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美国企业拟开发新一代基因编辑工具
基因编辑工具 拜耳医药 基因突变
2024/2/29
Moderna 曾表示，双方的合作不是为了仅仅敲除一个基因、修改一个碱基，或是修复一个基因突变，而是要创造新的基因编辑工具，让科学家能有更好的工具可用，让医生能更好地治疗遗传疾病。
英国成立功能基因组学实验室
英国 功能基因组学 实验室
2024/1/17
近日，英国科研与创新署（UKRI）宣布，医学研究理事会（MRC）、剑桥大学米尔纳治疗研究所（MTI）等联合成立功能基因组学实验室，作为英国卓越研究中心和国家资源中心，汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识，加速新药物和诊断方法的研究发现，巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。
在有丝分裂过程中，染色体向子细胞的正确分配依赖于在染色体着丝粒上组装的动粒蛋白复合物。动粒和纺锤体微管的附着受到纺锤体组装检查点(Spindle assembly checkpoint，SAC)严格监控，以延迟细胞进入后期，直到所有动粒正确附着。拟南芥KNL1仅在两个功能域上与动物相关，其余氨基酸序列几乎没有同源性，所以植物同源物能否在SAC信号传导中起作用？高度分化的KNL1家族蛋白在不同植物谱...
美国绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱
美国 小鼠全脑 单细胞 空间转录组图谱
2024/1/15
美国麻省理工学院和布罗德研究所的科研人员绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱，为深入理解大脑结构与功能提供了重要基础。该团队基于109万个高质量空间分辨单细胞基因表达定义出小鼠大脑更精细的组织区域，绘制出的大规模分子空间图谱囊括了超100万个细胞及其基因表达特征、空间坐标、分子细胞类型、分子组织区域类型，以及遗传操作可及性。相关研究成果发表于《Nature》期刊。
近年来，随着测序技术和算法的开发，大量动植物基因组被陆续测序和组装，但是基因组组装质量参差不齐，存在不同程度的组装错误，影响了后续的相关研究。高质量的参考基因组对于基因的精准注释和功能研究以及比较基因组学和调控元件的挖掘等至关重要。虽然目前已经有一些基因组组装质量评估的方法，然而它们大多数仅提供了一个概述性的评估值，没有能够针对特定区域设置特定碱基给出精准度的评估。
Journal of Agricultural and Food Chemistry|海南大学李海燕团队基于比较蛋白质组学解析了液泡膜转运蛋白对盐碱胁迫耐受的正调控作用机制（图）
蛋白质组学 液泡膜 转运蛋白 盐碱胁迫 耐受正调控
2023/12/15
大豆（Glycine max (L.) Merrill）起源于我国，是世界第一大植物蛋白质和第二大食用植物油脂来源，在国民经济发展和保障国家粮食安全中具有重要地位。值得注意的是，随着人民生活水平的提高，豆粕和豆油需求不断增加，大豆进口量连年增长，自给率仅为15%左右，已成为我国大豆在国际竞争中“卡脖子”的关键因素。然而，大豆作为中度盐敏感型作物，当土壤中盐碱度超过5 dS/m时，大豆产量即可降低5...
瑞典研究揭示葡萄糖转运蛋白转运过程
瑞典 葡萄糖 转运蛋白
2024/1/15
瑞典国家生命科学实验室（SciLifeLab）研究团队成功构建了迄今为止最全面的葡萄糖转运蛋白（GLUT）转运周期，并确定了GLUT蛋白对脂质的敏感性，对于理解人类生理和代谢的基本机制具有重要意义。研究成果发表在《自然》（Nature）。
中国林业科学研究院华北林业实验中心开发出精准性高的小型化Cas9基因编辑工具（图）
精准性高 小型化 Cas9基因 编辑工具
2023/11/20
RNA引导的CRISPR-Cas9系统被广泛应用于哺乳动物细胞的基因组编辑，在基因遗传病的治疗中展现出巨大的发展潜力。限制基因编辑工具应用的主要因素包括编辑活性、PAM限制、蛋白大小、特异性问题等。识别NGG PAM的SpCas9编辑活性高，是最常用的基因编辑工具。但SpCas9特异性较差，使用时往往伴随大量的有害突变。且当SpCas9用于基因治疗时，SpCas9太大无法被单个AAV递送。SaCa...
韩国DNA纳米技术可将DNA像纸一样折叠
韩国 DNA纳米技术 DNA 折叠
2024/1/15
韩国首尔大学团队开发出DNA纳米技术，可以像折纸一样折叠或展开厚度为人类头发千分之一的DNA纳米结构。
科学家揭示靶向蛋白CypA药物对痘病毒抵御机制
靶向蛋白 CypA药物 痘病毒 抵御机制
2024/1/15
近期，来自英国牛津大学、剑桥大学和皮尔布赖特研究所的研究团队在《Nature》期刊合作发表了题为“TRIM5α restricts poxviruses and is antagonized by CypA and the viral protein C6”的研究论文，发现靶向细胞蛋白的免疫抑制药物或治疗其他病毒感染的药物也能限制痘病毒复制和传播。
科学家绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱
细胞游离 DNA单分子 全基因组 突变图谱
2024/1/15
体细胞突变是肿瘤发生的标志，可用于癌症的无创诊断。美国约翰·霍普金斯大学医学院绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱，用于癌症无创检测。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Single-molecule genome-wide mutation profiles of cell-free DNA for non-invasive detection of can...
科学家建立无细胞因子培养系统实现造血干细胞长期体外扩增
无细胞因子 培养系统 造血干细胞 体外扩增
2024/1/16
造血干细胞(Hematopoietic stem cells, HSCs)是一种能够自我更新的罕见的骨髓细胞群，可在移植后重建整个造血系统，是一种治疗血液疾病的细胞疗法。脐带血是移植造血干细胞的一个可靠来源，但其中造血干细胞含量较少，体外扩增的程度有限，成功植入和持久的造血重建难度较大。因此，进一步优化造血干细胞体外扩增的培养条件有助于研发更有效的血液疾病治疗方法。
科学家利用大规模基因组关联分析确定青光眼风险位点
基因组 关联分析 青光眼 风险位点
2024/1/16
青光眼是导致不可逆失明的主要原因，是一种高度遗传相关的人类疾病。过去的全基因组关联研究已经为最常见的原发性开角型青光眼确定了100多个风险位点。澳大利亚昆士兰医学研究院伯格霍夫医学研究所利用大规模、多特征全基因组关联分析确定了数百个青光眼风险位点。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Large-scale multitrait genome-wide associ...
2023年7月17日，由中国科学技术部和澳大利亚工业科学和资源部共同资助，中国科学院广州能源研究所与澳大利亚昆士兰科技大学双边牵头成立的“中国-澳大利亚生物燃料与生物精炼联合研究中心”（以下简称“中心”）揭牌仪式在广州和布里斯班两地以视频连线形式举行。
科学家利用迁移学习建立计算大模型预测基因调控研究
迁移学习 计算大模型 预测基因调控
2024/1/16
基因网络绘制需要大量转录组数据用于建立基因之间的联系，这也阻碍了一些数据有限场景（如罕见病）等研究。最近，利用迁移学习的机器学习技术在自然语言和计算机视觉等领域带来了变革性进展，其通过在大规模通用数据集上进行大模型预训练，而后迁移到数据量有限的特定任务进行微调。美国博德研究所等研究团队提出了一个深度学习模型Geneformer可实现特定生物学任务与背景中的预测。该研究成果于近日发表在《Nature...