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甘薯病毒2中国分离物全基因组序列克隆及遗传进化分析
sweet potato virus 2 complete nucleotide sequence genomic characterization phylogenetic analysis
2020/9/2
The complete nucleotide sequence of a Chinese isolate of sweet potato virus 2 (SPV2-Ch1) was determined by using RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends methods. Sequence comparisons of complete g...
甘薯病毒G CH株系和CH2株系中国分离物基因组全序列克隆及结构特征分析
甘薯病毒G 全序列 基因组结构 系统进化
2021/3/17
为明确甘薯病毒G（sweet potato virus G，SPVG）CH株系中国分离物SPVG-CH-Ch1和CH2株系中国分离物SPVG-CH2-Ch1的基因组结构特征及遗传变异情况，利用RT-PCR和RACE方法克隆获得分离物SPVG-CH-Ch1和SPVG-CH2-Ch1的基因组全序列，应用DNAMAN软件对基因组全序列及不同编码区序列进行分子变异分析，并基于多聚蛋白基因序列利用MEGA ...
本研究旨在克隆绵羊生长分化因子9（Growth differentiation factor 9，GDF9）基因mRNA、DNA和调控区全序列，并检测其在11个绵羊品种中的遗传多态性，探究GDF9基因与绵羊多羔性状的关系。首先应用RACE和PCR技术克隆GDF9基因全长序列，其次利用SNaPshot分型技术检测11个绵羊品种GDF9基因遗传多态性。结果显示，克隆获得GDF9基因mRNA全长1 85...
牦牛AQP9基因CDS全长序列克隆及其生物信息学特征分析
CDS区 分子克隆 生物信息学
2015/7/28
为了研究高原动物对青藏高原极端生境的适应机理，并为探讨高原动物适应机制提供基本数据。本研究运用基因克隆技术对牦牛脑AQP9基因CDS全长序列进行克隆，采用生物信息学方法进行分析，AQP9基因和编码序列特征进行了以下几方面的预测和分析：其物化性质、疏水性、跨膜结构和蛋白二级结构。结果表明，牦牛AQP9的CDS含有一个885 bp的开放阅读框，编码295个氨基酸；牦牛AQP9基因编码蛋白分子量和理论等...
高原鼢鼠神经型一氧化氮合酶基因编码区序列克隆与分析
高原鼢鼠 神经型一氧化氮合酶 基因克隆 序列分析
2016/7/18
高原鼢鼠是青藏高原特有的地下鼠,受到高原低氧以及洞穴低氧的双重低氧环境压力。经RNA 提取、RT-PCR、亚克隆与测序,本研究获得高原鼢鼠神经型一氧化氮合酶(nNOS)的编码区序列,并对其分子特征进行了分析。结果显示:高原鼢鼠nNOS 基因编码区(CDS)全长4 290 bp,编码1 429 个氨基酸残基;CDS 与大鼠、小鼠、兔、狗、人的同源性分别为90% 、89% 、87% 、87% 、89%...
大豆花叶病毒（soybean mosaic virus，SMV）病是全球最主要的大豆病害之一，严重危害大豆的产量和品质。RNA干扰(RNA interference,RNAi)能够在mRNA水平特异性沉默同源靶基因，为抗病毒作物的培育提供了新的途径。本研究对国内外11个不同SMV流行株系的HC-Pro基因进行了核苷酸序列比对，并以SC3株系的cDNA为模板克隆出高度保守的268 bp的基因片段，进...
草鱼α-淀粉酶基因5，侧翼序列克隆与分析
草鱼 α-淀粉酶基因 Genome Walking 5'侧翼序
2014/12/3
应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼（Ctenopharyngodon idellus）α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2 063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对，相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析，确定了其转录起始区域及转录起始位点（TSS）；在TSS上游...
为研究HIRA基因在半滑舌鳎胚胎发育中的作用及其组织差异表达，本实验以半滑舌鳎为研究对象，采用同源克隆策略从其精巢中分离了长度为764bp的HIRA部分cDNA序列，该片段编码254个氨基酸，具有5个WD结构域。对氨基酸进行比较发现，半滑舌鳎HIRA与比较物种的氨基酸序列具有很高的同源性，与红鳍东方鲀亲缘关系最近。运用实时定量PCR分析表明，HIRA mRNA在多细胞期到原肠胚期的表达量较高，表明...
沼泽型水牛NANOG基因5′调控序列克隆与功能分析
沼泽型水牛 NANOG 调控序列 克隆
2013/11/29
为探讨沼泽型水牛NANOG基因的表达调控模式，本研究扩增克隆了广西本地沼泽型水牛NANOG基因的5′调控序列片段，设计了-1 213、-745、-425和-312 bp 4个缺失体片段，分别构建成EGFP报告载体。应用显微注射报告载体生产转基因水牛和猪胚胎，并转染水牛胎儿成纤维细胞。结果发现，EGFP的表达仅限于水牛囊胚内细胞团。各缺失体在猪4.5 d胚胎中均能启动下游EGFP的表达，转录活性两两...
三种稻飞虱体内类酵母共生菌18S rDNA和 ITS5.8S rDNA序列克隆及进化分析
稻飞虱 灰飞虱 褐飞虱 白背飞虱 酵母类共生菌 18S rDNA ITS-5.8S rDNA 系统发育分析
2013/9/14
为研究水稻3种主要害虫灰飞虱Laodelphax striatellus、 褐飞虱Nilaparvata lugens和白背飞虱Sogatella furcifera体内类酵母共生菌（yeast-like symbiotes, YLS）的种属地位及与寄主的进化关系， 测定了其体内YLS的18S rDNA及ITS-5.8S rDNA的全长序列。基于3种稻飞虱体内YLS的18S rDNA序列比对表明，...
本文通过RT-PCR技术克隆山羊心脏型脂肪酸结合蛋白的cDNA 全序列，并对cDNA序列的氨基酸同源性、理化性质、二级结构特征进行了预测和分析。结果显示，山羊H-FABP基因cDNA全长402 bp，推测的氨基酸序列与绵头同源性为100%；H-FABP蛋白属疏水性蛋白，呈为弱酸性；二级结构以β折叠为主；不含跨膜结构域，具有潜在的信号肽位点、多个其它信号位点以及细胞脂肪酸结合信号位点，从而为揭示H-...
过氧化氢酶 (catalase, CAT)作为生物体内的重要物质， 其主要功能是参与活性氧代谢过程， 在清除H2O2、 超氧自由基和过氧化物以及阻止羟基自由基形成等方面发挥着重要作用。本研究利用RT-PCR技术和RACE方法首次克隆和分析了甜菜夜蛾Spodoptera exigua （Hübner）CAT基因， 命名为SexiCAT， GenBank登录号为JN051294， 其cNDA序列全长为...
为获取C2H2型锌指蛋白基因在物种间的分类和进化关系,分析其在基因结构上的保守性,更好地研究该基因在植物花粉发育中的功能,根据白菜花粉发育相关基因 BcMF20 DNA序列设计引物,运用PCR技术分别从十字花科芸薹属和萝卜属18种材料中克隆了C2H2型锌指蛋白基因 BcMF20 的同源序列。经序列比对分析, BcMF20 同源基因在 DNA 序列上的相似性为86.9%~ 100%,所推导的氨基酸序...
小麦亚硝酸还原酶基因及调控序列克隆、定位和表达分析
小麦 亚硝酸还原酶 表达分析
2011/6/7
利用in silico及反向PCR技术, 从小麦中克隆了亚硝酸还原酶编码基因及其调控序列, 进一步利用原核诱导表达、半定量RT-PCR、AS-PCR及生物信息学手段对克隆的新基因进行鉴定及染色体定位分析。开放阅读框预测结合测序结果表明, 该基因gDNA长2 881 bp, 包含4个外显子和3个内含子, cDNA长1 830 bp, GenBank登录号分别为FJ555239和FJ527909, 预...