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适应性选择是影响人类表型发展和分化以及种族人群之间疾病易感性差异的主要因素之一。基因组中非编码元件占据超过98%的区域，和蛋白编码元件一样，非编码元件在表型塑造过程中发挥重要作用。2024年来，人类基因组范围的非编码调控元件如增强子、启动子得到了系统的鉴定与注释，然而这些非编码调控元件在人群适应性选择中所扮演的角色仍缺乏系统的研究。
国家纳米中心关于递送基因编辑系统的研究获进展（图）
基因编辑 纳米机器 应用化学
2023/11/21
2023年11月20日，中国科学院国家纳米科学中心研究员丁宝全课题组在利用DNA纳米机器递送基因编辑系统进行靶向基因治疗方面取得了重要进展。相关研究成果以A DNA Origami-Based Gene Editing System for Efficient Gene Therapy in Vivo为题，发表在《德国应用化学》上。
中国科学院生物物理研究所薛愿超团队揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制（图）
薛愿超 基因 细胞 元件
2023/11/20
2023年7月12日，中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《Nature》杂志在线发表了题为"Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity"的研究论文。转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中，增强子（enhancer）作为调控基因转录的重要元件，往往需要通过远距离染色质环化与目标启动子（prom...
高等真核生物基因组存在复杂的三维空间结构，在不同尺度下形成如染色质环（Chromatin loops）、拓扑关联结构域（TADs)、活性/非活性染色质区室（A/B compartments)和染色体域(Chromosome territories)。这些结构对于基因组稳定性的维持、基因表达的精准调控具有重要作用，从而影响细胞命运决定和表型建立。经典的基因组三维结构主要是通过染色体构象捕获（3C）及...
中国科学院植物所科研人员开发出简便高效的多基因编辑工具包（图）
多基因编辑 编辑元件
2023/6/13
目前，CRIPSR/Cas9基因编辑技术已广泛应用于植物多基因编辑和多基因突变体的创制。在转基因植物中，CRISPR构建会持续发挥编辑作用，导致新的突变，人们陆续开发了一些剔除转基因植物中CRISPR构建的方法。但是对于多基因编辑而言，为了保证靶位点被持续编辑直至发生突变，一般采用稳定转化的方法来将基因编辑元件表达盒稳定插入到基因组中，以求编辑元件持续表达。由于针对每个特定基因的gRNA效率不同，...
2022年10月1日，华中科技大学刘钢教授团队，在Materials Today Bio期刊上发表了题为：Versatile nanorobot hand biosensor for specific capture and ultrasensitive quantification of viral nanoparticles的研究论文。
2022年7月13日，精密测量院徐富强研究团队基于新型基因编码生物磁共振成像技术，首次实现特异类型神经元网络的在体检测。相关成果在影像学顶级期刊《神经影像》(Neuroimage)上发表。大脑包含上千亿个神经元，通过数以万亿个突触建立起复杂的神经网络用于细胞间通信。神经网络的复杂性对于处理大脑中的信息和指导行为至关重要。因此，神经连接的阐明和可视化对于解析大脑功能和疾病至关重要。基于病毒的脑网络示...
中国科学院生物物理研究所研究发展出新型三维基因组成像系统（图）
中国科学院生物物理研究所 新型 三维基因组 成像系统
2017/4/13
2017年4月7日，Cell Research杂志发表了中科院生物物理研究所刘光慧课题组和徐涛课题组，以及中科院动物研究所曲静课题组合作的题为"Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System" 的研究论文（封面故事）。该研究发展了一种新型三维基因组活细胞成像工具TTALE，...
基于太赫兹波段内的光谱分析技术以及主成分特性分析与反向前馈神经网络建模,提出了一种转基因大豆鉴别方法.从光谱数据中提取累计方差贡献率达到97.582%的前8种主成分因子,并将其作为输入源导入神经网络模型,通过剔除冗余数据、降低数据维数,所建立的神经网络模型能准确识别校验集.该方法可以实现转基因大豆的快速、无损检测,在农业安全领域有广泛的应用前景.
运用太赫兹时域光谱技术对8种转基因棉花种子进行了探测研究.测量了转基因棉花种子在0.3～1.5 THz频率范围的特征吸收谱,基于光谱分析,对比了8种转基因棉花种子吸收光谱的异同,并采用主成分分析法对其做了定性分析,得到了光谱分析的相关数据.提取了三种主成分因子,前三种主成分的累计方差贡献率达到了71.537%,从主成分得分图中可以明显区分不同类别的转基因棉花种子.太赫兹时域光谱技术能够实现对转基因...
建立了以交联羧甲基魔芋葡甘聚糖(CCMKGM)为微柱预富集-GFAAS测定转基因水稻糙米中痕量铅和镉的新方法。考察了溶液的pH值、样品流速和体积、洗脱液的浓度和体积及共存离子干扰等因素对CCMKGM微柱吸附重金属的影响。结果表明：在优化条件下，方法用于富集、测定转基因水稻及亲本糙米中Pb和Cd的检出限分别为0.11和0.002 μg·L-1;测定大米标准参考物质中Pb和Cd的含量，结果与标准参考值...
转基因水稻及其亲本叶片的可见/近红外光谱分析
可见/近红外光谱 转基因水稻叶片 叶绿素含量 连续投影算法 偏最小二乘-支持向量机
2012/4/12
应用可见/近红外光谱技术实现了转基因水稻叶片的快速识别和叶绿素含量(SPAD)的快速检测。建立偏最小二乘-支持向量机(LS-SVM)鉴别模型，校正集的正确率为100%，同时应用连续投影算法(SPA)提取有效波长，建立SPA-LS-SVM鉴别模型，只用了全变量的0.3%进行建模，其预测集的正确率达到87.27%。在定量分析中，各模型的最优结果均来自经过正交信号校正(OSC)的光谱数据，经过SPA处理...
反射光谱分析可为植物叶片生理学过程、叶片表面及内部生化组分、结构特征等提供丰富信息。本文以转基因大麦及其原始栽培种为材料，基于单叶反射光谱检测研究了转基因大麦的反射光谱特征及指数的变化。研究结果表明，将不同大麦叶片反射率配对求得反射率比值曲线易于探查出不同大麦品系间反射光谱差异，且转基因大麦与传统对照差异较大的区域主要集中在650~700 nm的红谷及红边位置附近，该波段的光谱反射率可能对外源基因...
针对现有寻优算法存在的重复计算问题,提出了基于递推遗传的模糊3-划分熵多阈值荧光原位杂交(Fluorescence in Situ Hybridization,FISH)基因提取算法来提高用模糊划分熵算法提取多阈值FISH基因的效率。采用迭代验证法确定隶属度函数窗宽,并使用附加边界条件及灰度权重的隶属度函数对图像进行模糊3-划分。为了提高阈值寻优的效率,引入递推算法将模糊熵的计算转化为递推过程,并...