搜索结果: 1-15 共查到“园艺学 序列分析”相关记录38条 . 查询时间(0.229 秒)
为了明确近期新西兰报道的侵染猕猴桃的新病毒——猕猴桃病毒1（Actinidia virus 1，AcV-1）在四川地区猕猴桃上的发生情况及其分子特性，采用RT-PCR对来自四川6个地区疑似感染病毒的90份猕猴桃主栽品种‘红阳’和‘金果’的叶片样品进行检测。结果表明，22份样品为AcV-1阳性，检出率为24.4%。将获得的5个AcV-1分离物和已报道的新西兰分离物K75的外壳蛋白（coat prot...
在山东泰安采集到两个表现黄花叶症状的丝瓜和南瓜样品中检测到小西葫芦黄花叶病毒（Zucchini yellow mosaic virus，ZYMV）；通过RT-PCR和RACE方法获得了两个分离物的全基因组序列，分别命名为CN:Cm:17（丝瓜分离物）和CN:Lc:17（南瓜分离物）。结果表明，CN:Cm:17和CN:Lc:17 基因组除Poly（A）尾巴外，分别含有9 593和9 591个核苷酸（...
柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析
柑橘 柑橘鳞皮病毒 全基因组 系统发育分析
2018/11/5
运用转录组测序和RT-PCR方法克隆测定了柑橘鳞皮病毒（Citrus psorosis virus，CPsV）3个分离物CHN-1、CHN-2和CHN-3的全基因组。序列分析结果表明，CHN-1、CHN-2和CHN-3的基因组全长分别为11 282、11 279和11 278 nt，均包含4个开放阅读框。CHN-1、CHN-2和CHN-3之间的核苷酸相似性为93.48% ~ 95.98%，编码氨基...
通过RT-PCR结合RACE技术扩增到苹果茎沟病毒（Apple stem grooving virus，ASGV）吉林沙果分离物（ASGV-JLSG）全长基因组（登录号：FM616381），共含有6 496个核苷酸（nt），编码两个彼此重叠的开放阅读框（Open reading frame，ORF）。ORF1（37 ~ 6 354 nt）编码1个241 kD的多聚蛋白，含有甲基转移酶（Methyl...
基于SRK 基因序列分析的甘蓝自交不亲和系单倍型鉴定及验证
甘蓝 自交不亲和性 S 单倍型 SRK 基因
2018/4/4
根据甘蓝自交不亲和性雌蕊决定因子SRK 基因保守序列设计简并引物，克隆23 份甘蓝自交不亲和系SRK 基因并测序。利用NCBI 数据库进行克隆序列的Blast 比较以及序列之间的相似性分析，初步确定23 份甘蓝自交不亲和系分属于SRK3、SRK7、SRK8、SRK16、SRK28、SRK36、SRK45、SRK46、SRK58、SRK68 等10 种S 单倍型。其中有5 份甘蓝自交不亲和系属于SR...
柑橘黄化脉明病毒基因组的长链RT-PCR扩增、克隆及序列分析
柑橘黄化脉明病毒 RACE 全长cDNA 长链RT-PCR
2018/5/21
为了建立柑橘黄化脉明病毒（Citrus yellow vein clearing virus，CYVCV）基因组长链RT-PCR扩增体系，构建其全长cDNA克隆，为深入了解CYVCV分子特性及其致病机理奠定基础。根据GenBank中CYVCV基因组序列和5′ RACE扩增结果设计引物。以感染CYVCV的代代酸橙（Citrus aurantium ‘Daidai’）植株总RNA为模板进行长链RT-P...
为探究绒毛白蜡smh1 端粒结合蛋白基因在端粒中的作用以及在植物生长发育过程中的调控机制，进行绒毛白蜡smh1 端粒结合蛋白基因克隆及分析。以绒毛白蜡幼苗为试材，Illumina HiSeq 2000 高通量测序技术获得的绒毛白蜡转录组Unigene 数据为基础，采用RT-PCR方法克隆绒毛白蜡smh1 基因编码区序列并进行生物信息学分析。结果表明：从绒毛白蜡叶片中成功克隆出一个smh 类端粒结合...
黄瓜上甜瓜黄斑病毒寿光分离物的初步鉴定及序列分析
甜瓜黄斑病毒 黄瓜 RT-PCR 序列分析
2018/5/2
在山东寿光黄瓜保护地种植区采集到疑似感染甜瓜黄斑病毒（Melon yellow spot virus，MYSV）的黄瓜病叶，采用RT-PCR 对其进行检测，将扩增产物连接到pEASY -T1 Simple 克隆载体后进行测序，结果显示目的片段的大小为505bp，与预期结果一致；序列同源性比对分析结果表明，黄瓜上MYSV 寿光分离物与中国三亚的MYSV-Sanya 分离物（甜瓜-GQ397254）和...
黄瓜上甜瓜黄斑病毒寿光分离物的初步鉴定及序列分析
甜瓜黄斑病毒 黄瓜 RT-PCR 序列分析
2018/5/8
在山东寿光黄瓜保护地种植区采集到疑似感染甜瓜黄斑病毒（Melon yellow spot virus，MYSV）的黄瓜病叶，采用RT-PCR 对其进行检测，将扩增产物连接到pEASY -T1 Simple 克隆载体后进行测序，结果显示目的片段的大小为505bp，与预期结果一致；序列同源性比对分析结果表明，黄瓜上MYSV 寿光分离物与中国三亚的MYSV-Sanya 分离物（甜瓜-GQ397254）和...
辣椒CaCOI1 基因的克隆、表达及其序列分析
辣椒 CaCOI1 克隆 表达
2012/10/17
利用RT-PCR技术从辣椒中克隆到基因CaCOI1，该基因编码的蛋白质由603个氨基酸残基组成，蛋白质的分子量为68.35 kD，等电点是6.32。在蛋白质N–端有1个F-box结构域，C–端有6个富含亮氨酸结构域。二级结构分析表明，CaCOI1蛋白分子中，α–螺旋、β–折叠、β–转角和不规则卷曲分别为51.41%、13.76%、5.80%和29.03%。CaCOI1蛋白的平均亲水系数为–0.14...
利用柑橘黄龙病菌的特异引物，对采自云南红河州建水县和个旧市、玉溪市华宁县、大理州宾川县、昭通市盐津县、德宏州瑞丽市以及保山市隆阳区等地共151个疑似柑橘黄龙病样品进行了黄龙病菌的检测，其中建水县有5个样品检测结果为阳性，检出率为33.3%；个旧市、华宁县和宾川县各有1个样品为阳性，检出率分别为8.3%，5.5%，6.7%；而昭通、德宏和保山的样品均为阴性。表明黄龙病在云南的主要柑橘产区建水、个旧、...
南瓜CmNAC基因片段的克隆与序列分析
南瓜 CmNAC基因片段 克隆 序列分析
2011/8/30
NAC转录因子是特异存在于植物中具有多种生物功能的新型转录因子，其家族成员N端含有保守氨基酸序列，C端为高度变异的转录激活区。本项研究以南瓜叶片为材料，根据甘蓝型油菜NAC1、番茄NAC、辣椒NAC保守结构域设计一对简并引物，采用RT-PCR方法扩增得出长度约为440 bp大小的DNA片段，将其克隆至pMDl9-T载体上，而后对重组克隆进行测序，用BLAST和DNAMAN软件对核酸及氨基酸序列进行...
甘薯和巴西牵牛18S rRNA基因的克隆和序列分析
甘薯 巴西牵牛18S rRNA基因 克隆序列分析
2011/9/7
为甘薯和侵染甘薯病毒的基因表达研究提供内参基因序列信息。【方法】分别以‘商薯19’、‘北京553’两甘薯品种和巴西牵牛的基因组DNA为模板，利用PCR方法克隆甘薯和巴西牵牛18S rRNA基因序列。【结果】测序结果表明，获得的供试两甘薯品种和巴西牵牛的18S rRNA基因序列长度均为1630 bp；序列比对结果表明，甘薯和巴西牵牛与裂叶牵牛、烟草等双子叶植物的18S rRNA基因相应序列的一致性均...
桃PGIP基因及cDNA的克隆及序列分析
桃 PGIP基因 克隆 序列分析
2009/12/7
通过PCR扩增了桃的PGIP基因及cDNA序列，并进行了序列之间的比对及分析。结果表明，桃的PGIP基因全长1 092 bp，而其cDNA序列只有1 045 bp，PGIP基因中含有一段长147 bp的内含子，且内含子符合GTAG规律。这与其他核果类植物的PGIP基因构成基本相同。其基因序列与GenBank中已登录的3个桃以及其他核果的序列比对，其同源性达92%～99%；与苹果、梨和大桉的同源性...
桃PGIP蛋白基因片段的克隆、序列分析及在大肠杆菌中的表达
桃 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 基因克隆 序列分析 基因表达
2009/12/3
【目的】克隆桃（Prunus persica）多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白（polygalacturonase-inhibiting protein，PGIP）基因，并进行原核表达研究。【方法】根据李属植物pgip保守区域设计1对特异引物，以桃叶片总RNA为模板，通过RT-PCR获得了约1 kb的cDNA片段，T/A克隆后进行序列测定，并对该序列进行分析。随后将该蛋白成熟肽cDNA片段克隆到原核表达载...