搜索结果: 1-15 共查到“知识库 生物学 生物信息学”相关记录47条 . 查询时间(0.505 秒)
贵阳学院生物与环境工程学院生物信息学本科专业简介
贵阳学院 生物与环境工程学院 生物信息学
2024/4/1
主要课程：Python语言编程、Linux操作系统、C++语言程序设计、分子生物学、生物统计学、Linux基础及应用、Perl编程基础、基因工程、转录组学与基因组学、蛋白组学与代谢组学。
白桦AP2/ERF家族基因的生物信息学分析
AP2/ERF 家族 生物信息学 转录因子 白桦
2021/7/13
从白桦转录组数据库中筛选出45条AP2/ERF家族蛋白,对其蛋白序列进行生物信息学分析和系统进化分析。结果表明,白桦AP2/ERF蛋白除了分为AP2、ERF、RAV和soloist家族外,还有2条蛋白不属于这些家族;不同组别白桦AP2/ERF蛋白在理化性质上存在差异;白桦AP2/ERF蛋白都含有磷酸化位点,但含有磷酸化位点的数量和种类上都有差异;白桦AP2/ERF蛋白大都定位在细胞核里,它们主要在...
基于GEO芯片数据的肝癌关键生物标志物的筛选与鉴定及生物信息学分析
肝癌 差异表达基因 生物信息学分析
2021/3/22
基于生物信息学分析方法，获取与正常肝组织具有表达差异、且与肝癌患者生存、病理参数密切相关的肝癌基因。方法 通过GEO 数据库获取三组肝癌芯片表达谱，利用GEO2R 鉴定肝癌组织与正常肝组织具有表达差异的基因；应用DAVID 数据库，富集差异表达基因；使用STRING 数据库及Scytoscape 软件，构建核心差异基因的蛋白质互作网络（protein-protein interaction，PPI...
广东省农业科学院农业生物基因研究中心创新平台：生物信息学研究平台（图）
广东农科院 基因中心 创新平台 生物信息学
2023/5/11
生物信息学平台，是由超级计算服务器（简称“超算服务器”）和生物信息分析软件技术等组成的数据高速存取、编辑和分析的信息数字化平台。该平台主要利用生物信息技术，对生物数据包括测序数据，基因组学、蛋白组学和生物芯片研究产生的数据进行序列比对、特异探针设计、基因功能预测、蛋白质结构功能域预测等深入、系统地分析挖掘，揭示数据背后所蕴含的科学逻辑规律和生物学意义。
目的 分别克隆灰毡毛忍冬野生型与湘蕾型ACS3基因，并进行生物信息学和表达模式分析。方法 筛选灰毡毛忍冬转录组数据库中与ACS蛋白同源性较高的Unigene序列，设计引物，利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）及RACE技术对该Unigene进行全长克隆；用生物信息学软件分析蛋白的理化性质、结构域和同源性等特性；借助qRT-PCR检测1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶（ACS3）基因在不同品种、不同花...
目的 从甘草Glycyrrhiza uralensis中克隆1个新的NADPH细胞色素P450还原酶基因（GuCPR，登录号：MH401048）并进行生物信息学分析。方法 提取甘草根部总RNA后逆转录为cDNA，通过转录组数据库筛选得到GuCPR基因全长，利用NCBI ORF finder得到其开放阅读框并翻译得氨基酸序列，设计引物进行PCR扩增，构建克隆重组质粒。利用生物信息分析预测蛋白性质、结...
目的 克隆霍山石斛β-1，4-木糖基转移酶（IRX9）基因，并进行生物信息学、密码子偏性分析。方法 根据霍山石斛转录组数据获得的IRX9基因序列设计特异性引物，通过RT-PCR技术得到IRX9基因cDNA的全长序列，并进行生物信息学分析。结果 霍山石斛IRX9基因全长1 553 bp，包含一个长度为1 047 bp的开放阅读框，编码348个氨基酸，理论相对分子质量为39 350，等电点为7.26，...
has-miR-155-5p靶基因预测及其生物信息学分析
miR-155-5p 靶基因 生物信息学 信号通路
2018/9/21
深入了解miR-155-5p参与的生命过程和疾病类型,为后续的功能研究提供理论依据。对miR-155-5p进行生物信息学分析发现,已知的其成熟序列在不同物种间高度保守；基因本体论(GO)分析发现其分子功能显著富集于杂环化合物结合、核酸结合等,生物学过程主要富集于细胞大分子代谢、生物调节和有机物代谢等；京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现其显著富集于癌症通路、MAPK和FoxO信号通路等。分...
拟南芥HCN诱导基因AT2G15020的生物信息学分析及功能初探
生物信息学分析 氰化氢 光响应 胁迫适应
2018/11/29
我们前期研究发现拟南芥AT2G15020基因受氰化氢(HCN)显著诱导, 该基因编码一个未知功能蛋白。为探究该基因的功能, 本研究对AT2G15020基因进行了生物信息学分析, 包括同源序列比、启动子分析、蛋白理化性质及蛋白互作预测等。生物信息学分析结果表明, 与该基因同源蛋白均为未知功能蛋白, 但该基因启动子中存在较多光响应元件, 与其互作蛋白也显示其与光响应或光信号调节有关。不同光照强度和盐胁...
通过构建藏红花开花前2 d与开花日两个不同时期柱头的小RNA文库并进行高通量测序, 分别获得3 711 809和2 303 043条序列。借助生物信息学的方法, 共鉴定出164条保守的miRNA。其中, 随开花过程下调表达和上调表达的miRNA分别是71和46条。靶基因预测及功能富集分析显示它们可能参与了硫辛酸生物合成、细胞程序性凋亡、花粉细胞的分化、脱落酸介导的信号途径等生物过程。本文筛选的藏红...
旨在克隆绵羊 TGFβ2（Transforming growth factor-β2）基因CDS，解析其序列及编码蛋白的生物学特性，为绵羊生产利用提供理论基础。采用PCR技术克隆获得 TGFβ2 基因的CDS，并进行生物信息学分析。结果表明：绵羊 TGFβ2 基因的CDS长度为 1 329 bp，编码 442 个氨基酸；其可变剪切体 TGFβ2-AS1和 TGFβ2-AS2 由于CDS部分缺失分别...
丹参酮合成相关的候选基因CYP76AK5克隆及生物信息学分析
丹参 丹参酮 生物合成 SmCYP76AK5 差异表达
2017/12/5
基于丹参基因组和转录组筛选、克隆及分析丹参酮合成途径候选的CYP450编码基因。方法：设计引物克隆SmCYP76AK5编码基因，通过MEGA软件构建系统进化树并结合实时定量PCR分析其在根不同组织（周皮、韧皮部、木质部）、根、茎、叶、花中的差异表达；最后利用在线生物信息学工具分析其理化性质，预测其二级结构、保守结构域等。结果：系统进化树分析表明SmCYP76AK5属于CYP71clan；基因差异表...
巴西橡胶树α-微管蛋白HbTUA2基因的克隆、表达及生物信息学分析
橡胶树 α-微管蛋白 逆境胁迫 表达分析
2018/12/29
微管蛋白是微管的重要组成部分, 参与维持细胞骨架的稳定及延伸。本研究采用RT-PCR和RACE技术从巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)中克隆到一个α-微管蛋白基因, 命名为HbTUA2 (GenBank登录号: KX809698)。该基因cDNA全长1 940 bp, 其中开放阅读框1 353 bp, 编码含450个氨基酸残基的蛋白质序列。HbTUA2与其他植物TUA蛋白高度同源,...