匀；绝大多数的几丁质结合蛋白都定位在胞外。稻瘟病...